「この幸せがいつまで続くだろうかって考えると、泣きたくなるほど悲しかったよ……。」葉月にとって姉の初美は、大切な存在。それは、愛情。愛……。初美の誕生日の前夜。初美の寝顔にそっと唇を寄せる葉月。午前0時……。突然の光。その光に包まれて初美は、消えてしまう。そして、物語は動き出す。

「私は……、臭いに敏感なほうでね……。」突然の衝撃に抵抗できない蓉子。ニヤッと微笑み耳元に顔を近付ける将校。背中に冷たい感覚を覚える蓉子。ナイフ……。諜報員。任務遂行。交差する密室劇。ここは夜行列車の世界……。

初美を探す旅に出た葉月。そこは本の中に存在する世界。その本を管理する図書館。管理者・リリスが語る初美の存在。イブ……。そして、物語はまた別の世界へ。リツコ。ガル。不思議な力を使う少女・ジル。生と死。憧れ。嫉妬……。刻のイタズラが紡ぐ悲しい結末。いや、それは始まり。ここは、錬金術の栄えし世界……。

「あなたは、どこにいるの……。」とある王国の姫・マリエルは病床に伏していた。余命僅かなその命を救った錬金術を使う少女・リツコ。マリエル姫の誕生の儀が迫ったある日。そこに現れた青年・ガルガンチュア。運命の再会。偶然。必然……。不敵な微笑み。これは、あの小さな村で起きた悲劇から100年余のちの話。

「ん〜、いい気持ち」言葉の通じない民との遭遇。未開の国。そこで出会う1人の少女。彼女だけが葉月たちと話ができる。儀式……。リリスを神の遣いと信じる民。その理由は……。神に捧げられる生け贄。邪心の像。申し遅れました、ここは原始創出の世界……。少女の名は、クィルと申します。

南海の孤島。そこに住む少女・ミルカ。外界から閉ざされたその島を訪れた葉月たち。ミルカとともに住むセイレン。セイレンが、リリスを見つめる意味。突然の出来事。天変地異……。静寂は打ち破られる。地面は裂け、空は歪む。ペリペリ……？ その現象を少女はそう呼んだ。「ペリペリ」とは一体……。

初美と葉月は血のつながらない姉妹。少女は姉に対して憧れ以上の思いを募らせていた。痛む心……。焦がれる想い。「ボクだけを好きでいてくれなくちゃボクは嫌なんだ。」それは、思春期に見る刹那の幻想なのかも知れない。だけど……。現代世界。これは、初美が葉月の前から消えるあの運命の出来事より過去の2人のお話。

「その人を返してもらいに来た。」竹の砦に住む藤姫。仙格を上げたいために藤姫に近付こうとする妖狐・メイリン。そして、闇の者たちもまた藤姫の力を狙っていた。ここは、古の日本に似た世界。竹取りの物語を紡ぐ世界……。藤姫と出会った葉月。その姿を見た時、葉月は叫ぶ。「ボクだよ!! 葉月だよ……。」

竹の砦で出会った藤姫は、初美と瓜ふたつであった。初美と同じ櫛を持つ藤姫。戸惑う葉月。イブの影……。静かなる夜が、邪悪なる闇にかわる時、忍びの者たちが藤姫に襲い掛かる。一方、イブの櫛を探すガルガンチュアは、メイリンに近付くのだが……。ジル。イブ。ガルガンチュアが、心に封印している事実とは……。

「いつか星を見つけて、そこに世界を作るんだ。」漆黒の宇宙。その船は行き先も知らない旅を続けていた。ここは、宇宙移民船が旅する本の世界。少女・レイラと葉月たちは出会う。移住の地は……？ 船の秘密とは……。それは、遠い遠い未来のお話……。

葉月たちは、レイラという少女に出会う。ここは、宇宙移民船が旅する世界・ルラウ。船にいた大人たちは、皆死んでいた。子供たちを育てたのは、ララというコンピュータ。彼女の望みは、子供たちのために新しい世界を見つけること。船の寿命が尽きる前に移民出来る星を探さなくてはならなかった。

宇宙庭園。そこには、思いがけない出会いが待っていた。葉月。リリス。そして、ガルガンチュア。イブの存在に戸惑う3人。愛する初美。葉月の想い。……幻想。永遠の約束。ガルガンチュアの心。償い。想いが交錯する中、自らの世界に戻るとイブは語る……。廻る廻る迷宮の輪舞。そして、綴られるそれぞれの結末……。

葉月にとって血のつながらない姉の初美は、大切な存在。それは、愛情。愛……。止まない雨。初美の誕生日の前夜。初美の寝顔にそっと唇を寄せる葉月。午前０時……。17歳の誕生日。今日、昨日。明日。現在。過去。未来。今はどこ。その時、少女はひとすじの涙を流す。そして、物語は終わりを告げる。