宇宙船遭受攻击，迫降金星。露琼一行人为了前往希尔维雅与吉恩所在的移动嘉年华而向〈造云设备〉前进。但他们的动向早已被希尔维雅所掌握，露琼与直美，尹甸、亚许以及希安被迫兵分两路行动。注视这一切的操偶师对被捕的吉恩讲述起艾娃・克利丝缇勒与CODE EVE的过去。吉恩不断向希尔维雅喊话，希望她停止对人类发起反叛。然而她却坚持掀起战火。艾斯也对两人对谈中产生的新事实感到震惊。吉恩对这样的他，说出了自幼对不朽九人的想法。

目击操偶师真面目的亚许逃了出去。露琼与直美找到了吉恩。但她们却对趁乱逃出吉恩所表现的举止觉得有异。取回伊德的伊甸变形为斗士，与格劳芬展开了战斗。两人为了心中的信念与重视之物相互冲突。同一时间，被操偶师捉住的希安，被夺走了意识走，并被要求达成某项任务。

The true identity of the Puppetmaster is revealed. Rouge, Silvia, and all the others listen in shock as he explains his plans and the world he wishes for. Were Rouge and the rest no more than puppets in his play?