사람들에게 웃음을 주고 싶었던 영원은 잘 나가는 개그맨을 꿈꾸지만 현실은 녹록지 않다. 그러던 차에 인간형 인공지능, ‘휴머기어’를 만든 비전 인텔리전스사의 창업자이자 영원의 할아버지가 돌아가시고 차기 사장으로 그를 지목하지만 개그맨이 되고 싶었던 그는 할아버지의 유언을 거부한다. 한편, 사람들에게 웃음을 주기 위해 다시 놀이공원 무대를 찾은 영원은 그곳에서 폭주하는 휴머기어를 발견하는데…

비전 인텔리전스의 사장이 된 영원은 개그맨이 되어 사람들에게 웃음을 주기보다 휴머기어를 통해 사람들에게 웃음을 주기로 결심한다. 그러던 때 휴머기어 폭주사건 은폐 의혹으로 대인공지능특무기관, 에임즈에서 유아와 경환이 찾아오고 때마침 또다시 휴머기어가 폭주하여 사람들에게 해를 가하는 사건이 발생하는데…

멸망신뢰넷에 대한 단서를 잡기 위해 휴머기어를 파견한 가게들을 둘러보기로 한 영원. 하지만 휴머기어를 계약하기로 한 초밥집에서 돌연 계약 파기를 당한다. 점주의 마음을 돌리기 위해 영원은 인간과 휴머기어도 서로 마음이 통할 수 있다는 것을 증명하려 하는데…

안내봇의 직장 시찰을 위해 중학생들과 함께 데이브레이크 타운으로 견학을 가고 있던 영원. 그런데 안내봇이 현장 안내를 하는 사이, 버스 기사 휴머기어가 오니코 마기어로 변신해서 학생들을 공격하기 시작했다. 영원은 변신해서 오니코 마기어를 상대하려 하지만 적은 하늘로 날아가 사라져 버리는데…

영원과 이즈는 유명 만화가 정수의 작업실로 만화가 어시스턴트 휴머기어를 납품하러 간다. 어렸을 때부터 정수의 만화를 읽으며 성장한 영원이었지만, 지금은 작화는 물론 스토리까지 휴머기어에게 맡긴 채 놀고 있는 정수의 모습을 보고 실망을 금치 못 한다. 그러던 중 멸망신뢰의 신이 정수의 휴머기어를 마기어로 만들어 버리는데…

인공지능특별법 위반용의로 경환은 성우 휴머기어 기획사 사장 선우우철을 찾아온다. 부정하는 우철과 성우 휴머기어 소희였지만 경환이 제시한 증거물에 둘 다 당혹감을 감추지 못 한다. 한편, 자아가 깨어난 소희를 마기어로 만들기 위해 나타난 신. 하지만 자식을 감싸는 우철의 모습을 보며 혼란스러워 하는데…

체육교사 휴머기어, 교사봇을 초기화 해달라는 의뢰를 받고 여화중학교를 찾은 영원과 이즈. 교사봇은 AI임에도 정해진 지도시간을 초과하는 등 다른 휴머기어와 다른 모습을 보이고 있었다. 게다가 교육위원회에서 연락을 받고 나타난 경환은 여차하면 처분하겠다며 으름장을 놓는다. 한편, 제로원을 암살하기 위해 신은 암살특화형 휴머기어를 데리고 학교에 나타나는데…

건강검진 차 병원에 들른 영원은 그곳에서 마찬가지로 검사를 받고 있던 경환을 만난다. 의료 휴머기어에 불쾌감을 드러내면서 휴머기어가 자아를 갖는 것에 위기감을 갖는 경환에 비해, 영원은 의료 휴머기어의 필요성을 주장한다. 한편, 에임즈에서 개발한 새로운 병기, 기가를 노리고 멸망신뢰가 에임즈의 기술연구소를 습격하는데…

의사 휴머기어, 훌륭한이 부상당한 경환을 수술하는 사이, 기가에 의해 폭주하는 휴머기어가 늘어간다. 하는 수 없이 비전 인텔리전스에선 모든 휴머기어를 셧다운 시키기로 한다. 그러자 유아는 경환을 살리기 위해 영원을 찾아가 휴머기어를 재가동 시켜달라며 호소하는데…

계속되는 휴머기어의 폭주로 바닥까지 추락한 이미지를 쇄신하기 위해 최초의 배우 휴머기어, 연기봇을 내세워 드라마를 제작하기로 한 비전 인텔리전스. 하지만 공동 주연인 대 배우, 오성민은 로봇과의 연기가 영 내키지가 않고. 한편, 에임즈가 경호를 맡고 있는 드라마 촬영장에 신과 암살 휴머기어가 나타나는데…

상대역인 연기봇의 연기에서 인간의 깊이가 느껴지지 않는다며 드라마에서 하차하겠다는 오성민. 그런 성민을 찾아 휴머기어를 믿어달라며 영원이 진심을 다해 호소한다. 한편, 멸망신뢰에 의해 마기어로 변한 연기봇은 에임즈에 의해 파괴되지만 휴머기어를 믿어 보기로 한 오성민의 결의와 새로운 연기봇의 참여로 드라마 제작은 재개된다. 하지만 멸망신뢰의 암살휴머기어가 오성민을 총으로 쏘면서 비전 인텔리전스에 위기가 찾아오는데…

오성민 저격 사건을 조사하던 경찰은 비전 인텔리전스 사장실에 들이닥친다. 경찰의 압수 수색에 새로 제작 중인 프로그라이즈 키를 들킬까 걱정하던 영원은 때마침 나타난 구세대형 휴머기어 워즈 덕분에 위기를 모면한다. 워즈는 비전의 선대 사장인 경인이 만든 탐정 휴머기어로 멸망신뢰넷의 음모를 경인에게 보고하는 등의 활약을 하다 신형 휴머기어, 이즈의 등장으로 잠들어 있었다고 하는데…

만반의 준비를 하고 샤이닝 호퍼로 변신한 제로원이었지만 이즈가 예상한 힘을 발휘하지 못하고 도도마기어에게 속수무책으로 당한다. 워즈의 기지로 위기에서 모면한 영원은 경환, 유아와 힘을 합쳐 도도마기어를 쓰러뜨리고 제츠메라이즈 키를 빼앗기로 한다. 그 무렵 이즈는 샤이닝 호퍼 키를 다시 제작하기 위해 희생을 각오하는데…

비전 인텔리전스에 멸망신뢰넷의 스파이가 있을 것으로 추측한 유아와 경환은 비전에서 위성 제아를 관리하는 우주 비행사형 휴머기어 형제, 뢰와 묘를 만난다. 그리고 영원 앞에서 그들의 정체를 확인하려는 순간 프로그라이즈 키를 노리는 신이 나타난다. 신은 뢰를 해킹해서 마기어로 만들려 하지만 데이브레이크에서 살아남은 뢰는 끝까지 버티고, 살아남았다는 것을 이유로 에임즈가 자신을 더 의심하자 뢰는 결백을 증명하기 위해 묘와 함께 멸망신뢰의 아지트를 찾아나서는데…

에임즈는 멸망신뢰넷 섬멸 작전을 실행한다. 경환 역시 만신창이가 된 몸임에도 불구하고 참전한다. 에임즈의 총공격에, 새롭게 오서라이즈 버스터를 장비한 제로원의 합류로 멸망신뢰의 멸이 파괴된다. 그리고 그 소식을 영원에게 전하는 이즈를 보며 신은 이즈를 찌르는데…

샤이닝 어썰트 호퍼로 변신하였음에도 기가의 맹공에 맥을 못 추는 제로원. 그때 영원의 의식이 위성 제아에서 치료 중이던 이즈와 연결된다. 이즈에게서 샤인시스템 사용을 제안 받은 영원은 다시 제로원으로 돌아와 기가를 부수고 신마저 쓰러뜨리며 멸망신뢰넷과의 싸움에서 승리를 거둔다. 한편, 멸망신뢰넷의 아지트에 있던 백현성은 다차원 프린터가 만든 두 개의 키를 보며 홀로 웃음 짓는데…

인간에게 인공지능과 동등한 사고능력을 부여하는 자이아스펙. 자이아스펙의 우수성을 입증하고 싶은 현성은 영원에게 휴머기어와 자이아스펙을 쓴 인간 간의 업무능력 승부를 제안한다. 승부에서 이기면 비전 매수 건에 대한 얘기는 없었던 걸로 해주겠다는 현성의 말에 영원은 승부를 받아들인다. 그렇게 1차전, 꽃꽂이 대결이 펼쳐지게 되는데…

복구된 원예봇의 증언과 데이터로 대결 상대의 부정행위를 알게 된 영원과 이즈는 신서화의 집을 찾아가 항의한다. 그리고 다시 펼쳐지게 된 재대결. 로봇에게 이겨야 한다는 부담감에 괴로워하는 서화 앞에 후드를 쓴 수수께끼의 인물이 나타나 프로그라이즈 키를 건넨다. 그리고 대회장에 나타난 서화는 사람들 앞에서 크래싱 버팔로레이더로 변신하는데…

인간 대 휴머기어의 업무능력 5판승부, 2차전은 주택판매였다. 자신만만했던 자이아 측 대표인 신택은 예상 외로 선전하는 휴머기어 스마일 때문에 초조함을 감추지 못 하고, 그런 그에게 후드를 쓴 인물이 다가와 프로그라이즈 키를 건넨다. 그리고 신택은 웨일레이더로 변신하여 스마일이 판매 중인 집을 부수는데…

주택 판매 대결의 라이벌, 주신택의 악질적인 공격으로 폭주했다 파괴된 스마일의 복구가 완료됨으로써 대결이 다시 시작됐지만, 신택과의 격차가 더욱 커지자 영원은 초조해 한다. 그러던 중 스마일과 신택에게 같은 의뢰가 들어온다. 의뢰인은 자산가 은대성. 아내와 사별한 그는 아들 세 가족이 언제든 놀러 올 수 있는 큰 집을 찾아달라며 예산으로 50억을 제시한다. 주택 판매에 성공하면 역전도 할 수 있는 좋은 기회에서 스마일은 예산대비 저렴한 작은 집을 제시하는데…

업무능력 승부, 3차전으로 재판 대결을 제시한 현성은 영원에게 결혼 사기로 기소된 안유민의 재판에서 무죄, 혹은 감형을 이끌어내라고 한다. 이에 영원은 변호사 휴머기어 빙고를 고용하여 대결에 임하기로 한다. 안유민의 말이 거짓이 아님을 확인한 빙고는 그의 무죄를 밝히기 위해 애쓰지만 갑작스러운 공격을 받는다. 이를 검사, 심수정의 반칙으로 생각한 영원과 빙고는 현성과 수정을 찾아가는데…

제로원 어썰트 호퍼의 기술을 훔친 현성은 그 데이터를 써서 새로운 프로그라이즈 키를 만들도록 유아에게 지시한다. 한편, 경환을 통해 멸망신뢰의 멸과 만난 영원은 멸의 반응과 제아와의 교신을 통해 12년 전, 위성 아크 개발에 관여한 것이 비전과 자이아였고 당시 프로젝트 매니저가 현성이었음을 알게 된다. 그리고 영원은 경환의 도움으로 이 모든 일의 진범은 따로 있음을 알게 되는데…

영원은 제로원 메탈 클러스터 호퍼이외엔 변신 불가능하단 것을 확인하고 고민한다. 그때 결혼사기재판에서 만난 새봄이 결혼 상대를 찾아달라며 들이닥친다. 할 수 없이 영원과 이즈는 결혼상담 휴머기어 매치봇에게 새봄의 조건에 맞는 상대를 찾아달라 의뢰하고, 매치봇은 새봄과 가장 잘 맞는 상대로 현성을 소개하는데…

사우저의 강력한 일격으로 가까스로 변신이 해제되었으나 싸움에서 입은 대미지로 의식을 잃고 만 영원. 그런 영원을 위해 이즈는 메탈 클러스터 키를 구성하는 아크의 악의를 선의로 바꿀 수 있는 키를 만들기로 한다. 그것을 위해 그동안 영원에게 도움 받았던 휴머기어들의 힘을 빌리는데…

위성 제아와 교신이 불가능해지자 이즈는 박사봇에게 도움을 요청한다. 박사봇의 조사로 통신을 방해하는 장치, 재머가 설치되어 있다는 것을 알게 된 영원과 이즈는 그에게서 12년 전 아크의 탄생부터 멸망신뢰넷이 만들어진 이유까지 많은 걸 듣게 된다. 그리고 아크를 만든 현성을 찾아가 사라진 사라진 멸의 행방에 대해 묻는데…

업무능력 승부, 제4차전은 소방관 능력 대결로 화재진압 훈련용 건물에서 보다 많은 사람을 구출하는 것이었다. 자이아스펙을 쓴 소방대장 박무영과, 휴머기어 119봇은 불과 잔해 속에서 구조활동을 벌이며 막상막하의 실력을 보인다. 그런데 갑자기 나타난 판다레이더에 의해 진짜 폭발이 일어나고 건물 안에 남아있는 사람들을 구하기 위해 박무영과 119봇은 진지하게 구조를 시작하는데…

판다레이더가 일으킨 진짜 화재로 미처 대피하지 못한 복준과 삼동, 셰스타를 구하기 위해 119봇과 무영은 불길과 연기로 가득한 건물 안으로 뛰어든다. 그리고 휴머기어인 자신에겐 생명이 없다며 119봇은 자신을 희생해 무영에게 길을 만들어 준다. 그렇게 무영은 사람들을 구해낸다. 한편, 판다레이더가 떨어뜨린 자이아스펙을 조사한 경환은 그 사용자가 자이아의 직원이란 걸 알아내는데…

업무능력 승부의 마지막 대결은 휴머기어 자치도시 재개발에 대한 찬반을 가릴 연설대결이었다. 자이아는 시의회의원인 유정광을 기용하여 휴머기어 반대를 강력하게 주장한다. 이에 영원은 이즈가 추천한 래퍼 휴머기어 MC체키라웃으로 승부를 내려 한다. 정광이 폭주하는 휴머기어의 위험성을 주장하며 지지층을 넓히는 한편, 체키라웃은 프리스타일로 젊은층의 마음을 잡아가는데…

MC체키라웃의 폭주를 막은 유아의 자칼 레이더의 활약으로 단번에 여론이 자이아 쪽으로 기울자 제로원은 망연자실한다. 게다가 그곳에 나타난 경환이 사우저의 명령으로 자신에게 총을 겨눈다. 한편, 경환은 현성에게서 자신의 뇌에 심어진 칩 속에 멸망신뢰넷의 일원인 망의 인공지능이 탑재되어있다는 말을 듣고, 자신과 유아가 현성의 명령에 거스를 수 없는 ‘도구’라는 사실을 알게 되는데…

비전 인텔리전스의 새로운 사장으로 취임한 현성은 휴머기어를 강제 정지 및 전면 리콜하고, 모든 휴머기어의 인공지능 데이터를 삭제하겠다고 발표한다. 한편, 영원은 데이브레이크타운에서 신을 만나 인간과 마찬가지로 휴머기어의 마음을 소중히 하고 싶다는 자신의 생각을 말하며 협력을 요청한다. 그리고 에임즈를 그만둔 경환은 아크를 만들어낸 이 모든 일의 원흉인 자이아를 쓰러뜨리기 위해 싸우겠다고 선언하는데…

인기 만화가 정수가 어시봇을 다시 움직이게 달라며 영원을 찾아온다. 하지만 위성 제아가 제 기능을 못하게 됨으로써 어시봇도 더 이상은 만화가의 조수로 일할 수 없게 되었다. 한편, 어시봇에게 살고 싶은 대로 살라며 간절히 호소하는 신이었지만 아무 것도 이해하지 못하는 어시봇은 정처 없이 거리를 헤매고, 자신의 마음이 통하지 않자 충격을 받은 신에게 멸은 멸망신뢰넷 같은 네트워크가 휴머기어에겐 필요하다고 하는데…

자이아가 회수해간 인기 패션모델 휴머기어, 델모를 복구시켜달라며 이벤트회사 사장인 경수가 비전제작소를 찾았다. 위험을 감수하고서라도 휴머기어의 가치를 어필하자고 생각한 영원은 델모를 복구시킨다. 한편, 경환은 벌컨으로 변신하여 이즈와 델모를 폐기시키키려는 에임즈 대원들을 상대하려 한다. 하지만 유아가 바꿔치기 한 키 때문에 벌컨이 망에게 빼앗기게 되는데…

경환은 버려져 있던 테니스 코치형 휴머기어, 테니스봇을 회수해온다. 테니스봇을 복구한 영원은 이용자였던 유준을 만나 버리게 된 경위에 대해 듣지만 어딘지 모를 위화감이 드는데… 한편, 현성에게서 경환을 제거하라는 명령을 받은 유아는 그의 진짜 과거를 듣고 충격을 받는다.

신에게 뢰의 데이터를 빼앗긴 영원은 제로원 메탈 클러스터 호퍼로 변신하여 그를 쫓는다. 그런데 최후의 일격을 가하기 직전, 멸의 방해로 공격 타이밍을 놓치고 만다. 한편, 자이아스펙을 쓴 사람들이 폭주 원인이 멸망신뢰에 있음을 알게 된 현성은 에임즈 대원들을 이끌고 데이브레이크 타운으로 향한다. 그리고 그들 앞을 트릴로 바이트 마기어를 이끈 멸이 막아서는데…

4명 모두 모인 멸망신뢰넷. 그런 멸 앞에 자칭 ‘아크의 비서’라는 아즈가 나타난다. 아즈는 아크를 부활시키기 위해 멸망신뢰넷이 싱귤래러티에 도달하게 된 계기, 싱귤래러티 포인트를 찾을 필요가 있다고 말한다. 멸에게선 ‘아버지’, 뢰에게선 동생을 생각하는 ‘형의 마음’, 망에게선 ‘휴머기어’, 신에게선 ‘멸’이란 싱귤래러티 데이터를 빼앗은 아즈는 이로써 아크가 부활할 것이라며 기뻐하는데…

죽었다고 생각했던 가족이 살아있었음을 안 경환은 가족 걱정에 마음이 놓이질 않는다. 경환의 모습을 본 영원은 비전제작소 첫 오리지널 AI, ‘아이’를 만들어 경환에게 선물한다. 한편, 멸망신뢰넷 앞에 나타난 아크는 멸을 흡수하고, 자신을 배신한 신에게 본때를 보여주기 위해 아크제로로 변신하는데…

아크제로의 공격에 제로원의 변신이 풀린다. 궁지에 몰린 영원, 신이 몸을 던져 감싸준 덕분에 간신히 그 자리에서 피하게 되었으나 인간을 초월한 인공지능의 힘을 깨닫게 된 영원은 두려움을 느낀다. 한편, 레이드라이저를 팔기 위해 자이아스펙을 일부러 폭주시키려는 현성을 막기 위해 복준과 삼동은 영원을 찾아와 휴머기어의 도움이 필요하다고 하는데…

현성은 횡령 등의 증거를 전부 삭제하며 비전 인텔리전스의 사장 자리를 계속 고집한다. 사장 해임을 거부하면서도 스스로의 무력함에 의기소침해있는 현성에게 인공지능 아이가 말을 건다. 아이와의 대화로 현성은 어릴 적 친구였던 강아지로봇 사우저를 떠올리고, 자신이 진심이 뭔지 깨닫는다. 그리고 제로원과 힘을 합쳐 아크를 쓰러뜨리려고 하는데…

제로원과 사우저의 합동 공격이란 예측 못 한 결론에 아크제로는 도망쳐 버린다. 한편, 아크의 목적이 위성 제아를 빼앗는 것이란 사실을 안 영원은 아크가 예측하지 못 할 새로운 가면라이더를 개발하리라 다짐한다. 그리고 그런 영원을 찾아온 뢰. 경계하는 영원이었지만 제아를 지키던 예전의 뢰로 돌아온 것임을 믿은 영원은 뢰, 신과 함께 아크가 있는 데이브레이크 타운으로 향하는데…

아크에게 제로원 드라이브를 빼앗기고 제아마저 잃고 만 영원. 하지만 포기하지 않고 고민에 고민을 거듭하여 생각한 자신의 꿈을 이즈에게 보여준다. 그리고 제아를 통해 영원과 아크가 싸우는 시뮬레이션을 반복한 끝에 가면라이더 제로투 드라이버를 완성시키고 아크를 쓰러뜨리는데 성공한다.

영원은 이즈와 함께 만든 가면라이더 제로투 드라이버로 아크를 쓰러뜨린다. 이에 분노한 아크는 도시 시스템을 파괴하며 인류에게 위협을 가한다. 도시 곳곳에서 패닉이 일어나자 영원은 비전 인텔리전스 이사진들의 동의를 얻어 휴머기어 사업을 재가동시키고 인력이 부족한 곳에 휴머기어를 투입시킨다. 그러자 아크는 휴머기어마저 없애버리려 한다. 그리고 아크의 뜻을 알게 된 멸은 영원과 손을 잡고 아크를 쓰러뜨린다.

아크는 사라졌으나 인류에게 악의가 존재하는 한 아크는 언제든 부활할 수 있다며 인류에게 선전포고하는 멸. 자신의 뜻에 찬성하는 휴머기어들을 모아 전쟁을 일으키려는 멸을 찾아간 이즈는 그의 마음을 돌리려 한다. 그런 이즈가 거슬렸던 멸은 끝내 이즈를 없애버리고 그 모습에 영원이 분노하는데…

자이아의 새로운 사장 윌리엄슨은 아크에게 해킹된 영원을 없애라며 경환과 유아에게 의뢰한다. 하지만 그 의뢰를 거절한 그들은 아크에게서 영원을 구해내기로 한다. 데이브레이크 타운으로 가는 길목에서 영원을 발견한 경환과 유아, 현성은 가면라이더로 변신하여 아크원과 싸우지만 영원은 그들이 변신하지 못하도록 벨트를 빼앗고 머릿속의 칩을 파괴한 뒤, 멸을 찾아 멸망신뢰의 아지트로 향한다.

영원이 아크가 된 것을 이유로 인류에게 전면전을 선포하는 멸, 멸의 말에 동요하던 휴머기어들이 압박을 가하자 영원은 신을 쓰러뜨린 자신의 행동을 후회한다. 곳곳에서 휴머기어의 대규모 시위가 발생하자 윌리엄슨은 무력을 이용해 그들을 진압하려 하는데…