Oliver Atom (Tsubasa Ozora) es un jugador de los Brancos de Brasil (Sao Paulo). Mientras se desarrolla el partido final frente a Domingo (Palmeiras), Oliver rememora su época juvenil, en la que comenzó a jugar en el Nankatsu junto a Bruce Harper (Ryo Ishizaki). Su primer partido fue contra el equipo San Francis, en el que conoce a Benji Price (Genzo Wakabayashi). Una vez que el partido finaliza, un extraño personaje hace su aparición...

El personaje se presenta como Roberto Zedinho (Roberto Hongo), quien se ofrece como entrenador del equipo de Nankatsu, comprometiéndose a enseñarles nuevas técnicas de juego. Roberto les muestra lo que es la "chilena", y es Oliver el primero en intentar dominar el movimiento.

Tom Misaki (Taro Misaki) es un gran apasionado del fútbol, que constantemente debe mudarse de una ciudad a otra a causa del trabajo de su padre, que esta vez vuelve a Niupi, ciudad en la que ya había estado anteriormente. Comienza el torneo de la ciudad de Niupi, donde las 4 principales primarias se enfrentarán. La final se desarrolla nuevamente entre el Nankatsu de Oliver y el San Francis de Benji. Bruce logra leer los pases de Oliver, pero su cuerpo no es lo suficientemente rápido como para alcanzarlos. Durante el partido llega Tom, quien inmediatamente es incorporado al equipo, y junto a Oliver crean grandes jugadas.

Se crea la selección de la Ciudad de Niupi, integrada por los mejores jugadores del torneo de la ciudad, entre los que quedaron Oliver, Bruce, Tom y Benji. Hace su aparición el poderoso Steve Hyuga (Kojiro Hyuga), un delantero muy fuerte, goleador del equipo Franco Canadiense.

En el primer partido del Niupi, los jugadores deciden no pasarse el balón entre ellos, ya que provenían de diferentes escuelas. Benji les advierte que si aprenden a jugar en equipo podrán ganar todos sus partidos, y así es que el Niupi empieza a demostrar todo su poder. En uno de los partidos Benji se lesiona el brazo, por lo que Oliver se convierte en el nuevo capitán. El Nankatsu llega a la final, donde luchará por conseguir una plaza en la Liga Nacional.

Comienza la Liga Nacional, donde los mejores equipos de las mejores ciudades se enfrentarán. El Niupi se lleva una gran sorpresa al descubrir quien será su primer rival. Al estar Benji lesionado, su reemplazo es Al Crocket (Yuzo Morisaki), un arquero miedoso e ineficaz que no logra parar los tiros de los rivales.

El Niupi no concreta victorias, y se dificulta su pase a las semifinales. Se presenta Andy Johnson (Misugi Jun), muy hábil jugador del equipo Colegio Alemán (siguiente rival del Niupi), quien sufre de mal funcionamiento en su corazón. Pese a esto arriesga su vida solo para enfrentarse y derrotar a Oliver jugando el partido completo.

Oliver se entera del problema en el corazón de Andy, y debe decidir si dejar ganar a Andy para proteger su salud, o vencerlo y dejar que arriesgue su vida.

Hyuga del Franco Canadiense es el siguiente rival de Oliver, en la esperada final del Torneo Nacional. El nivel de juego del Niupi es mucho mejor que cuando se enfrentaron en las preliminares. En el Franco Canadiense se presenta el poderoso arquero Richard Tex-Tex (Ken Wakashimazu), cuyas habilidades adquirió tras haber entrenado artes marciales durante años.

Luego del agónico empate del Niupi, comienza el tiempo extra, donde se definirá al campeón del Torneo.

Oliver y Hyuga son invitados a ser parte de la escuela Toho, la de mejor reputación de Japón en cuanto a futbol. Benji decide continuar desarrollando sus habilidades en otro club, mientras que Tom y su padre deben mudarse nuevamente, esta vez a Francia. Oliver comienza a practicar el "Tiro con chanfle", disparo enseñado por Roberto, quien toma una gran decisión.

Oliver recuerda durante todo el episodio desde sus inicios en el Nankatsu hasta el último partido de la Liga Nacional, mientras se desarrolla el partido entre los Brancos (Sao Paulo) y Domingo (Palmeiras).

Comienza un nuevo torneo Nacional, en el que Hyuga, Ralph Melo (Takeshi Sawada) y Richard ya son miembros del colegio Toho. El estilo de juego de la escuela no convence a Hyuga, quien va a ver a su antiguo entrenador, abandonando a su equipo en pleno torneo. El Niupi por su parte se enfrenta al equipo de Otomo, quien tiene al jugador David Everett (Shun Nitta) con su "Tiro del Halcón". Hyuga por su parte desarrolla el poderoso "Tiro del Tigre".

Victor Clifford (Hiroshi Jito) es el corpulento y agresivo capitan de Los Halcones (Hirado). Se une al equipo solo para derrotar a Oliver. Hace excelentes combinaciones con su compañero Rigo (Mitsuru Sano), al tiempo que golpea con su cuerpo duramente a los integrantes del Niupi. Le da un choque especialmente duro a Oliver.

El siguiente partido del Niupi es contra el Furano (Flynet), con su hábil capitan Armand Callahand (Hikaru Matsuyama). Oliver siente dolor por la lesión que le provocó el golpe contra Victor en el partido anterior, lo que complica su juego.

El Niupi deberá jugar nuevamente contro el Toho en la final del torneo. La lesión en el hombro de Oliver hace que peligre su futuro en el fútbol, por eso Benji le recomienda a su médico para que lo vea. A su vez, Benji le dice a Oliver que juegue en el exterior para mejorar su estilo de juego, ya que ahora que juega en el Hamburgo de Alemania comprobó por él mismo el altísimo nivel internacional.

El entrenador de Toho no quiere que Hyuga juegue el partido final, sabiendo incluso que es el jugador más talentoso del mismo, por haber abandonado al equipo en pleno Torneo. Al mismo tiempo, Oliver corre riesgo de agravar la lesión de su hombro si se presenta en este partido, pero su decisión es la de jugar y vencer nuevamente al equipo de Hyuga.

Sin la presencia de Oliver en la cancha, Hyuga realiza su "Tiro de tigre" anotando sin problemas. Sin embargo, Oliver ingresa al campo, arriesgando su lesión.

LLega el final del partido, Oliver ya no soporta el dolor pero quiere dar todo de sí para ganar por tercera vez.

Comienzan los entrenamientos para el seleccionado juvenil de Japón, donde fueron convocados los mejores jugadores del anterior torneo, entre ellos Hyuga, Richard, Melo, Bruce y Callahan. Entre las sorpresas esta Andy Johnson, que fue convocado como director técnico en vez de como jugador, y que la lesión de Oliver tal vez sea muy prolongada, por lo que no puede jugar los primeros partidos. La selección viaja rumbo a Francia, donde a su vez encontraran a Tom Misaki para jugar sus partidos.

Japón juega su amistoso frente al Hamburgo, que tiene a Benji como arquero y como delantero a Schneider, uno de los mejores jugadores del mundo. El equipo alemán no demuestra buen nivel de juego, lo que permite a Japón atacar con todo, sin embargo el "Huracán en el cielo" de Kazuo y Masao Tachibana, el "Tiro del halcón" de Nitta y el "Tiro Navaja" de Soda no entran en el arco rival, siendo que Benji para todos los tiros. Para empeorar la situación, el Hamburgo decide jugar seriamente, dejando en vergüenza a los japoneses.

Japón juega otro amistoso, esta vez con la selección de Italia, donde conocen a Gino Hernández (uno de los mejores arqueros del mundo). Sin embargo, el evento sufre un cambio drástico. En otro partido amistoso, se ve la presencia de Oliver, lo que hace que el ritmo y nivel de juego mejore notoriamente.

Ya en París, se ve a Misaki tratando de ser convencido de ingresar a un equipo francés, cuando de pronto aparece el jugador y capitán de la selección juvenil de Francia, Pierre Le Blanc (El Sid Pierre), quien desafía a Tom. Comienza el Campeonato Juvenil Internacional, y Japón juega el partido de apertura contra Italia. Ambos equipos demuestran gran nivel, pero los italianos comienzan a dar duras faltas a Oliver. El arquero Gino Hernández de Italia demuestra su gran talento.

Ingresa Tom Misaki, quien realiza junto a Oliver la Combinación Dorada para contrarrestar la eficacia de la selección de Italia. Hyuga demuestra el poder de su "Nuevo Tiro del Tigre". Alemania le gana 4 a 0 a Canadá con 3 goles de Schneider, y Uruguay le gana 3 a 1 a Bélgica con 3 goles de Victorino. Francia se enfrenta a Inglaterra, y sus estrellas Napoleon y Pierre muestran su gran nivel.

El próximo partido de Japón es contra la selección juvenil de Argentina, quienes en su partido contra Italia ganaron 5 a 0, por eso a los japoneses solo les sirve ganar para pasar a la siguiente fase. Los albicelestes tienen a Juan Diaz, un genio del fútbol, y a su siempre compañero Pascal, quien también es muy habilidoso.

Llegan las semifinales. Alemania juega contra Uruguay, y Japón enfrentará al local: Francia. Pese al buen juego de los japoneses, Pierre y Napoleón demuestran sus magníficas habilidades.

El partido es extremadamente difícil para Japón, y para empeorar las cosas el árbitro parece tomar decisiones que favorecen al equipo francés.

Luego del empate, inician los tiempos extras para desempatar, y determinar cuál será la nación finalista.

Llega el momento de la final. Benji aprovechó su tiempo jugando en Alemania, y hace informes de cada jugador para que el equipo japonés sepa sus debilidades; sin embargo, el arquero alemán Müller es una incógnita incluso para su propio equipo.

La selección alemana tiene un nivel excepcional. Roberto esta en el estadio viendo el partido, y le hace llegar un mensaje en clave a Oliver, quien gracias al mismo descubre cómo ganar el partido...

Japón logró la ventaja, pero saben que Alemania no se dejará vencer tan fácilmente...

Oliver empieza su carrera como profesional viajando a Brasil. Como primer objetivo, debe pasar la prueba que ofrece el equipo de los Brancos (Sao Paulo), donde conoce a un humilde jugador llamado Pepe.

Estaba amaneciendo, y el encargado de limpiar las canchas se dispone a realizar su trabajo, cuando escucha el llanto de un bebé. Para su sorpresa, el mismo esta en el medio de la cancha, al pie de la sombra del Corcovado, lo que parece indicar que es el hijo de Dios. El próximo partido de Oliver será el que enfrente los Brancos contra Domingo, equipo en el que juega como capitán el jugador Santana, el "cyborg" del fútbol.

Oliver reta a Santana, y ambos deciden dar lo mejor de sí para ganar el partido. Sin embargo, Carlos no quiere jugar en equipo, lo que a Oliver no le cuesta trabajo.

Oliver emprende su nuevo camino como profesional mirando a Europa. Viajando en su avión, sueña que juega en un nuevo equipo, enfrentando a Benji en un partido de final europea. El club con el cual había soñado que era miembro es el Cataluña de España (Barcelona), y cuando se da cuenta decide convertirse en jugador del mismo. Hyuga se convierte en miembro del Piamonte de Italia (Juventus). Oliver muestra sus habilidades frente a sus nuevos compañeros.

La llegada de Mark a Piamonte es mal recibida por sus compañeros, lo que genera conflictos con los mismos, llegando incluso a enfrentarse a golpes con uno de ellos. La selección japonesa se va preparando para un partido especial...

La selección japonesa vuelve a entrenar, luego de 3 años sin encontrarse como compañeros. El nuevo rival es la selección de Holanda, que decide no llevar a sus jugadores titulares para enfrentarse con una selección de tan "bajo nivel" como la nipona.

La selección japonesa comienza sus duros entrenamientos para enfrentar a Holanda, al tiempo que hace su aparición en el seleccionado el jugador Terry, desconocido tanto por el público como por los jugadores, ya que de pequeño fue estafado y llevado a Italia con promesas de fútbol. Sin embargo Terry encuentra la manera de salir adelante y progresa, llegando a jugar en el Inter de Milán.

Comienza el partido contra Holanda, y sus jugadores inmediatamente muestran su brutalidad, combinadas con gran velocidad e impenetrable defensa, lo que hace que en poco tiempo se pongan en ventaja frente a un sorprendido e impotente equipo japonés.

La defensa holandesa es un auténtico muro. La selección japonesa debe encontrar la manera de penetrarla, si es que quiere concluir el partido con un buen resultado a favor.

A pesar de que el resultado contra Holanda fue muy bien aceptado, el equipo siente que no tiene el nivel suficiente como para enfrentar a las naciones grandes del fútbol, por eso deciden reforzar su entrenamiento para convertirse en jugadores más fuertes y de mejor calidad.

Oliver regresa a España para unirse al campus del F.C. Catalunya. En el primer día, Oliver desafía a Rivaul a un partido de uno contra uno y es derrotado. En Italia, el preparador físico del F.C. Piemonte, Mazzantini, le dice a Mark que es un fracaso como jugador de fútbol por su cuerpo desequilibrado.

En el segundo día del campus del F.C.Catalunya, el entrenador prepara un partido de entrenamiento. Oliver fue derrotado por Rivaul el día anterior, pero se enfrenta de nuevo a Rivaul. Oliver es derrotado, pero no se da por vencido.

En el campo del Catalunya, el entrenador prueba a Oliver en diferentes posiciones del equipo A, y Oliver se desempeña bien en todas las posiciones. Al mismo tiempo, en Piamonte, Mark recibe el respeto de sus compañeros por su potente disparo. Cuando se anuncia que Mark debutará como titular en su equipo en el partido inaugural, el entrenador de Oliver avisa a éste de tal noticia.

El entrenador le dice a Oliver que juegue en el Catalunya B en la segunda división en vez de en el primer equipo. Los antiguos compañeros de equipo de Oliver reciben esta noticia. Mark le dice que se vaya a Italia, pero él se niega diciendo que no puede abandonar. Oliver corre por las calles de Barcelona para luchar contra el dolor y recupera la esperanza en una colina desde la que se ve toda la ciudad.

Mark juega el partido inaugural en la liga italiana contra el A.C. Emilia como jugador titular. El partido comienza y Mark es detenido por la defensa de Emilia, que a su vez, le hace perder el equilibrio. Sin embargo, utiliza el ingenio dando una asistencia y deja que el otro delantero, Franchesco, marque el primer gol para el equipo. Los aficionados están contentos con la primera asistencia de Mark, pero el árbitro hace sonar el silbato.

Mark juega su primer partido en la Liga Italiana, pero una defensa fuerte y sólida le impide disparar a la portería. Él es sustituido en el minuto 31 de la primera mitad. Deja el campo entre lágrimas y jura mejorar su equilibrio físico para ser un jugador regular. Por otro lado, Oliver juega un partido de la segunda división española con el ánimo renovado.

El entrenador del Catalunya, Eduard, pide a Oliver que marque 10 goles y de 10 asistencias en la segunda división en un año. Oliver intenta hacerlo en un solo partido, su partido de debut. Marca 6 goles y da 4 asistencias e impresiona al público. Mark en Italia y Karl Heinz Schneider en Alemania apoyan a Oliver por su amistad y por su objetivo común de ganar la Copa del Mundo con la selección nacional de Japón.

El Gruenbald de Benji Price juega contra el campeón de la Liga Alemana, el Routburg de Schneider. El Gruenbald anota primero por el juego inteligente de Benji Price y Kaltz, pero la estrategia de pases del Routburg lleva a la anotación de Schneider. Benji Price, Schneider y Kaltz solían ser compañeros de equipo, pero ahora son enemigos. Schneider provoca a Kaltz para que lo golpee, y Kaltz es expulsado. Benji Price trata de empatar el partido con un tiro libre en el tiempo de descuento pero falla y Schneider aprovecha para anotar el gol del triunfo.

Oliver cumple con el requisito del entrenador Eduard de anotar 10 goles y 10 asistencias para el equipo B de Catalunya, consiguiendo así jugar en el primer equipo. El viejo rival de Oliver en Brasil, Santana, es fichado por el rival del Catalunya, el equipo de San José en la Liga española. Rivaul se lesiona durante el partido contra San José, y Oliver entra a jugar contra Santana.

Rivaul está lesionado y Oliver tiene su primera oportunidad de jugar en el primer equipo del Catalunya. Su rival Santana juega magníficamente pero Oliver logra marcar un gol para empatar el partido. Mark también aprovecha los últimos 5 minutos de juego y muestra sus resultados de su entrenamiento anotando el gol de la victoria. Benji también detiene el disparo de su rival, Schneider, en el último partido de la Liga Alemana. El equipo japonés se reúne ahora en Japón para jugar los partidos de la Copa Mundial.