In der Bildungsstadt steht das Daihasei-Festival vor der Tür, dafür muss allerdings noch jemand gefunden werden, der den Sportler-Schwur vorträgt. Da entschieden wurde, dass einer der sieben Level 5er das erledigen soll, wird nach einem geeigneten Kandidaten gesucht. Die Suche stellt sich jedoch als knifflig heraus.

Das Daihasei-Festival steht vor der Tür. Die Entscheidung ist gefallen und so tragen Shokuhou Misaki und Sogiita Gunha den Sportler-Schwur vor. Danach beginnen die Wettkämpfe, an denen Kuroko aufgrund ihrer Verletzung leider nicht teilnehmen kann. So muss sie sich damit begnügen, ihre Onee-sama aus der Ferne anzuhimmeln.

Der nächste Wettkampf, an dem Misaka teilnehmen sollte, steht kurz bevor. Dabei treten Teams, bestehend aus 30 ausgewählten Schülern der jeweiligen Schulen, gegeneinander an. Aufgrund einer Verwechslung nimmt allerdings eine der Sisters an Misakas Stelle teil. Zudem scheint mehr vor sich zu gehen als das vordergründige Daihasei-Festival.

Während Misaka mit Kuroko das Daihasei-Festival genießt, versuchen Saten und Uiharu weiter Shadow Metal aufzuspüren. Die Anzeichen verdichten sich, dass etwas Mysteriöses vor sich geht und zu allem Übel erfährt Misaka, dass die Sister die Sportklamotten, die sie von Wannai borgte, nie zurückgab. Ein weiteres Mysterium, dem Misaka auf den Grund zu gehen versucht.

Misakas Suche nach ihrer Sister findet ein jähes Ende, als sie unter die Aufsicht von Shokuhou Misakis Clique gestellt wird. Und zu allem Übel kann sie sich nicht einmal an ihre besten Freundinnen wenden, die unter dem Einfluss von Mental Out zu stehen scheinen. In ihrer Not bleibt ihr nichts anderes übrig als Kongou Mitsuko, ihre Partnerin bei den Wettkämpfen, um Hilfe zu bitten, jedoch auf das Risiko hin, auch sie in Gefahr zu bringen.

Während Saten Kongou ins Krankenhaus bringt, konfrontieren Wannai und Awatsuki den mysteriösen Fremden mit den Roboterhunden. Anderorts versucht Misaka nach wie vor, Shokuhous Clique abzuschütteln. Als sie Zeuge wird, wie Kongou ins Krankenhaus gebracht wird, ist der Spaß für sie jedoch endgültig vorbei.

Während Misaka versucht, Babas LKW zum Ort zurückzuverfolgen, an dem sie ihre Sister gefangen halten, kehrt Saten mit der Katze zur Psychometristin zurück. Anderenorts trifft Uiharu auf Mikotos Mutter, doch die beiden scheinen beobachtet zu werden. Als Saten Misaka mitteilt, was sie rausgefunden haben, wird Misaka von einer mysteriösen Gestalt bei ihrem Telefonat unterbrochen.

Durch die Wiederherstellung der Daten erfährt Misaka von Shokuhous möglichem Unterschlupf. Auf dem Weg zu diesem fängt Shokuhou sie allerdings ab, bei welcher Gelegenheit Misaka sie zur Rede stellt. Kuroko und Saten verfolgen derweil weiter die Spur der mysteriösen Unbekannten, die Uiharu und Misakas Mutter als Geisel genommen hatte. Kurze Zeit später wacht Uiharu verwirrt im Ruheraum der Judgment-Zweigstelle auf.

Ihre Ermittlungen auf der Spur der mysteriösen Unbekannten führen Kuroko und Uiharu zum Kontrollzentrum der Bildungsstadt-Datenbank. Da jedoch Zivilisten dort keinen Zutritt haben, bleibt Saten nichts anderes übrig, als irgendwo die Zeit totzuschlagen. Und natürlich bringt ihre Neugierde sie mal wieder in allerhand Schwierigkeiten. Andernorts stürmen Misaka und Shokuhou jede auf ihre eigene Art die Convention, auf der sich Kihara Gensei aufhalten soll.

Nachdem Gensei das Misaka-Netzwerk unter seine Kontrolle gebracht hat, befindet sich Misaka nun im Prozess der Umwandlung zu einem Level 6er. Während Shokuhou Misaki weiter Gensei auf den Fersen bleibt, läuft sie einem alten Bekannten über den Weg: Kamijou Touma. Den spannt sie natürlich direkt mit ein, doch dabei bleibt es nicht, denn kurz darauf treten zudem Kuroko und Sogiita Gunma auf den Plan.

Gunma und Touma stürzen sich in den Kampf gegen eine Misaka, deren Kräfte außer Rand und Band geraten sind. Ihnen wird jedoch schnell bewusst, dass sie diese höchstens hinhalten können. Andernorts konfrontiert Misaki denjenigen, der hinter allem zu stecken scheint: Kihara Gensei. Während Kuroko, Uiharu und Saten derweil nach wie vor Kouzaku Mitori auf den Fersen sind.

Während draußen Misaka weiter auf dem Weg zum Level 6er ist, durchsucht Kuroko das Gebäude, in dem sie Kouzaku Mitori vermutet, kann sie jedoch nirgends auffinden. Andernorts scheint Shokuhou all ihre Pläne ausgespielt zu haben und nun Gensei wehrlos ausgeliefert zu sein. Dieser verliert keine Zeit und nimmt ihr den Code zur Aufhebung der Limitierungen Exteriors ab, doch Shokuhou wäre nicht Shokuhou, wenn sie nicht noch ein letztes Ass im Ärmel hätte.

Mit Shokuhous Sieg über Gensei ist sein Plan, Misaka zu einem Level 6er zu machen, endgültig gescheitert. Misakas Macht ist jedoch nach wie vor außer Rand und Band. Gunha und Touma müssen all ihre Kräfte aufbieten, um sie womöglich doch noch zu retten und um zu verhindern, dass die gesamte Bildungsstadt dem Erdboden gleichgemacht wird.

Von Kuroko besiegt liegt Mitori in der Kanalisation und denkt an ihre Zeit mit Dolly zurück, als Misaki auf einmal neben ihr auftaucht. So treffen die beiden, die Dolly am besten kannten, zum ersten Mal aufeinander. Andernorts feiern die Judgment-Mädchen und Misaka Kurokos vollständige Genesung.

Über Hokaze Junko, die zu Shokuhous Clique gehört, erfährt Misaka von etwas, das sich Indian Poker nennt, was einem erlaubt, die Träume anderer zu sehen. Derweil erfahren Kuroko und Uiharu von einer App, die Datum und Uhrzeit von Zwischenfällen anzeigt, wenn man mit der Kamera den entsprechenden Ort fokussiert. Der Clou dabei ist, dass sie nicht nur Zwischenfälle anzeigt, die sich bereits ereignet haben, sondern auch zukünftige.

Miyama bietet Kuroko die Möglichkeit an, Zwischenfälle zu verhindern, bevor sie sich überhaupt zutragen. Doch Kuroko vermutet, dass Miyama ihnen irgendetwas verheimlicht. Bald schon taucht Miyama mit einem Vorfall auf, in den mehrere Personen nahezu gleichzeitig verwickelt zu sein scheinen.

Bei einem Händler für Indian-Poker-Karten begegnen sich Kinuhata und Misaka. Beide sind erst relativ uninteressiert daran, doch als sie von einer Karte hören, die verspricht, den Brustumfang wachsen zu lassen, ändert sich das schlagartig. Nachdem bei einem Malheur die fragliche Karte verloren geht, beschließen sie zusammenzuarbeiten.

Während Uiharu und die anderen mit der App beschäftigt sind, welche die Zukunft vorhersagt, begegnet Saten im Supermarkt Frenda. Als Saten tags darauf die Straße entlangschlendert, wird sie von Unbekannten entführt. Frenda, die das alles mitansieht, beschließt, Saten zu retten.

Nachdem Frenda Saten aus den Klauen ihrer Entführer gerettet hat, werden die beiden nun von SCHOOLs Sniper gejagt. Frenda fällt es allerdings schwer auch nur zu erkennen, von woher die Schüsse fallen. So müssen die beiden sich einen Trick einfallen lassen, um den Scharfschützen aus seiner Reserve zu locken.

Während sich Kuroko und Uiharu sowie der Rest von Judgment und Anti-Skill näher mit Indian Poker befassen, wird Misaka von Shokuhou abgefangen. Shokuhou erzählt ihr von Kuriba Ryouko, die mittels Cyborgtechnologie erfolgreich in zwei Teile aufgespalten wurde, sowie von der Forschungseinrichtung, in welcher sie sich aufhalten und in die Misaka einsteigen soll.

Misaka und Shokuhou kommen der Wahrheit hinter dem Doppelgänger sowie Indian Poker auf die Spur. Anderenorts begeben sich Scavanger auf die Jagd nach dem Doppelgänger, allerdings macht ihnen dieser mehr Probleme als erwartet. Und zu allem Übel kreuzen sich ihre Wege nach der bitteren Niederlage gegen Accelerator abermals mit einem Level 5er.

Misaka nimmt die Verfolgung des Doppelgängers auf, der in Richtung eines dicht besiedelten Gebietes unterwegs ist. Während Leader klar ist, dass die einzige Chance für sie, ihre Mission zu erfüllen, ist, Misaka auf ihre Seite zu ziehen. Zu ihrem Schrecken muss sie allerdings feststellen, dass Misaka mit Shokuhou gemeinsame Sache macht, deren Fähigkeit problematisch für Leader werden könnte.

Kuroko, die im Wohnheim die Stellung hält, hört in der Ferne ein lautes Krachen und befürchtet, dass ihre Onee-sama etwas damit zu tun haben könnte. Was natürlich der Wahrheit entspricht, denn Misaka steht nun dem Doppelgänger gegenüber und wappnet sich für einen Kampf der Titanen. Allerdings ist es auch ihr nach wie vor ein Rätsel, was der Doppelgänger wirklich beabsichtigt.

Misaka steht auf dem Zeppelin, in dem die Forschungsdaten gespeichert sind, dem Doppelgänger gegenüber, der droht mithilfe von Gastanks die gesamte Bildungsstadt in Flammen aufgehen zu lassen. Was Misaka natürlich nicht zulassen kann. Als sich der Staub legt, tauchen Kuriba und der Direktor der Forschungseinrichtung auf. Später findet Misaka endlich Zeit, sich mal wieder bei ihren Freunden blicken zu lassen.