Danny Fenton y Valerie Gray llegan tarde a una clase y por casualidad se convierten en compañeros en un proyecto que vincula responsabilidad compartida que es cuidar un saco de azúcar como si fuera su hijo, pero Skulker lo roba para que ellos pelen y sepa quien es el oponente indicado, pero al final se termina su paciencia y los captura a ambos y los lleva a la Zona Fantasma y ahora Danny Phantom y Valerie deben unir fuerzas para poder salir de ahí y llevar su saco en buen estado para la clase. Mientras todo esto pasa, Tucker se encarga de cuidar a los demás sacos con su negocio de guardería sin pensar en que todos los sacos excepto el suyo terminarían siendo una galleta.

10 años en el futuro toda la tierra será un caos y destrucción provocado por Danny Phantom que ahora es malvado y siniestro, ahora es conocido como Danny Oscuro, Cuando unos seres conocidos como los Observadores ven el futuro de Danny, envían a un fantasma que tiene el poder de controlar el tiempo llamado Reloj a destruir a Danny Phantom para impedir que el futuro no se vuelva un caos, pero Reloj intentara cambiar el futuro de Danny como sea, que Danny vaya por el camino que le lleve a convertirse en el malvado Danny Oscuro.

Aunque Danny Phantom puede realizar extraordinarias hazañas físicas, Danny Fenton aún es un debilucho perezoso. Por ello, Dash es asignado como el "compañero de ejercicio" de Danny para ayudarle a prepararse para el Test Presidencial De Ejercicio de la escuela. Pero cuando Skulker aparece en FentonWorks para su típica caza, Danny Phantom, Dash y Skulker son alcanzados accidentalmente por el nuevo "Fenton-Atestador", que les encoge - y para empeorar las cosas, los poderes fantasma de Danny no funcionan bien en forma minúscula. Ahora, Danny y Dash deben confiar en las habilidades mentales y físicas del otro para llegar al Centro Operativo de Emergencias FentonWorks e invertir el efecto del rayo antes de que Skulker y su ecto-esqueleto les dé caza.