살인청부업자 일을 하고 있는 쿠루스 카즈키와 스와 레이. 둘은 크리스마스 날 맡은 의뢰를 수행하던 중 아빠를 찾으러 온 4살 여자아이인 미리와 만나, 어쩌다 보니 함께 생활하게 되었다. 사랑으로부터 등을 돌리고 살아온 카즈키와 사랑을 모르는 레이가 어린이집에서 애 데려오기 및 식사 준비 등으로 당혹스러워 하는 등, 천진난만한 미리와 셋이서 지내는 기묘한 생활이 시작되었는데.

카즈키를 아빠라고 부르며 따르는 미리. 카즈키는 이에 불평을 하면서도 화장실이나 식사 등을 챙겨주며 미리를 돌봐주었다. 한편 둘 때문에 자신의 페이스가 완전히 무너져버린 레이가 카즈키에게 미리를 어떻게 할 것이냐고 묻자, 카즈키는 그녀를 어머니 곁으로 돌려보내겠다고 말했다. 미리는 카즈키 일행이 일로 죽이고 만 마피아의 내연녀의 딸이었는데, 어머니에 대한 단서가 없어 야도리기의 주인인 쿠기 큐타로에게 조사를 부탁했다. 그리고 카즈키 일행은 새로운 의뢰를 받게 되었는데.

미리의 어머니가 있는 곳이 밝혀졌다. 카즈키는 그녀와 같이 지내는 사이에 애정이 싹트고 감정이 샘솟기 시작했지만, 자신은 애를 키울 그릇이 아니라면서 그녀를 떠나보낼 결의를 다졌다. 헤어지는 날 아침, 엄마가 해준 햄버그를 먹을 수 있겠다며 천진난만하게 기뻐하는 미리를 데리고 어머니가 사는 곳으로 향한 카즈키 일행. 카즈키는 미리의 어머니와 얘기를 해보았지만, 거친 생활을 하는 그녀가 눈에 밟혔다. 한편, 공원에서 미리와 놀아주고 있는 레이는 문득 자신의 어린 시절을 떠올렸는데.

다시 한번 미리와 같이 살게 된 카즈키와 레이. 하지만 매일 미리를 돌보고 있자니 일을 전혀 할 수 없었다. 그래서 미리를 어린이집에 보내기로 결정했는데, 어린이집 입소 수속이 처음인 두 사람은 시청에 제출할 서류도 뒷세계 업계에서 얻은 기술로 위조해 처리했다. 그렇게 무사히 어린이집 입소가 결정되었지만, 어린이집에 들고 갈 소지품을 준비하는 것에도 고생했다. 미리가 얕보이지 않게 하기 위해서 비싼 옷을 입혀 등원시켰으나, 어린이집에 가는 걸 기대하고 있었던 미리의 얼굴은 어째서인지 밝지 않았는데.

미리의 옷과 어린이집 등원 준비 등으로 지출이 늘어 가계 사정에 적신호가 켜졌다. 다시 일을 하기 위해 카즈키는 큐타로에게 찾아갔지만, 살인청부업자로서 감을 되찾기 위해서라며 준 일거리는 타깃의 신변 조사나 현장 사전 답사 같은 잡일뿐이었다. 그런 가운데 미리가 다니는 어린이집이 잠시 문을 닫는 일이 벌어졌다. 거기에다 그동안 숙제로 미리는 아빠가 하는 일을 조사해 모두의 앞에서 발표하게 되었다. 그렇게 둘은 일과 애 돌보기를 하느라 밤을 새우는 일이 이어졌고, 피로에 지친 레이가 눈을 뗀 사이에 미리가 집에서 나와 미아가 되는 사태가 벌어졌는데.

아이를 키우는 데 있어 부모로서의 역할을 신경 쓰기 시작한 카즈키. 그런 상황에서 안나 선생님으로부터 어린이집에서 미리가 남자아이와 싸웠다는 보고를 듣게 되었다. 카즈키는 미리에게 싸우게 된 이유를 집요하게 물어봤으나 모르겠다는 대답만 돌아왔고, 끝에는 '아빠 미워!'라는 소리까지 들어 풀이 죽었다. 다음 날은 미리의 소풍날이어서 그녀의 기분을 풀어주기 위해 카즈키는 공들여 도시락을 준비했지만, 그만 가방에 넣는 걸 잊어버려 남몰래 도시락을 전해주고자 레이를 데리고 미리가 있는 동물원으로 향했다. 거기서 두 사람은 집에서는 볼 수 없는 미리의 다른 모습을 보았는데.

장마가 한창인 어느 날. 여느 때처럼 게임 삼매경인 레이에게 어리광 부리는 미리를 두고 카즈키는 홀로 집안일을 하느라 바쁘게 지내고 있었다. 그러던 때 미리와 레이가 편식을 하면서 카즈키가 만든 요리를 서로에게 떠넘기는 일이 벌어졌고, 끝에는 카즈키에게 프렌치토스트를 해달라고 말했다. 그러자 떼를 쓰는 두 사람에게 카즈키는 울화통이 터졌고, 다음 날 편지를 남긴 채 가출하고 말았다. 홀로 미리의 뒤치다꺼리를 맡게 된 레이가 헤매면서 악전고투하는 가운데, 카즈키는 우연히 길에서 마주친 여성을 보고 무언가를 떠올렸는데.

드물게도 레이가 아침 일찍부터 차려입고 집을 나섰다. 카즈키와 미리가 그를 배웅한 다음 곧바로 미션에 착수한 가운데, 레이가 향한 곳은 조직의 보스이자 자신의 아버지가 기다리는 본가였다. 레이는 일정 조건하에 현재의 생활을 허락받았는데, 스와 일가를 언젠가 이을 자로서 집에 돌아오라고 요구받았다. 또한 조직을 배신한 인물을 처리할 것을 명령받았는데, 그는 레이가 아는 사람이기도 했고. 그 무렵, 집에서 파티 준비를 하고 있는 미리는 천진난만하게 레이의 아빠에 대한 걸 카즈키에게 물어보았는데.

공원에서 달리기 연습을 하는 미리와 카즈키 그리고 레이. 미리는 꼭 금메달을 따겠다며 의욕이 불타고 있었다. 카즈키와 레이는 어린이 운동회에 참가해본 적이 없었지만, 카즈키는 호화로운 도시락을 만들었고 레이도 자리 선점을 하고 미리를 위해 주먹밥을 만드는 등 애를 썼다. 그렇게 드디어 운동회가 시작되었고 아이들도 어른들도 분위기가 한창 달아오른 가운데, 점심시간이 되었고 카즈키와 레이가 만든 도시락은 큰 호평을 받았다. 그리고 드디어 미리가 기다리던 달리기 경주 순서가 되었고, 카즈키와 레이가 응원하는 가운데 미리가 그만 넘어지고 말았는데.

12월. 미리는 어린이집의 크리스마스 행사에서 노래를 부르기 위한 연습을 하고 있었다. 평소와 같이 카즈키와 레이가 미리를 데리러 오자 어린이집 앞에는 전에 본 적 있는 사람이 있었으니, 그 사람은 미리의 친엄마인 미사키였다. 이전과는 완전히 달라진 인상으로 미리를 데리러 왔다고 미사키가 말하자 카즈키는 자기도 모르게 언성을 높였지만, 그때 엄마의 모습을 본 미리가 그들에게 달려왔다. 일단 자세히 얘기를 하기 위해 미사키를 집으로 데려오자 미리는 천진난만하게 엄마에게 달라붙어 어리광을 부렸고, 미사키에는 갑자기 그들을 찾아온 나름의 이유가 있었는데.

평소처럼 조용한 집에서 정리를 하는 카즈키와 게임만 하면서 불규칙한 생활로 돌아온 레이. 미리가 어머니한테 돌아가게 되고 몇 주가 지났다. 둘만 남게 되면서 카즈키와 레이는 상실감을 지울 수 없었지만, 어머니와 함께 사는 것이 미리에게 있어서 최고로 좋은 것이라고 스스로에게 되뇌었다. 그리고 레이가 본가로 돌아갈 결심을 하게 되면서 카즈키 또한 현재의 집에서 떠나겠다고 말해, 각자가 떨어져 지내는 생활이 시작되었다. 그런 가운데 조직을 잇기 위해 본가로 돌아온 레이는 아버지이자 보스가 어떤 사진을 내미는 것과 함께 한 말에 경악했는데.

미리와 만난지 1년째 되는 크리스마스. 어린이집에서 열리는 크리스마스 행사를 보러 와달라는 미리에게 카즈키와 레이는 꼭 가겠다고 약속했다. 그 전에 카즈키와 레이는 큐타로를 만나 어떤 물건을 받아 들고, 조직의 보스가 있는 스와 저택으로 향했다. 미리와 셋이서 살기로 결심한 카즈키와 레이는 조직에서 빠져나오기 위해 위험을 각오하고 직접 담판을 지으러 갔는데, 격렬한 총격전이 있은 후 살인청부업자인 오기노가 그들을 막아섰다. 카즈키가 이에 맞섰으나 오기노에게 당하기 일보 직전에 레이의 도움을 받아 간신히 살았고, 마지막으로 레이가 향한 곳은 보스가 기다리는 방이었는데.