Oliver Atom (Tsubasa Ozora) es un jugador de los Brancos de Brasil (Sao Paulo). Mientras se desarrolla el partido final frente a Domingo (Palmeiras), Oliver rememora su época juvenil, en la que comenzó a jugar en el Nankatsu junto a Bruce Harper (Ryo Ishizaki)h. Su primer partido fue contra el equipo San Francis, en el que conoce a Benji Price (Genzo Wakabayashi). Una vez que el partido finaliza, un extraño personaje hace su aparición...

El personaje se presenta como Roberto Zedinho (Roberto Hongo), quien se ofrece como entrenador del equipo de Nankatsu, comprometiéndose a enseñarles nuevas técnicas de juego. Roberto les muestra lo que es la "chilena", y es Oliver el primero en intentar dominar el movimiento.

Tom Misaki (Taro Misaki) es un gran apasionado del fútbol, que constantemente debe mudarse de una ciudad a otra a causa del trabajo de su padre, que esta vez vuelve a Niupi, ciudad en la que ya había estado anteriormente. Comienza el torneo de la ciudad de Niupi, donde las 4 principales primarias se enfrentarán. La final se desarrolla nuevamente entre el Nankatsu de Oliver y el San Francis de Benji. Bruce logra leer los pases de Oliver, pero su cuerpo no es lo suficientemente rápido como para alcanzarlos. Durante el partido llega Tom, quien inmediatamente es incorporado al equipo, y junto a Oliver crean grandes jugadas.

Se crea la selección de la Ciudad de Niupi, integrada por los mejores jugadores del torneo de la ciudad, entre los que quedaron Oliver, Bruce, Tom y Benji. Hace su aparición el poderoso Steve Hyuga (Kojiro Hyuga), un delantero muy fuerte, goleador del equipo Franco Canadiense.

En el primer partido del Niupi, los jugadores deciden no pasarse el balón entre ellos, ya que provenían de diferentes escuelas. Benji les advierte que si aprenden a jugar en equipo podrán ganar todos sus partidos, y así es que el Niupi empieza a demostrar todo su poder. En uno de los partidos Benji se lesiona el brazo, por lo que Oliver se convierte en el nuevo capitán. El Nankatsu llega a la final, donde luchará por conseguir una plaza en la Liga Nacional.

Comienza la Liga Nacional, donde los mejores equipos de las mejores ciudades se enfrentarán. El Niupi se lleva una gran sorpresa al descubrir quien será su primer rival. Al estar Benji lesionado, su reemplazo es Al Crocket (Yuzo Morisaki), un arquero miedoso e ineficaz que no logra parar los tiros de los rivales.

El Niupi no concreta victorias, y se dificulta su pase a las semifinales. Se presenta Andy Johnson (Misugi Jun), muy hábil jugador del equipo Colegio Alemán (siguiente rival del Niupi), quien sufre de mal funcionamiento en su corazón. Pese a esto arriesga su vida solo para enfrentarse y derrotar a Oliver jugando el partido completo.

Oliver se entera del problema en el corazón de Andy, y debe decidir si dejar ganar a Andy para proteger su salud, o vencerlo y dejar que arriesgue su vida.

Hyuga del Franco Canadiense es el siguiente rival de Oliver, en la esperada final del Torneo Nacional. El nivel de juego del Niupi es mucho mejor que cuando se enfrentaron en las preliminares. En el Franco Canadiense se presenta el poderoso arquero Richard Tex-Tex (Ken Wakashimazu), cuyas habilidades adquirió tras haber entrenado artes marciales durante años.

Luego del agónico empate del Niupi, comienza el tiempo extra, donde se definirá al campeón del Torneo.

Oliver y Hyuga son invitados a ser parte de la escuela Toho, la de mejor reputación de Japón en cuanto a futbol. Benji decide continuar desarrollando sus habilidades en otro club, mientras que Tom y su padre deben mudarse nuevamente, esta vez a Francia. Oliver comienza a practicar el "Tiro con chanfle", disparo enseñado por Roberto, quien toma una gran decisión.

Comienza un nuevo torneo Nacional, en el que Hyuga, Ralph Melo (Takeshi Sawada) y Richard ya son miembros del colegio Toho. El estilo de juego de la escuela no convence a Hyuga, quien va a ver a su antiguo entrenador, abandonando a su equipo en pleno torneo. El Niupi por su parte se enfrenta al equipo de Otomo, quien tiene al jugador David Everett (Shun Nitta) con su "Tiro del Halcón". Hyuga por su parte desarrolla el poderoso "Tiro del Tigre".

Tsubasa's last national junior high school soccer championship opens. Tsubasa's worried about Hyuga not playing for Toho school. Nankatsu plays their first game against a big guy, Jito's Hirado junior high. Jito charges at Tsubasa for power defense.

El siguiente partido del Niupi es contra el Furano (Flynet), con su hábil capitan Armand Callahand (Hikaru Matsuyama). Oliver siente dolor por la lesión que le provocó el golpe contra Victor en el partido anterior, lo que complica su juego.

El Niupi deberá jugar nuevamente contro el Toho en la final del torneo. La lesión en el hombro de Oliver hace que peligre su futuro en el fútbol, por eso Benji le recomienda a su médico para que lo vea. A su vez, Benji le dice a Oliver que juegue en el exterior para mejorar su estilo de juego, ya que ahora que juega en el Hamburgo de Alemania comprobó por él mismo el altísimo nivel internacional.

El entrenador de Toho no quiere que Hyuga juegue el partido final, sabiendo incluso que es el jugador más talentoso del mismo, por haber abandonado al equipo en pleno Torneo. Al mismo tiempo, Oliver corre riesgo de agravar la lesión de su hombro si se presenta en este partido, pero su decisión es la de jugar y vencer nuevamente al equipo de Hyuga.

Sin la presencia de Oliver en la cancha, Hyuga realiza su "Tiro de tigre" anotando sin problemas. Sin embargo, Oliver ingresa al campo, arriesgando su lesión.

Llega el final del partido, Oliver ya no soporta el dolor pero quiere dar todo de sí para ganar por tercera vez.

Comienzan los entrenamientos para el seleccionado juvenil de Japón, donde fueron convocados los mejores jugadores del anterior torneo, entre ellos Hyuga, Richard, Melo, Bruce y Callahan. Entre las sorpresas esta Andy Johnson, que fue convocado como director técnico en vez de como jugador, y que la lesión de Oliver tal vez sea muy prolongada, por lo que no puede jugar los primeros partidos. La selección viaja rumbo a Francia, donde a su vez encontraran a Tom Misaki para jugar sus partidos.

Japón juega su amistoso frente al Hamburgo, que tiene a Benji como arquero y como delantero a Schneider, uno de los mejores jugadores del mundo. El equipo alemán no demuestra buen nivel de juego, lo que permite a Japón atacar con todo, sin embargo el "Huracán en el cielo" de Kazuo y Masao Tachibana, el "Tiro del halcón" de Nitta y el "Tiro Navaja" de Soda no entran en el arco rival, siendo que Benji para todos los tiros. Para empeorar la situación, el Hamburgo decide jugar seriamente, dejando en vergüenza a los japoneses.

Japón juega otro amistoso, esta vez con la selección de Italia, donde conocen a Gino Hernández (uno de los mejores arqueros del mundo). Sin embargo, el evento sufre un cambio drástico. En otro partido amistoso, se ve la presencia de Oliver, lo que hace que el ritmo y nivel de juego mejore notoriamente.

Ya en París, se ve a Misaki tratando de ser convencido de ingresar a un equipo francés, cuando de pronto aparece el jugador y capitán de la selección juvenil de Francia, Pierre Le Blanc (El Sid Pierre), quien desafía a Tom. Comienza el Campeonato Juvenil Internacional, y Japón juega el partido de apertura contra Italia. Ambos equipos demuestran gran nivel, pero los italianos comienzan a dar duras faltas a Oliver. El arquero Gino Hernández de Italia demuestra su gran talento.

Ingresa Tom Misaki, quien realiza junto a Oliver la Combinación Dorada para contrarrestar la eficacia de la selección de Italia. Hyuga demuestra el poder de su "Nuevo Tiro del Tigre". Alemania le gana 4 a 0 a Canadá con 3 goles de Schneider, y Uruguay le gana 3 a 1 a Bélgica con 3 goles de Victorino. Francia se enfrenta a Inglaterra, y sus estrellas Napoleon y Pierre muestran su gran nivel.

El próximo partido de Japón es contra la selección juvenil de Argentina, quienes en su partido contra Italia ganaron 5 a 0, por eso a los japoneses solo les sirve ganar para pasar a la siguiente fase. Los albicelestes tienen a Juan Diaz, un genio del fútbol, y a su siempre compañero Pascal, quien también es muy habilidoso.

Llegan las semifinales. Alemania juega contra Uruguay, y Japón enfrentará al local: Francia. Pese al buen juego de los japoneses, Pierre y Napoleón demuestran sus magníficas habilidades.

El partido es extremadamente difícil para Japón, y para empeorar las cosas el árbitro parece tomar decisiones que favorecen al equipo francés.

Luego del empate, inician los tiempos extras para desempatar, y determinar cuál será la nación finalista.

Llega el momento de la final. Benji aprovechó su tiempo jugando en Alemania, y hace informes de cada jugador para que el equipo japonés sepa sus debilidades; sin embargo, el arquero alemán Müller es una incógnita incluso para su propio equipo.

La selección alemana tiene un nivel excepcional. Roberto esta en el estadio viendo el partido, y le hace llegar un mensaje en clave a Oliver, quien gracias al mismo descubre cómo ganar el partido...

Japón logró la ventaja, pero saben que Alemania no se dejará vencer tan fácilmente...

Oliver empieza su carrera como profesional viajando a Brasil. Como primer objetivo, debe pasar la prueba que ofrece el equipo de los Brancos (Sao Paulo), donde conoce a un humilde jugador llamado Pepe.

Estaba amaneciendo, y el encargado de limpiar las canchas se dispone a realizar su trabajo, cuando escucha el llanto de un bebé. Para su sorpresa, el mismo esta en el medio de la cancha, al pie de la sombra del Corcovado, lo que parece indicar que es el hijo de Dios. El próximo partido de Oliver será el que enfrente los Brancos contra Domingo, equipo en el que juega como capitán el jugador Santana, el "cyborg" del fútbol.

Santana es un verdadero genio del fútbol, sin embargo, su vida estuvo llena de tristezas. De niño decidió ser el mejor jugador de todos, y hoy es el más importante de Brasil.

Oliver reta a Santana, y ambos deciden dar lo mejor de sí para ganar el partido. Sin embargo, Carlos no quiere jugar en equipo, lo que a Oliver no le cuesta trabajo.

Oliver emprende su nuevo camino como profesional mirando a Europa. Viajando en su avión, sueña que juega en un nuevo equipo, enfrentando a Benji en un partido de final europea. El club con el cual había soñado que era miembro es el Cataluña de España (Barcelona), y cuando se da cuenta decide convertirse en jugador del mismo. Hyuga se convierte en miembro del Piamonte de Italia (Juventus). Oliver muestra sus habilidades frente a sus nuevos compañeros.

La llegada de Hyuga a Piamonte es mal recibida por sus compañeros, lo que genera conflictos con los mismos, llegando incluso a enfrentarse a golpes con uno de ellos. La selección japonesa se va preparando para un partido especial...

La selección japonesa vuelve a entrenar, luego de 3 años sin encontrarse como compañeros. El nuevo rival es la selección de Holanda, que decide no llevar a sus jugadores titulares para enfrentarse con una selección de tan "bajo nivel" como la nipona.

La selección japonesa comienza sus duros entrenamientos para enfrentar a Holanda, al tiempo que hace su aparición en el seleccionado el jugador Aoi Shingo, desconocido tanto por el público como por los jugadores, ya que de pequeño fue estafado y llevado a Italia con promesas de fútbol. Sin embargo Aoi encuentra la manera de salir adelante y progresa, llegando a jugar en el Inter de Milán.

Comienza el partido contra Holanda, y sus jugadores inmediatamente muestran su brutalidad, combinadas con gran velocidad e impenetrable defensa, lo que hace que en poco tiempo se pongan en ventaja frente a un sorprendido e impotente equipo japonés.

La defensa holandesa es un auténtico muro. La selección japonesa debe encontrar la manera de penetrarla, si es que quiere concluir el partido con un buen resultado a favor.

A pesar de que el resultado contra Holanda fue muy bien aceptado, el equipo siente que no tiene el nivel suficiente como para enfrentar a las naciones grandes del fútbol, por eso deciden reforzar su entrenamiento para convertirse en jugadores más fuertes y de mejor calidad.

Hyuga y Oliver comienzan a meterse dentro de sus respectivos clubes, ambos descubriendo que su condición física es aun muy baja para jugar en las ligas profesionales europeas.

En el segundo día del campamento de F.C. Catalunya, el entrenador establece un partido de entrenamiento. Oliver fue derribado por Rivaul el día anterior, pero vuelve a jugar contra Rivaul detrás de las dos mejores posiciones en el equipo B. Oliver es derribado, pero sigue desafiando.

En el campo de Catalunya, el entrenador prueba a Oliver en diferentes posiciones en el equipo A, y Oliver se desempeña bien en todas las posiciones. Al mismo tiempo, en Piemonte, Hyuga recibe el respeto de sus compañeros por su potente disparo. Cuando se establece que Hyuga se estrenará como miembro titular de su equipo en el partido de apertura, el entrenador le da a Oliver una noticia increíble.

El entrenador le dice a Oliver que juegue para Catalunya B en la división 2 en lugar del mejor equipo. Los viejos compañeros de equipo de Oliver reciben las noticias en todo el mundo. Hyuga le dice que vaya a Italia, pero se niega diciendo que no puede escapar. Oliver corre por las calles de Barcelona para combatir el dolor y renueva su esperanza en una colina que domina la ciudad.

Hyuga juega el primer partido de Piemonte de la liga italiana contra A.C.Emilia como miembro titular. El partido comienza y Hyuga corta la defensa de Emilia, pero la defensa lo hace perder el equilibrio. Sin embargo, él usa ingenio y permite que el otro delantero, Franchesco, marque el primer gol para el equipo. Los fanáticos están contentos con la primera asistencia de Hyuga, pero el árbitro pita un silbido.

Hyuga juega su partido de debut en la Liga italiana, pero la defensa dura y áspera le impide tomar un tiro a la meta. Él es sustituido en el minuto 31 de la primera mitad. Deja el campo en lágrimas y jura mejorar su equilibrio físico para ser un jugador regular. Por otro lado, Oliver juega un partido de la segunda División española con espíritus renovados.

El entrenador de Catalunya Eduard le pide a Oliver que marque 10 goles y 10 asistencias en la Segunda División en un año. Oliver intenta hacerlo en un solo partido, su debut. Anota 6 goles y 4 asistencias e impresiona a la multitud. Hyuga en Italia y Price en Alemania apoyan a Oliver por su amistad y el objetivo mutuo de ganar la Copa Internacional como equipo nacional de Japón.

Benji Price enfrenta al campeón de la liga alemana, Schneider's Routburg. Gruenbald marca primero con el juego ingenioso de Benji y Kaltz, pero la táctica de pase de Routburg lleva al puntaje de Schneider. Benji, Schneider y Kaltz solían ser compañeros de equipo, pero ahora son enemigos. Schneider provoca que Kaltz lo patee, y Kaltz es enviado. Benji intenta empatar el juego con un tiro libre en el tiempo de descuento, pero falla y Schneider aprovecha para el gol y gana el juego.

Oliver cumple con el requisito del entrenador Eduard de marcar 10 goles y 10 asistencias para el equipo de Catalunya B y jugará para el equipo superior. El viejo rival de Oliver en Brasil, Santana, se transfiere al rival de Catalunya, San José en la Liga española. Rivaul se lesiona durante el partido contra San José, y Oliver entra para jugar contra Santana.

Rivaul está lesionado y Oliver tiene su primera oportunidad de jugar en el primer equipo de Catalunya. Santana su oponente juega magníficamente pero Oliver logra anotar un gol para empatar el juego. Hyuga también obtiene los últimos 5 minutos de juego y muestra los resultados de su entrenamiento anotando el gol ganador del juego. Benji también derrota a su rival, parando el tiro de Schneider en el último partido de la Liga Alemana. El equipo Japonés ahora se reúne en Japón para jugar el Mundial de sus sueños.