Da Dr. Martin Nodel der brillanteste Genetiker der Welt ist, sind die Studenten und Mitarbeiter der Universität bereit, ein paar Exzentrizitäten in Kauf zu nehmen - im Gegensatz zu seinem Sohn Paul, der ungeduldig auf das Verhalten seines Vaters reagiert. Dr. Nodels Verhalten geht jedoch über das Exzentrische hinaus, nachdem er seine Forschungen über Introns, mysteriöses genetisches Material, enthüllt hat, von dem er glaubt, dass es den Code für die zukünftige Evolution enthält. Nach einem erfolgreichen Tierversuch probiert Nodel die Formel heimlich an sich selbst aus, mit erstaunlichen und beunruhigenden Ergebnissen. Während seine Intelligenz zu wachsen beginnt, wachsen auch Schuppen an seinen Händen, seltsame Abdrücke an seinem Körper und ein mysteriöses Loch in seinem Rücken. Und er scheint instinktive Botschaften zu bekommen, die ihn auffordern, "Subjekte" an einen abgelegenen Ort in der Wildnis zu bringen. Als er dort ankommt, findet er in Begleitung von sechs Studenten, darunter Paul und seine Freundin, eine Gruppe schwer bewaffneter Soldaten und den Schlüssel, um ein Geheimnis zu lüften, das weit über die menschliche Wissenschaft hinausgeht.

In dieser Fortsetzung von Double Helix hat Dr. Ira Nodel (RON RIFKIN) seinen Körper verändert, um mit Außerirdischen zu kommunizieren, die die Erde mit ihrem genetischen Material besiedelt haben. Er wird auf einem außerirdischen Raumschiff von Sohn Paul (Ryan Reynolds), Pauls Freundin Hope (Kathleen Duborg) und sechs Studenten begleitet. Als Dr. Nodel jedoch einen leuchtenden Pfosten im Kontrollraum des Schiffes berührt, werden er und Paul von einem mysteriösen Licht verzehrt. Dies lässt Hope und die Schüler glauben, in eine Falle geführt worden zu sein, ein Verdacht, der sich verstärkt, wenn das Schiff zwei der Schüler fängt und sie durch die Wand zieht. Hoffnungslos, um herauszufinden, was los ist, liest Hope Dr. Nodels Tagebuch und riskiert ihr Leben, indem sie den leuchtenden Pfosten berührt. Ihr Körper beginnt die gleiche Transformation, und eine seltsam leuchtende Entität spricht in den Stimmen von Dr. Nodel und Paul, die versuchen, mit ihr zu kommunizieren. Das Schiff entreißt den Schülern jedoch weiterhin zwei mal zwei.