在首都高速公路發生了大規模火災，當消防人員正忙著滅火時，配備著偵測器的防衛省特種部隊突然現身。這支部隊是專門處理惡靈所引發的災害，他們使用特殊武器將惡靈一個個消滅，火災原本已漸漸受到控制，但是…

除了防衛省超自然災害對策本部之外，環境省超自然災害對策室的成員也出動了，然而他們卻對被歸類為等級B惡靈的「火車」束手無策。最後，驅魔師「土宮神樂」揮刀將「火車」斬成兩半，本來以為事情就此解決，沒想到卻發生了最慘烈的事態…

超自然災害對策室每天的任務就是驅除惡靈，黃泉與對策室的成員們今天也依舊忙著驅除跋扈橫行於世間的惡靈。但是，唯有神樂仍被認為無法獨當一面，無法前往前線執勤，儘管神樂滿懷鬥志亟欲有一番表現…

黃泉從養父諫山奈落的口中得知，自己將與飯綱紀之結婚。雖然表面上這是一樁由雙方家長促成的姻親，但黃泉內心卻似乎很開心，也感到非常興奮。雖然她試著讓自己打扮得更像個女生，沒想到卻產生反效果…

黃泉與神樂在對付惡靈「山彥」時犯下了錯誤，遭到一向把黃泉當成親妹妹看待的諫山冥責備。冥的這番嚴厲斥責讓神樂感到頗為沮喪，神樂的阿千跟美紅這兩個同學阿千跟美紅也因此很擔心她。在同學們的鼓舞下，神樂總算是恢復了精神，沒想到此時卻有更嚴苛的考驗等待著她！

神樂順利擊退等級D的惡靈，但因為對方是她本來最喜歡的保健室老師，因此讓她產生後悔與苛責，她也開始對自己是否有能力繼續擔任退魔師產生疑問…。雖然神樂陷入自我厭惡，但是她的同班同學阿千與美紅仍不斷給予她鼓勵。

「諫山冥」因為殺生石而化為惡靈，她同時也喚醒了多數等級B的惡靈。就在此時，東北地區出現等級B的惡靈「火車」。超自然災害對策室成員隨即出動，黃泉也急忙趕往現場。沒想到在當地等待著他們的，竟然是操控著亂紅蓮的諫山冥！

黃泉身負瀕死的重傷後，雖然總算是恢復意識，但她的傷勢卻是嚴重到完全無法起身，甚至連聲音都發不出來…。即使如此，神樂仍努力地在一旁照顧黃泉。某天，神樂說出了她的真心話。如果兩人真的只是一對平凡的姊妹…

黃泉失蹤了。此時，一群惡靈成群結隊地出現在銀座的中心地帶，超自然災害對策室的成員也四處忙於驅魔。沒想到，失蹤的黃泉居然也現身在這些惡靈之中，這也讓對策室的成員們感到不知所措。

黃泉化為惡靈，並與神樂的父親「雅樂」展開對決！黃泉雖讓「雅樂」受到瀕死重傷，但自己也因為與「殺生石」無法順利融合而呈現不穩定狀態，意識也產生混濁。原本意識模糊的黃泉，突然又恢復了神智，此時她做出的行為是！？

黃泉前往富士的樹海，神樂也跟隨而來。神樂利用與「殺生石」的共鳴，找到了隱藏在密林中的黃泉。但是，那卻是一場極度悲傷的重逢。神樂與化為惡靈的黃泉對峙，結果…