Eine Patrouille der Organisation OZ entdeckt ein mysteriöses Objekt, das auf dem Weg zur Erde ist. Bei näherer Untersuchung stellt es sich als Kampfroboter heraus, der heftigen Widerstand leistet.

Heeros Schwur, Relena umzubringen, lastet schwer auf ihr. Trotz allem kann sie nicht anders und will unbedingt herausfinden, was es mit Heero wirklich auf sich hat.

Heero wird im Krankenzimmer des Allianzmilitärs festgehalten. Zechs wird währenddessen eine neue Waffe vorgeführt.

Die Gundams sind da und die wahre Schlacht hat begonnen. Währenddessen fliegt Minister Darlian wieder zu den Kolonien und nimmt Relena mit.

In ein neues, unbestimmtes Schicksal geworfen, kehrt Relena zur Erde zurück. Dort warten eine Schulfeier und die Nachricht über Heeros Schultransfer auf sie.

Die Anführer des Allianzmilitärs versammeln sich an der New Edwards Basis um die Waffenreduzierung zu diskutieren. Der Anführer von OZ stellt den Gundams eine Falle.

Nachdem sie wie Marionetten kontrolliert wurden, sind die Gundams nach General Septem das neue Ziel von Lady Une. Heero, Duo, und Quatre ziehen los, um die Explosion der New Edwards Basis zu verhindern.

Die Allianz der Vereinten Erdsphäre bricht zusammen und die Welt versinkt im Chaos. Heero und Duo kämpfen weiter gegen OZ, die das Chaos verursacht haben.

Schlachte, die Leben riskieren, produzieren nur Fehler. Welche Bedeutung hat dann der Tod Ottos? In seinem Kampf mit Zechs trifft Heero eine letzte Entscheidung.

Die Gundams wurden besiegt. Sie stehen einer Zeit der Demütigung gegenüber, in der sie nicht kämpfen können. Relena begibt sich nach Moskau, um Lady Une zu treffen.

Auf einem Schlachtfeld mit Widersprüchen trifft Wu Fei auf Sally Po. In seinen Gefühlen verloren kehrt Wu Fei zu seinem Shenlong-Gundam zurück.

Die Militärmacht von OZ gerät immer mehr außer Kontrolle. Ein unnötiges Massaker folgt dem Nächsten. Dabei breiten sie sich immer weiter in den Weltraum aus.

Heero versucht, seinen Fehler wieder gut zu machen. Innerhalb der Kriegszone von OZ konfrontiert er Sylvia, Noventas Enkelin.

Zechs will einen entscheidenden Kampf als Krieger. Noin lädt Heero in die Antarktis ein, wo Zechs auf ihn wartet. Inspector Acht jagt ihnen mit seinen Kräften hinterher.

Zechs wartet am Südpol auf den fertiggestellten Gundam. Heero fordert Zechs zu einem Duell heraus, mit Trowas Gundam Heavyarms. Zechs versucht etwas hinter dem verzweifelten Kampf zu finden.

Die Kriegszone erweitert sich in den Weltraum. OZ will endlich das Allianzmilitär ausschalten. Die Kolonien wollen sie sich dabei ebenfalls einverleiben.

Der Kampf zwischen Tallgeese und Gundam hat ein Kapitel des Krieges beendet. Aber ein grausames Schicksal wartete auf die Piloten.

Es gibt weder Ruhm noch Lob für die Gundam-Piloten, die zu den Kolonien zurückkehren. Nur Befehle, OZ zu zerstören.

Die fünf Wissenschaftler beginnen, die neuen Suits für OZ zu bauen, Mercurius und Vayeate. Um sie aufzuhalten, schleicht sich Heero auf die Mondbasis. Er hat vor die Wissenschaftler umzubringen.

Ein weißer Mobile Suit nähert sich einer Kolonie. Als er sich als Zechs Tallgeese herausstellt, befiehlt Lady Une Trowa und Heero, ihn anzugreifen.

Das Zeitalter fällt ins Chaos. Die Kolonien begeben sich auf einen Pfad der Bewaffnung. Lady Une handelt entgegen der Befehle der Romefeller-Stiftung.

Um die Massenproduktion der Mobile Dolls zu verhindern, begibt sich Duo auf den Mond. Während dem Kampf mit Hilde erkennt Duo die chaotische Zukunft der Kolonien

Ein Mobile Suit, der einem Gundam ähnelt, greift die sich bewaffnenden Kolonien an. Trowa und Heero ziehen los, um sich dem mächtigen Suit zu stellen.

Das Projekt der Mobile Dolls ist ein weiterer Schritt zur Eroberung durch die Romefeller-Stiftung. Treize stimmt diesem Schritt nicht zu. Die Gundam-Piloten verursachen währenddessen im Weltraum ein Blutbad.

Die Stiftung will die Gundams und ihre Verbündeten vernichten, da sie das Symbol des Widerstands sind. Sie befehlen die Hinrichtung der Gundam-Piloten.

Innerhalb der Flammen des Krieges gefangen, sind die Gundam-Piloten ohne Ziel. Was haben sie verloren und was haben sie gewonnen? Und was hat Relena zu sagen, nachdem sie sie sah?

Treize Khushrenada ist von der Bühne der Geschichte verschwunden. Aber während Schicksale aneinander vorbeirasen, beginnt Treize neue Pläne zu verwirklichen.

Der Weltraum rennt kopflos in ein Zeitalter der Kämpfe. Heero und Quatre kommen auf der Erde an und werden von Romefellers Plan, alle Gundam-Piloten auszuschalten anvisiert.

Die militärische Macht von Romefeller wächst, und sie greifen brutal Konfliktzonen an. Heero nimmt rücksichtslos am Kampf teil.

Heero und Quatre entscheiden sich, im Sanc Kingdom zu bleiben, wo Relena Totalen Pazifismus propagiert. Aber das Königreich ist kein Ort, um sich auszuruhen.

OZ nähert sich Duo, der aus den Schatten angreift. Der Wing Zero fordert Duos unvollständigen Deathscythe zum Kampf.

Zechs Marquise zieht wieder seine Maske auf und zerstört die Mobile Dolls der Romefeller. Heero merkt, dass die Stiftung die Treize-Faktion auslöschen wird und riskiert sein Leben.

Zechs schafft es, sich den Wing Gundam Zero zu beschaffen und zerstört die Einheit der Weltraum-Taurusse. Während dieser Zeit betritt Heero ein Schloss in Luxemburg, wo Treize ihm einen neuen Gundam gibt.

Um gegen die Angriffe von Romefeller zurückzuschlagen geht Quatre auf die Suche nach Sandrock. Zechs möchte sich mit den Gundam-Piloten zusammentun und sucht nach Wu Fei.

Auf der Erde greift die Romefeller-Stiftung das Sanc Kingdom an. Wieder mit dem Maganac Corps vereint, eilt Quatre zurück an die Front mit seinem Sandrock.

Die Romefeller-Stiftung gibt einer gebrochenen Relena eine weitere grausame Option. Währenddessen beginnen zwei Gundam-Piloten, Heero und Zechs, einen Kampf beim jetzt zerstörten Sanc Kingdom.

Bewaffnete Koloniebürger, die sich White Fang nennen übernehmen eine strategische OZ-Basis nach der anderen. Quatre und Noin durchsuchen das All nach den anderen Piloten.

Um sich gegen Romefeller zu wehren und Unabhängigkeit zu erlangen, bitte Quinze, den Anführer der Kolonienbewegung, Zechs, seinen Gundam als Symbol der Rebellion ins All zu bringen.Währenddessen wird Quatres Shuttle im All angegriffen.

Heero plant, den Anführer der Romefeller-Stiftung zu töten. Relena sammelt Unterstützer um sich und will den ersten Schritt in Richtung Frieden machen.

Treize entzieht Queen Relena ihrer Position als Hauptrepräsentant von Romefeller. Eine Schlacht um die Raumfestung Barge beginnt im Weltraum, um die größte Macht zu bestimmen.

Wu Fei führt seinen einsamen Kampf fort und Wing Zero zeigt ihm die Zukunft die er nehmen muss. Auf der Erde kehren Treizes Untergebene von Barge zurück. Unter ihnen ist die immer noch bewusstlose Lady Une.

Zechs tritt White Fang bei, um den Kriegen der Menschheit ein Ende zu setzen. Aber nur wenige kennen seine Absichten.

Ein Kampfprogramm basierend auf dem Systen von Pyon wird entwickelt. Die Mobile Dolls mit diesem System sind mehr als die Gundam-Piloten aushalten können. Heero sagt dem nervösen Quatre, dass er den Koloniebürgern helfen kann.

Hilde schleicht sich auf die Libra und erhält wichtige Daten. Aber Mobile Doll Versionen von Mercurius und Vayeate folgen ihr bei ihrer Flucht.

Treize will, dass ein ehrenvolles Duell den Kampf entscheidet. Aber als Milliardo, der Kommandant von White Fang, lehnt Zechs die Herausforderung von Treize ab.

Die fünf jungen Männer ziehen in die Schlacht. Was wartet dort auf sie? Ein schönes, aber trauriges Schlachtfeld? Oder ein blutiges Massaker?

Quatre reagiert auf seine Trauer und Trowa widersetzt sich seinem Schicksal. Duo hilft, alte Rechnungen zu begleichen. Und Heero schreitet zum letzten Kampf, wo Zechs auf ihn wartet.

Kämpfe werden von Menschen begonnen und Menschen erlangen Frieden durch den Kampf. Aber wie viele Leben müssen dabei gelassen werden?