Nagisa s'est effondrée dans la cour de récréation, malade à force d'attendre Tomoya sous la pluie. Heureusement, ce dernier l'a emmenée suffisamment vite chez elle pour que le pire soit évité. Après un peu de repos, elle pourra revenir au lycée, où Tomoya continue de rencontrer plein de filles plus étranges les unes que les autres.

Tomoya essaie de convaincre Kotomi de rejoindre le club de théâtre, mais pour ça, il va d'abord l'aider à se faire des amis...

Nagisa demande à M. Kômura de lui servir de superviseur, mais il a déjà accepté d'être celui de la chorale. À cette occasion, une fille de la chorale cherchera à la dissuader de recourir à M. Kômura, à l'origine superviseur de la troupe de théâtre, ce qui rend Sunohara furieux.

Constatant les relations dégradées entre Tomoya et son père, Nagisa lui propose de venir habiter chez lui. Un tout nouveau quotidien s'offre à Tomoya, mais il n'ira pas sans son lot d'incertitudes.

Nagisa a l'impression de devoir s'excuser auprès de ses parents, mais elle ne sait pas pourquoi. Tomoya essaiera de tirer les vers du nez d'Akio et Sanae, avec des résultats en demi-teinte.

Nagisa a découvert la vérité. Sous le choc, elle n'est plus capable de jouer et se sent coupable des choix de ses parents. Tomoya essaie de lui remonter le moral, mais rien n'y fait, et la pièce va commencer...

Mei s'inquiète pour son frère. Tomoya a alors l'idée tout sauf lumineuse de lui chercher une copine fictive pour rassurer sa sœur. Il est éconduit par plusieurs filles, jusqu'à ce qu'une bonne âme lui propose son appui...

Tomoya et Nagisa amènent à manger à Sunohara sur le conseil de Sanae, mais alors qu'ils arrivent à son dortoir, il est en train de se faire violenter par Misae. Comme d'habitude, c'est lui le fautif...

Tomoya, Nagisa et Sunohara prennent le thé dans la salle de Miyazawa. C'est alors que débarque Sudô, un voyou blessé semblant connaître cette dernière.

La grossesse de Nagisa arrive bientôt à son terme. Tous leurs amis viennent la féliciter au Nouvel An.

La tragédie qui a frappé Tomoya l'a laissé atone. Alors que les Furukawa s'occupent d'Ushio, Sanae fait tout pour qu'il reprenne sa vie et sa fille en main.

Conformément au plan de Sanae, Tomoya et Ushio entament un voyage. Qu'est-ce qui attend le jeune père et sa fille tout au bout du chemin ?

Comme sa mère avant elle, Ushio est tombée malade à 5 ans. Tomoya est meurtri par la nouvelle, alors que dans le monde parallèle, les choses semblent brusquement s'accélérer.

La tragédie frappe à nouveau Tomoya, qui cette fois, n'y survit pas. La famille Okazaki va-t-elle vraiment connaître une fin aussi atroce ?