Ryktene om Jacks seksualitet vedvarer, og Pacey forsøker å stoppe en lærers nådeløse trakassering.

Et bryllup i Capeside tvinger Joey til å konfrontere familiens rykte.

Dawson sliter med avgjørelsen om han skal fortelle Joey om mr. Potters narkohandel, og Pacey skværer opp med faren.

Etter sommerferien må Dawson ta en avgjørelse om Joey, og Jen bruker uttaket til cheerleader-troppen som påskudd for å lære noen en lekse.

Jen arrangerer et teselskap for Capesides tidligere homecoming queens, og Andie forsøker å vinne Pacey tilbake.

Dawson deltar på en filmfestival i Boston, der Andie og Joey besøker et college mens Jack sjekker ut byens homofile miljø.

En vårferietur til Dawsons tante fører Pacey og Joey nærmere hverandre. I mellomtiden blir Jen sjalu når en annen kvinne flørter med Henry.

Dawson organiserer et alternativt skoleball for juniorstudentene.

Det er mye som er usikkert når Pacey og Joey kommer tilbake til Capeside etter reisen som varte hele sommeren.

Dawson oppdager at han har fått makt over livet til Mr. Brooks mens vennene hans er på skitur.

Dawson gjør seg klar til å forlate universitetet, og han og Joey treffes for å ta farvel.

Selv om alle har forlatt Capeside for å gå på skole eller nå andre mål, forblir følelser uoppgjort mellom Joey, Dawson, Jen, Jack og Pacey.

På flyplassen blir det rot i alles nøye planlagte sommerferieplaner.

Dawson og Joeys følelser for hverandre blusser opp igjen under sommergjenforeningen i Boston.

Pacey har hastverk med å rekke en date med en vakker fremmed, men ender opp innestengt i en butikk med Joey.

Det blir tydelig at helsetilstanden til Jen er alvorlig, noe som motiverer Dawson og vennene hans til å prøve å legge gamle uoverensstemmelser bak seg.