能赋予所绘图象生命的神笔少年森罗，与虫师银古相遇了。深夜，银古抓住了一名半人半虫的美丽少女。她竟是森罗已经去世的奶奶廉子。参加过“虫宴”的廉子，无法作为完整的人死去，一直在家中徘徊。为了见到廉子，森罗再次提起神笔，画出了盛满生命之酒的绿盏，使廉子以少女之躯永生。但碎盏难圆，她已永远失去了人类的生命。

小姑娘翠得了无法医治的眼病，只能住在黑房子里，少年阿齐是她唯一的朋友。在翠的引导下，阿齐也闭上了第二层眼睑，看见了黑暗中的光芒。但寄生在他们眼中的虫却因此加速繁殖起来。闻讯赶来的银古诱杀了从翠的眼中爬出的虫，却又用虫治好了翠的眼睛。用虫的眼睛看着这个世界，翠露出了略微寂寞的笑容。

在被雪覆盖的寂静山村里，村人一个接一个失聪，而真火却因为听见太多的声音无法正常生活。这一切都与寄生在他们耳中的虫有关。驱逐它们的秘密就藏在真火的体内，提示的线索则在真火母亲的遗言里。危急关头，银古终于找到了答案。他教真火捂住耳朵，听见了自己体内如熔岩般的巨响，那是比任何生命都强大的求生意志。虫终于被真火的生命之声赶出了体外。

依靠虫带来的预知梦，金将命运握在手中。可是随着噩梦不断应验，金逐渐发现了可怕的真相。原来虫带来的并非预知梦，而是将梦转化为现实的能力。当金发现是自己的梦毁了全村时，深深的自责与恐惧驱使他挥起刀，想要斩断这场无尽的噩梦。但接触过彼岸世界的人，再也无法回来了。金最终将刀刺向了自己。

被当做祭品死去的少女，因为经过的水虫而得救，因此与水虫结伴而行，虽然身体变成了虫的一部分，意识却仍渴望活下去。然而，水虫的旅程终点却是死亡。在最后的入海口里，银古终于从水虫体内救出了半透明的少女。她决心在这水虫死去的海边，依靠自己的力量活下去。而水虫的子孙们仍在林间游荡，寻找着自己的道路。

银古受少年阿轩邀请来到孤岛。这里的岛民信奉一种朝生夕死的“肉身神”。岛主为谋取私利，用昼颜花引诱女儿阿古成为“肉身神”。在阿轩帮助下，银古找到了寄生在阿古鼻中的虫。得知真相的岛民砍死了阿古的父亲。面对父亲的尸体和儿时玩伴的背影，阿古无法接受悲惨的命运，再次拿起了染血的昼颜花。也许只有在无悲无喜的生命里，她才能得到真正的幸福与平静。

银古遇见了为追寻彩虹而旅行的虹郎。虽然出身造桥世家，虹郎却毫无才能，还因名字古怪受人嘲笑。然而，痴迷彩虹的父亲“用生平所见最美丽的东西给孩子取名”的心情却打动了虹郎。他拒绝改名，踏上了寻找彩虹的漫长旅途。但是那并非彩虹，而是颜色相反的“虹蛇”，一种活着却没有意志的流体虫。银古和虹郎能找到梦幻之虹吗？顺应水流而动的“虹桥”，默默诉说着父子两代造桥匠的执着人生。

在海边小村，银古遇见了奇怪的男人白羽。自从妻子在海上迷雾里失踪后，他就一直在搜寻遗物。在银古的建议下，白羽决定忘记过去，开始新的生活。然而，跟随银古出海探查“海千山千”时，失踪三年的道子竟出现在迷雾中！抱着活生生的妻子，白羽再次选择了过去，却再也找不到回陆地的方向。而此时，道子正在他怀中渐渐化为泡末……面对无法割舍的过去和充满希望的未来，白羽会做何选择呢？

天灾之年也能丰收的小村里，每到秋天就有一人长出“瑞齿”而死。银古发现瑞齿其实是一种名为“破落之实”的虫，正在破坏自然的均衡。然而，祭司却无视银古的警告继续使用“破落之实”，甚至不惜将自己做为祭品，换取全村的幸福。面对憧憬着村庄的繁荣景象死去的祭司，银古决定打破虫师的最大禁忌。在丰收的欢庆声里，不复为人的祭司注视着这片祖先的土地，露出了幸福的笑容。

孩子们在化野医生家研磨一块极品砚台后，突然患上了无法治愈的寒病。制砚的少女錾告诉银古，用过砚台的人都已死于寒病，此后她便放弃了制砚。原来在砚台中栖息着名为“噬云”的虫，吞食空气中的水和冰，以雪或冰雹的形式降下，无法自行移动只能靠风力，长时间无云则萎缩变小，下降至地表，将自己冰冻起来，进入假死状态。自责的錾想销毁砚台，但银古和化野认为虫是无辜的，劝说她让噬云回归自然。在夏日晴空中，噬云吸收吸收空中水分降下冰雹时，女制砚师也重拾起制砚的信心。

山中出现种种异象，银古操纵“鼹虫”找到失踪的老虫师无直，发现他竟是山神。无直的妻子为了能让无直留下且与无直在一起而杀了原山神，而后无直担负起了山神的工作，但无直的妻子后来又因为受不了山的精气而死。后来无直不堪重负，为了村人的幸福，无直不顾银古的劝阻召来了“白蛇”。吃掉无直的白蛇成为了新山神，山也恢复了平衡。沉睡的山中，只有对逝者的追忆仍在初雪的寒意中袅袅不散。

孤儿阿勇被虫师奴伊收养。他发现奴伊和池塘里的鱼都只有一只眼。奴伊告诉他，寄生在“永暗”里的“银虫”夺走了他们的眼睛。目睹独眼鱼被“永暗”吞噬的景象，阿勇劝奴伊逃离。但一切都已太迟，奴伊进入了永暗。为了让阿勇活下去，奴伊教他献出右眼。重回人间时，阿勇已失去了记忆。他为自己取名“银古”，用仅剩的眼睛望着阳光，独自踏上了漫长的旅途。

在一座仅以吊桥与外界相连的山村里，传说摔落桥下的人会失去魂魄。花子在与阿全的逃婚途中失足落下峡谷，却毫发无伤。银古发现她被一种名为“伪葛”的虫寄生，可能已经死亡。唯一的希望是等“一夜桥”出现。午夜时分，伪葛开始迁移，形成了横跨山谷的一夜桥。它能否引渡这对恋人到达幸福的彼岸呢？

木助一家无法离开竹林，被认为是白竹精作祟。银古发现白竹其实是一种名为“借间竹”的虫，而木助的妻子小雪就是人虫混血儿“竹之子”。主竹的汁液养育了她，也困住了木助。看着丈夫思乡的背影，小雪流着泪砍倒了如同父亲的主竹。

银古躲避风雪时，认识了玲和春见姐弟。每当冬天粮荒时，春见就会失踪，然后带来冬天没有的野菜，一直昏睡到立春。银古告诉玲，作怪的是一种名为“空吹”的虫，并教给春见各种虫的知识。但这一回春见昏迷后却再没醒来，去调查的银古也被空吹吸走精气陷入昏迷……违反节气盛开的幻春之花，大雪中翩翩飞舞的空吹，远离尘嚣的农舍里，人与虫比邻而居，究竟会发生什么样的故事呢？

加持的母亲小夜得了奇怪的健忘症，渐渐忘记了不常接触的日常事物，惟独忘不了出门未归的丈夫。银古发现她的脑中寄生着名为“影魂”、专门吞噬记忆的虫，只能用不断重复的新鲜记忆抵抗侵蚀。可是，发现丈夫已在别处建立新的家庭，小夜终于放弃了所有抵抗，陷入沉眠，醒时已被影魂带走了包括丈夫在内的全部记忆。然而，那比生命更重要的感情却仍以不可思议的方式保存了下来……

　兔泽家是负责养护虫师的通信工具“虚”的一族。因为一次意外，妹妹绮被封闭空间里夺路而逃的“虚”带往虚穴，生死不明。多年来，姐姐绪始终没有放弃寻找妹妹。为了让绪彻底死心，银古带她进入大虚穴，那是无限深广的迷宫，只有前人虫师留下的铁链可供辨识出路。被绝望吞噬的绪，要如何从彼岸世界带回孪生妹妹呢？

少年块为了成为名画师，背弃了故乡和亲人，也渐渐失去了力量。回故乡汲取灵感的他，看到的却是被自己抛弃、一片荒芜的山村和相继离世的家人。带着块的处女作“山之衣”前来调查的银古，发现这是因为与人类共生的虫“产土”大量流失造成的。在这里生长的人与虫，都不能离开赖以生长的土地。迷途知返的浪子能否得到故乡的原谅，重拾生命的画笔呢？

小保姆阿吹握住一根天上垂下的丝线，就此消失在空中。救下阿吹的银古发现，她遇到的是一种名为“天边草”的虫。险遭吞食的阿吹因此游移在人虫之间，唯一能留住她的只有爱人清志郎的信念。然而，清志郎却迷失在世俗的杂念中……浩淼的星空下，追寻着“迷途之星”的男子流下的眼泪，要如何唤回那看不见的爱人？

日本明治维新前后，历史的变迁尚未触及深山莽林，人类与自然仍在混沌中沉眠。在一片荒原中，住着一位名为狩房淡幽的少女，她的体内封印着“禁种之虫”。为了使虫沉睡，淡幽必须记录虫的故事，因此不能自由行动，终日与纸笔为伍。她与外界交流的唯一方法就是倾听旅人讲述杀虫的故事。然而，这些记录在《狩房文库》中的故事却只有仇恨与杀戮。直到有一天，一个白发绿眼的男子出现在她面前。听了少女的愿望后，这个名叫银古的男子开始讲述关于生命与情感的新故事。

明在结婚一年后生下了一个绿色淤泥状的东西，这个东西沿着地板的缝隙逃到了地下。一年后的一个晚上，明和她的丈夫地板下找到了一个婴儿，因为婴儿和明夫妇长相很像，便被收养，取名为“棉彦”。 棉彦的成长很快，喜欢吃小鱼和果实，还没到半年就长到3岁左右，只是智力和婴儿一样。但是随着这个之后，每隔半年都会从地里生出一个。三年后，长子全身长满绿斑，濒临死亡。

那光总是出现在那块岩石附近，那块岩石的下方是处叫作“龙宫”的海渊，在那儿丧生的人可以重生，样子和原来的一模一样。 满月时那里会浮上来一粒一粒红色的小红珠。那一粒一粒中的是各种生物的“胚”，最初始的物质，吞下它的人，会怀上与沉入海中的人一模一样的小孩，说明那虫能使生物返回“胚”的形态。那种虫，发光，诱捕生物，化成初始形态后排出体外。或许可以说是吞噬生物的“生存时间”的虫。

野锈，通常附着在尸骸上，分解尸骸，是无害的生物，不喜欢海风，分解尸骸时会发出一种声音。繁的声音就类似于把这种声音放大了几百倍，因此，山中的“野锈”以为有食物就聚集过来，但并没吃的，所以蔓延到了活体生物上了吧。

　幽火中有种叫“火种”的虫，那种虫就是幽火的实体，吸取人的体温的生物。那草是“火种”的幼体。 火种很常见，散毒的应该是极个别所拥有的习性，那东西可以让人点着火，得到火，发育成熟之后，就能用那火引诱人，吸取人的热量。但这毕竟是“伪火”，给予幼体“伪火”，不能发育成熟。要消灭那种草，用幽火烧就行了。

自小失明的女孩，在虫师父亲的努力下，通过被一种叫做眼福的虫寄生从而获得光明。时光流逝，女孩的视力越来越好，可以透过物体甚至眼睑看到远方，过去和注定要发生的未来。能预知未来，却不能将其改变。全是光明的世界未必强过一片黑暗，眼福眼祸相生相依。最后，眼福脱离了女孩的身体，女孩再次失明，却获得了心灵的宁静。

少爷是山主的儿子，他的祖祖辈辈都在管理一座山，那座山有光脉，会有各种颜色的雾，这座山真正的山主是一条头上长满青草的大鲇鱼，有一年钓鱼的泽碰到了流浪者中的一位孩子叫魦，他们慢慢地成为了朋友，泽给魦讲了银古的故事，在离别时，魦偷偷地把一条他捕的鲇鱼放在泽的门口，后来第二年流浪者又回来了，带回来了银古，可是不幸的泽的父亲却死了，亲戚把泽的财产分光了，泽请求魦带他一起离开，魦说爷爷才能决定。但当泽第二天来到约定的地方，魦已经离开，银古说，光脉晚上就开始移动魦他们不得不走。 后来，因为光脉移动，山变成了荒山，鲇鱼头上也没了青草，泽用自己的青春努力恢复山的原貌，最后遇见了为他家族看病的银古，向银谷问候了魦，他也安心的笑了。

在世界的角落里，有着这样一种生物：它们下等且奇怪，不同于任何动植物，有自己的生命形态以及生存方式。自古以来为人类所敬畏，不知何时开始，被称为“虫”。“虫师”这个职业便应运而生，他们对虫进行研究，并接受人们的委托，解决由虫引起的奇异事件。故事主人公银古（中野裕斗 配音）就是这样一名四处云游的虫师，这一次，他要解决的是一种叫“蚀日”的虫。

近日里，各地均发生了日蚀现象，在太阳光被遮掩的时段里，虫会躁动，因此有可能引发各种问题，有人会受虫气所害，变得畏惧日光或者失眠，有人甚至会身影消失。而最让银古担心的，是由“蚀日”引发的一种棘手的异常现象……

酿酒少年误入虫师的集会，自己酿的酒被误认为是光酒而引起了骚动。面对银古，禄助将父亲的奇遇、以及自己酿出这种酒的缘由娓娓道来，但是这种与光酒很像的酒其实是有极大的隐患的。在银古劝说下，禄助决定停止贩卖这种酒，依靠自己的实力酿出真正的美酒。

将贝壳放在耳边，听到的却是鸟的声音。银古路过一个小渔村，发现奇异的“虫”正在预告凶兆。被夺去声音的少女，怀着仇恨之心的中年男子，以及丧生鱼口的亡魂……数年前的悲剧真相到底是什么？银古帮助村民避开了赤潮的侵袭，却发现凶兆远未结束……

银古追寻“雪虫”的踪迹，来到一个终年被雪覆盖的地方。他遇到了一个身边一直有雪花飘舞的少年，驱使着这个感觉不到寒冷与冻伤的少年行动的是，无论如何也不想忘却的、与妹妹一起度过的冬天的回忆。为了将这个就要被雪同化的少年救回温暖的人世，银古应该怎么办呢。

在夜晚的山中，有着不需要武器就能狩猎的人。从父亲处继承了奇妙的能力，能够轻易地打猎，在夜山中就好像是山林之王一样。日复一日没有危机感的打猎，人的心也会变吧。为了将男子从无尽的黑夜中拯救出来，银古带来了光酒，但是只看到了山上的一滩血迹……

被窥视的水面上映出的是何人，亦或是何物。在水边梳头的少女身后跟着一个想要取代自己的虚幻的影子，要想除去它，就要在它取代自己的那一刻用镜子映照出它的本体。但是心灰意冷的少女却并不想把自己花了的镜子磨亮，因为对她来说，存在于这个世界上的意义，她已经看不到了……

在枝头洋溢着的无数的色彩，是魅惑了人类的春之美景。对其欲罢不能的人，不知不觉走出了禁忌的一步。虚幻的花，为了谁而争奇斗艳呢……最后火光冲天，樱花凋落而散，几代人煞费苦心依旧未能挽留珍藏的美景，不过好在万物生生不息，不知何时又会有新的邂逅……

灼热的太阳照耀着大地，庄稼渐渐枯竭，人们祈求着雨水，这时一个神秘的少女来到了这个村庄。不久干涸的大地降下了雨水，那个少女无论到哪里，雨的脚步就追随到哪里，就仿佛她带来了雨水一样，不断滴落的雨水，无法流出的泪，引出了一件件悲伤的往事，以及那个追到了遥不可及之物的少女的过去……

船员伊吹能用口哨控制能制造风的虫——鸟风，然而在成为正式水手的晚上，高兴的吹起口哨的伊吹，没有唤来在夜间休息的鸟风，而是引来了喜欢打洞的哨蛊。哨蛊在船上打洞使船沉入了海里，伊吹幸运的没有被淹死，乘坐小船带着给母亲买的珍贵的手信回到了岸边。可是母亲并不关心伊吹，让伊吹当掉手信补贴家用，伊吹为了报复这个家故意引来哨蛊，母亲也在哨蛊的影响下生病。银古帮忙驱逐了哨蛊，并发现了再次召唤哨蛊的伊吹。银古告诉伊吹鸟风是哨蛊的天敌。伊吹哭泣着唤来鸟风，解决掉哨蛊的同时用大风毁掉了房子，然后留下手信，一个人离开了村子。感觉这一集有象征的意味，千疮百孔的家，被大风吹散的房子……

银古在雪山中混倒，被进山的丰一的父亲救起，苏醒后发现丰一家附近的田里竟然长着青稻。丰一体魄比一般人强壮得多，即使昼夜干活也不会累，并且难以入睡。银古察觉到是虫在影响丰一，将其告知了丰一的父亲，却被呵斥不许再提这件事，银古将驱虫药交给丰一的父亲。父亲思考后将死去母亲的往事告诉了丰一，银古也将乳潮的一切告诉了丰一。丰一最终决定为了家庭保留乳潮。

银古行至一座山前，因为惊蛰后的虫不好对付，所以银古决定在山脚下沉睡至春天再进山，可是醒来后却意外发现下着雪，无奈之下只好在大雪中进山，却无论如何也走不出山，原来是山主为了让受伤的山休养生息封锁了整座山。银古于是为了出山找到山主，然后冬天之虫抢走了银古的光酒，得到力量的下山风笛从山中离开，这座山也迎来了春天，原来山主放银古进山是为了得到他的光酒，让虚弱的冬天之虫得以迁徙。

虫师铃之滴讲述的是一个女孩被选为山主在山林里孤独地生活，直到虫师出现找回人之心的故事。\n\n一切从铃声开始，最后也从铃声处结束。

另一个世界，住着一群与常见动植物截然不同的生物。远古以来，人们敬畏地称它们为“虫”。当虫的世界和人的世界重合时，虫师银古便会出现。 银古，他出入穷乡僻壤去追寻虫的足迹。虫可能潜伏在人的身体中，潜伏在沼泽地中，潜伏在整个山岭中；带来疾病、瘟疫等可怕的灾难。银古穿越草木的意识，找到结症，予以化解。他一路走来，与少年天才画师、写虫之卷的女孩，保佑一方平安的大师……惺惺相惜，又黯然别离。在这里，共存与牺牲，始终是最伤感的话题……

年少的银古昏倒在山里，被当地的虫师素黑所救。银古暂住素黑家中，素黑教授银古药草的知识。正逢山主交替之时，山主去世，可新的山主却还没有出现。山主去世的夜晚，素黑进山查看。银古也忍不住进山，却意外看见新山主的蛋，山主即将诞生。银古失手将蛋摔破。银古慌张地去找素黑，遇见了理，它接受了山主的生命。银古把事情告诉素黑，素黑说无法原谅他，但却告诉他世上没有栖身之处的人是不存在的。

一个雨天银古借宿于阿熏家。阿熏听着银古的故事羡慕不平淡的生活。之后过了很多年，阿熏一家一直过着平淡的生活。一个晚上阿熏在回家的路上闻到奇异的芳香，他走进那个漆黑的洞里。时间回到多年以前，阿熏还是个少年。然后再次循环，阿熏总觉得有什么想不起来。一个雨天银古借宿于他家，银古说他被廻陋囚禁了。多年之后，阿熏依照银古的话避开了廻陋的洞穴回到了家，可妻子却因摔下悬崖性命垂危，阿熏背着妻子再次进入了漆黑的洞穴。

一到傍晚，虽然身在家中，却说起什么「必须回家了」或「要告辞了」之类的话，傍晚时会出现的影子名叫大祸时，如果被影子踩到或是踩到影子，本体就会被替换。记忆逐渐复苏，自己替换了小茜，御影流下悔恨的泪水。阳吉牵起御影的手，「不用道歉，因为我也很幸福」。数年后，阳吉在御影的墓前看到了小茜的影子......

“你和那个人之间连接着一条很深的水脉啊。”

你还能看到那光吗？“已经完看不到了。”这样啊，那就好。但是那样的话接下来，该怎么办呢？“什么？”只能开发更强劲的药了呀。

被井星供养的小姑娘，从竹竿中逃逸的神明，人虫界皆为彼岸，而恰好两处都温善得让人无从凭依。这是虫又一次让溺亡者生还。她在平行世界里感受低等生物般无信仰的孤寂，被永夜隔离，迷失于无序、无人的流亡之境，是亲人的玩偶饭食与之维系，并终以呼喊唤回。血脉无忌，别去触碰那遥远的星星。

呐~妈妈。河流是从哪里来的呢？ 从深山的山谷中流出来的哦。

那山谷的水呢？ 从天上的云降下来的哦。

那~天上的云呢？ 从大海来的哦。

大海？ 嗯~是河流要的地方哦。

那 大海 河流 雨 和云都是一样的啊。 是啊，虽然形状不同，但本质是一样的哦。

那个女人的母亲，对她冷漠，她一心只“爱”那个“爱上”的人，可能也是唯一“爱”他的人。当她失去“最爱”之后，就放弃，怨恨，连亲骨肉都不爱，不是她不会爱，是她不愿意爱。小时候遭受到的，长大后遭受到的，爱的缺失和无可奈何，要儿子也来遭受。

尸体生出苦难的荆棘，刺破活人伪善的面皮。真相未公之于众时曾一度陷入兄弟恋，婚姻即背叛，情杀可能的猜论之中。故人在凶手体内播下罪恶之实，是在有朝一日的崩毁前为至亲发出警示。而握板砖的手比死者更难埋葬，豁口终会重现，就像一双不合脚的牛皮靴。虫师冷眼表示无药可医。

在长久长久的时间里，有一颗大树深深扎根于地下，高大，宽广，枝繁叶茂，静静的注视着这片土地上，出生又消逝的，永恒不变的轮回变迁。

在《虫师·续章》放送前的电视特别节目