Des androïdes, appelés Humanoïdes, ont fini par conquérir la Terre. Warius Zero était le capitaine du Karyu, un vaisseau de guerre avec lequel il a combattu les Humanoïdes. Comme le reste de la force de défense terrienne, il a dû lui aussi déposer les armes et remettre son vaisseau aux envahisseurs après la reddition.

Warius est intrigué par Marina qui ressemble comme deux gouttes d’eau à sa défunte épouse. Il parcourt son brillant dossier militaire et apprend avec surprise que pour être commandant en second sur le Karyu, elle a dû renoncer à un poste à l’État Major qui aurait été bien plus intéressant pour sa carrière. Cette incohérence intrigue Warius qui se demande quelles sont ses motivations profondes.

L’équipage du Karyu essaie de se roder avec les exercices de simulation préparés par Marina, mais la fréquence des entraînements commence à fatiguer l’équipage. Alors que Warius venait de décréter une pause pour l’équipage, le Karyu reçoit un message de détresse d’une station spatiale humanoïde qui est attaquée par des pirates. Warius ordonne de leur porter secours car il espère que l’assaillant est Albator.

Le Karyu se rend à Heavy Melder dans le village de Gun Frontier pour essayer de trouver une chasseuse de prime nommée Sylviana. Grenadier pense qu’elle doit probablement avoir des informations sur Albator car elle court après l’énorme prime qui est actuellement sur sa tête. Cependant, c’est un caractère têtu et Grenadier (Axel Lutter) ne peut pas du tout garantir qu’elle acceptera de collaborer avec eux. Warrius décide donc d’envoyer Grenadier, Ishikura et deux autres hommes en mission de reconnaissance. Leur objectif est de trouver des informations sans prendre de risques inutiles ou tenter quoi que ce soit d’autre.

Cet épisode reprend là où s’était arrêté l’épisode 5. Suite à un malentendu Toshirô a été capturé par les habitants de Gun Frontier pour être pendu. Albator arrive avec son Death Shadow et semble apprécier très moyennement de voir son meilleur ami attaché au bout d’une corde. Les canons du vaisseau sont pointés sur eux et les bourreaux se doutent bien qu’aucun d’eux n’en réchappera. Mais Sylviana ne baisse pas les bras, elle provoque Albator en lui demandant s’il comptait les tuer du haut de son vaisseau ou s’il aurait le courage de se battre comme un homme.

Warius est alerté par le quartier général qu’Albator est en train d’attaquer une planète. Ses coordonnées sont transférées à l’ordinateur de bord et le Karyu se met en route pour tenter d’intercepter le Death Shadow. Pour gagner un peu de temps Warius autorise les chasseurs à décoller car leur rapidité est supérieure à celle de Karyu, ils ont pour mission de faire le point sur la situation et d’intervenir dans la mesure du possible, cependant, leur puissance de feu s’avère insuffisante face au blindage du Death Shadow.

Marina a été assommée par le souffle de l’explosion provoquée par le dispositif laissé par la mystérieuse Hell Maetel. L’équipage arrive pour éteindre l’incendie mais ne peut entrer dans la fournaise. Warius ne peut se résoudre à laisser Marina au milieu des flammes et tente d’aller la chercher seul. Il finit par la trouver, à moitié inconsciente. La chaleur a endommagé son corps mécanique qui est à présent mis à nu. Heureusement pour Warius, une fois qu’il a trouvé Marina, le système anti-incendie se met en marche et éteint le feu (ça fait bien 10 minutes que c’est la fournaise et qu’il y a des explosions partout, mais le système anti-incendie a gentiment attendu que Warius joue au héro pour s’enclencher… ça sent vraiment le scénario au rabais…).

Marina répertorie les attaques liées à l’Ombre de la Mort (Death Shadow) et constate que quelque chose cloche. Elle a relevé le fait que quatre attaques ont eu lieu au même moment et à des endroits très éloignés les uns des autres. Pour le spectateur normal, il est évident qu’Albator ne peut être le seul responsable et qu’il existe forcément des copies de l’Ombre de la Mort, mais pour Warius et son cerveau de batracien, c’est trop simple, il réfléchit (pas trop quand même) et se demande si Albator n’a pas mis au point un système de déplacement instantané (ce qui n’expliquerait pas pour autant qu’il soit à plusieurs endroits en même temps).

Warius veut se rendre sur la planète Technologia pour la protéger de l’attaque du Hell Castel. Malheureusement, pour y arriver à temps, il doit traverser la Nébuleuse de Magellan en empruntant le Pont Galactique, une zone gazeuse avec un fort champ magnétique. Mais ce n’est pas le seul danger qui les attend : le Hell Castel a fait exploser une petite planète en tuant tous les habitants qui s’y trouvaient et ses débris forment à présent un champ d’astéroïdes qui fonce sur le Karyu.

Dans l’épisode précédent, le Karyu a été obligé de traverser un nuage de gaz magnétique pour rejoindre la planète Technologia. À cause des interférences, les humanoïdes ont dû être débranchés. Maintenant que le champ magnétique a disparu, ils peuvent être réactivés. Ishikura se charge personnellement de réactiver l’Officier Navigateur avec qui il venait juste de commencer à sympathiser. Ce dernier est ravi de voir qu’Ishikura a fini par changer d’attitude à son égard.

Le Gouverneur humanoïde a été forcé par Hell Maetel à fusionner avec le cœur du Hell Castel. Grâce à cette fusion, la forteresse volante a gagné en puissance et est devenue le prolongement du corps du Gouverneur. Ce dernier est tellement grisé par sa nouvelle puissance qu’il se laisse dominer par ses émotions et n’a plus qu’une seule idée en tête : vaincre Warius et son Karyu.

Albator va tenter d’abattre le Hell Castle en profitant du temps de latence de 0,13 seconde pendant lequel il est vulnérable. Ce délai correspond au moment où il arrête son champ gravitationnel, juste avant de tirer. Tous les vaisseaux de la flotte rebelle ont connecté leur armement avec l’ordinateur de l’Ombre de la Mort pour que leurs tirs soient synchronisés et visent le même endroit.