Jimmy Neutrón olvida guardar sus pantalones, y su madre se lo dice miles de veces, pero como el hace experimentos y no tiene tiempo de guardarlos, crea un nano-chip que se lo inserta al pantalón para que se guarden solos, pero ese pantalón obtiene mente propia, y con otro ejercito de pantalones intentan conquistar retroville.

Jimmy Neutrón cansado de ser genio todo el tiempo, crea un invento para volverse "normal", pero todo se pone fuera de control al moverse accidentalmente a "como simio" y la ciudad esta en grave peligro por la llegada de un meteoro y tienen que volverlo a ser genio para salvar a la retroville.

Jimmy Neutrón y Cindy Vortex compiten en un concurso de vender chocolates, porque el ganador iria a la ciudad retro gratis. y como ve que cindy lleva mucha ventaja y Jimmy no ha vendido nada, entonces crea al robot Willie Loman 3000 para que le ayude a vender, luego de vender 1000 piezas, decide vender a todo al que se encuentre, incluido el propio jimmy.

Jimmy quiere que Carl y Sheen prueben sus nuevos inventos, pero ellos no estaban disponibles, y cuando ve que otros niños convivian con sus hermanos decidio pedir un hermano, y sus padres al no darselo, se construyo uno, pero era demasiado molesto que intento deshacerse de el, y al final, les construyo su familia y se fueron a vivir a la luna.

Cindy habla sobre la invención del Radio, pero Jimmy le contradice, diciendo que sin electricidad no se pudo haber inventado, pero Cindy no le cree, entonces jimmy trae del pasado a Thomas Edison, pero Thomas se enamora de la Señorita Ave y como se queda en el presente, la electricidad desaparece porque borro al inventor, ahora deben regresarlo al pasado.

Sus padres se van a una segunda luna de miel, y ellos mandan a la abuela a cuidar a Jimmy pero en realidad Jimmy la va a cuidar, pero sus quejas sobre la edad hacen que el crea un suero de juvenecimiento, pero juvenece demasiado que se convierte en un bebé, pero sabiendo que le prometio a sus padres no experimentar con ella, debera regresarla a su edad antes de que lleguen.

Jimmy quiere comprar la hiper-enciclopedia de 1000 volumenes, pero no tienen dinero, al enterarse que Hugh Neutrón pudo ser rico si invertia sus ultimos 50 dolares con McSpanky.

Viaja al pasado con Carl y Sheen y convencen al joven hugh a invertir con McSpanky, ademas de darle consejos para su futuro el.

Pero se da cuenta que el dinero no lo era todo, y regresa al presente, al final se entero que esos ultimos 50 dolares eran para el anillo de compromiso de Judy.

Jimmy Neutrón viaja a través del sueño de Carl, pero sufre por el mismo y trata de escapar haciéndolo despertar, por lo que tuvo que besar a Cindy Vortex para poder salir del sueño de Carl.

Jimmy Neutrón y sus amigos sufren por el calor, asi que con el bloqueador solar de Carl cambia el clima, en primera instancia parecia bien, pero al aumentarlo quanticamente, lo convierte en una era de hielo, asi que debera arreglar el clima antes de que retroville se convierta en primitiva.

Para el concurso de talentos, Jimmy, Carl y Sheen buscan no repetir los mismos, y forman una banda para tratar de vencer a Cindy y Libby con su popular baile stomp, gracias a los instrumentos musicales que jimmy realiza, hacen que toquen muy bien, y se hacen llamar Lords llama de la ciencia (combinacion de los 3 gustos de ellos).

Pero la fama se les sube a la cabeza antes de tiempo, y pierden al no realizar la tocada y hacer otra cosa.

Jimmy Neutrón frustrado de quedar en ultimo lugar en las carreras de la escuela que realiza el entrenador gruber, ademas de su deseo de vencer a Cindy, utiliza una combustión de silicon térmico en sus tenis, al principio le resulto divertido y hasta incluso lo hacia verse invisible y humillar a Cindy, pero el ciclo se siguió repitiendo y no pudo parar, no tuvo de otra mas que hacer que se le salieran los tenis, pero tuvo una horrible consecuencia, quedar en masa desconocida al ver que su masa muscular no se formo del todo.

Nick Dean les cuenta a los de la escuela la leyenda del Fantasma de Retrolandia, pero Jimmy no cree en mitos y averigua si en realidad existe ese fantasma o es solo un mito.

Jimmy Neutrón le pide prestado algunas cosas del juego de quimica de Carl, pero al no tenerlas tendria que esperar hasta su cumpleaños para pedirle el superjuego de quimica, pero no lo hace ya que crea el Hypno-Rayo para hipnotizar a sus padres y creer que mañana es el cumpleaños de Jimmy, pero se sale de control al ya festejarle 10 fiestas seguidas y quererlo enviar a la Universidad en temprana edad.

Jimmy y sus amigos van a la dulcería de Sam, al no saber que escoger y ellos pensar en un nuevo dulce, Jimmy intenta crear uno, al principio todos los que presento sabían muy mal, pero llevo el lote nuevo creado en la mañana, y resulta que les gusto tanto, tanto que harían lo que fuera con tal de tener uno. de pronto en convirtió en una adicción de los habitantes, y no tuvo remedio que poner el toque eléctrico a los dulces, volviendo así a la normalidad.

A Sheen le roban su muñeco de ultra-lord en el parque y Jimmy resolvera el crimen con la ciencia, los sospechosos son Cindy, Judy, Nick y la ardilla, pero descartan a la ardilla porque creen que no se llevan muñecos.

Pero al final de cuentas siempre si fue la ardilla, que utiliza a Ultra-Lord como cascanueces.

Jimmy crea un parche que hace que estés enfermo, pero sin realmente estarlo, (lo hizo para no ir a la escuela) pero esto creo eco entre la mayoría de los alumnos de la Escuela Primaria Lindbergh para tampoco ir a clases, pero todo sale mal cuando el parche se disuelve y estar realmente enfermos. Jimmy deberá ir al cuerpo de Carl (que es el mas inestable) a extraer la mitocondria o el virus para realizar un antídoto. al ser curados todos, deciden nunca volverse a enfermar para evitar que los curen de manera peligrosa.

Los padres de Jimmy iran a ver el recital de Patos, y dejan a Jimmy Neutrón solo en casa, hasta que Sheen y Carl al enterarse de la situación deciden hacer una fiesta, y Jimmy acepta solo si viene Betty Quinlan. increiblemente también fueron a la fiesta Cindy y Libby, de primera Jimmy quiso hacer una fiesta "cientifica", pero Sheen la anima con los inventos de Jimmy, ahora Jimmy debera terminarla y limpiar el desastre antes de que lleguen sus padres.

Jimmy inventa un emulador de juegos virtual, y quieren que Carl y Sheen traigan su juego preferido para que lo ayuden a probar, pero Sheen ya tenia su juego de UltraLord, y combatio junto a su idolo contra el Roboenemigo, pero Carl complica todo al aumentarle el nivel al juego, pero agrega a la historia su juego de llamas llamado LlamaPalooza y le ayuda a Jimmy y Sheen a ganar el juego y salir.

Jimmy y Hugh siempre quedan ultimos en la competencia escolar de padres e hijos, asi que Jimmy para intentar ganar y derrocar a la familia de Cindy, crea la banda electromagnetica que hace que Hugh tenga buenas habilidades, Cindy descubre el punto del invento y lo arruina, pero quedan descalificados al ver que su madre en realidad era la tia disfrazada, y como todos hicieron trampa en el rally, ganan Carl y su padre.

Jimmy y su padre iban a participar en el concurso de padres e hijos, pero el hijo no lo haria debido a que su padre lo humillaria si presenta su recital de Patos.

Asi que, decide volverlo de "Onda" con un invento suyo, pero se vuelve tal de onda, que olvido por completo su personalidad anterior. Jimmy debera volverlo a la normalidad antes de irse de gira o lo perdera durante su adolescencia.

Jimmy, Carl, Sheen, Cindy, Libby, and Goddard blast off into space in Jimmy's newly invented spaceship to mine for aster-rubies while fighting off space bandits and their own greed.

Jimmy crea un aparato para alterar el tiempo, y utiliza a Cindy y Libby como prueba para ver si funciona, esto llamo la atención de Hugh y por error mando a Jimmy y amigos a 2 millones de años atras, aprovecha su ausencia para jugar con el tiempo y espacio.

Mientras Jimmy y los demas buscaran la manera de regresar a su epoca, siendo ayudados por Leppy, al final de cuentas al regresar a su epoca, Jimmy y sus amigos pensaron que cambiaron la linea del tiempo, la cual no fue cierto, si no Judy castigo a Hugh por jugar con el tiempo.

Jimmy y sus amigos van a Egipto a buscar momias de verdad, aunque consiguen hacerlo, casi son atrapados.

Jimmy y sus amigos juegan al beisbol, pero al ver que son apaleados por el equipo de Butch, decide alterar los bats y guantes para jugar mejor, despues de muchos triunfos, van a Japón, pero deciden no hacer mas trampas.

Jimmy y sus amigos quieren convertirse en hombres de edad con el fin de obtener un videojuego que es para mayores de 17 años, pero al momento de hacerlo envejecen y ahora deben rejuvenecer o morirán.

Jimmy trata de crear un antidoto a la feromona que hace que a los niños les gusten las niñas, pero en su intento de crear dicho antidoto, Jimmy, Carl y Sheen terminan siendo expuestos a esta feromona y ahora están enamorados de la siguiente manera: Jimmy está enamorado de Cindy, Sheen está enamorado de Libby y Carl se enamora de la mamá de Jimmy "Judy Neutron". Jimmy tiene que solucionar este problema antes de que se vuelva el novio de Cindy.

La mamá de Jimmy se va de vacaciones a un Spa y para no tener que hacer el trabajo de la casa, Jimmy construye un maternotron que reemplaze a su madre. Las cosas se salen de control cuando el maternotron empieza a sobreproteger demasiado a Jimmy. Al final el maternotron es derrotado por la verdadera madre de Jimmy. Jimmy es castigado por su mamá después de eso.

Jimmy no quiere hacer los trabajos que les asignaron sus papás, así que saca clones de sí mismo para que hagan todos los trabajos. Todo empeora cuando los clones molestan a la ciudad y ahora Jimmy tendrá que deshacerse de ellos. Al final un clon con personalidad malvada escapa y no se le vuelve a ver hasta el capítulo: "El problema con los clones".

La señorita Ave organiza un paseo a un rodeo que se organizara en un estadio.

Jimmy tiene prohibido participar en la feria de las ciencias porque es demasiado inteligente.

Timmy Turner is magically sent to the secret lab of none other than Jimmy Neutron, the boy with the genius IQ. How will Timmy and Jimmy get back to each other's own worlds?

Jimmy crea una fórmula para eliminar todas las debilidades de los Weezer y ahora estos quieren intentar actividades peligrosas sin saber que la fórmula dura poco tiempo. Jimmy tiene que detender a los Weezer antes de que se acabe el efecto de la fórmula y estos se lastimen.

Jimmy y sus amigos tienen que enfrentarse a un malvado niño billonario llamado Eustace Strych.

Jimmy returns from an excavation on the Twonkus-3 comet with a small furry creature burrowed in his soil samples that have a rather violent reaction to music.

El Director de Cine Quentin Smithee realiza un concurso de películas, el cual gana Jimmy, pero la película la realiza en la ciudad y no en Londres donde supuestamente era el inicio.

En realidad es Profesor Calamitus disfrazado, y hace que las escenas que realicen sean un simple accidente, obvio para acabar con Jimmy y sus amigos.

Al final es derrotado por Hugh Neutrón, Jimmy y sus amigos. y obviamente Jimmy queria terminar su película, pero mejor se decidió realizar una combinando varias historias que sus amigos escribieron.

Jimmy, Sheen, and Carl travel 15 years into the future, only to find that some things have gone wrong. Can they right the past to save their future?

Jimmy y Cindy se pelean para definir quien tiene razon sobre el ecuador de la tierra, van a ese lugar acompañados de Carl, Sheen y Libby, pero se pierden en la isla, y despues de pasar por peligros y demas, logran establecer un campamento y relajarse despues de tanta discusión, hasta que llegan sus amigos con la nave, y la repara para regresar a casa.

Jimmy Neutron and Timmy Turner vie against each other for Cindy's affections and Professor Calamitous employs Cosmo and Wanda in his evil plans.

Despues de burlarse de Jimmy por su estatura, y ademas de que un empleado lo molesta, Jimmy usara su rayo encogedor para encogerlo, pero resulta que se escapa de sus manos y cuando Gruber lo eleva con el martillo, hace un efecto cuantico que hacen todos se encogan, lo malo de todo es que los bandidos espaciales (Zix, Travoltron y Tee) los secuestran para venderlos como juguetes.

Todos en la ciudad ven el nuevo programa feliz de la Abuela Taters, todos caen, menos Jimmy, que no cree en eso, y Cindy, que estaba en un torneo de karate.

La Abuela Taters lo hipnotiza para que estén en un estado de felicidad total y le sirvan de esclavos, al final Cindy y Jimmy la detienen, revierten todo el daño, y la abuela villana se regresa a su planeta fracasando, juntandose con varias abuelas de la misma raza.

Jimmy se entera que a Betty Quinlan le gusta la magia, asi que crea un espectaculo de magia, pero los celos de Cindy hacen que los envien a un dimensión desconocida, alli se encuentran con el gran mago Spamdini, que los ayudo a salir, el prefirio quedarse para ir a la dimensión del salchichon.

Jimmy, Carl y Sheen viajan al cuadrángulo de las Bahamas para comprobar que sus desapariciones son un mito, allí se encuentran con el doctor Sydney Musgo, que quería hacerlos esclavos y convertirlos en hombres alga, al final lo derrotan.

Carl conoce a una nueva amiga llamada Elke Elkberg que vive en Suecia y vino a conocerlo, pero Carl entro en pánico, así que le pide a Jimmy ser el niño genio por un día para impresionarla.

Pero al final, los 2 mienten.

Hubo un robo en el banco de retroville, se robaron varios billetes de edición especial con George Washington parpadeando, pero el que los robo utilizo los inventos de Jimmy y asi incurparlo a el de esa fechoria.

Jimmy desde la prisión junto a Carl y Sheen buscaran al verdadero responsable, quien resulto ser el propio Bueford Lee Stormshuckle, el oficial de la prisión juvenil, asi Jimmy demostro su inocencia.

Hugh Neutrón vuelve a usar a Flippy, para el evento del dia del padre que se celebrara en la Escuela Primaria Lindbergh, pero sus chistes son tan malos, que Jimmy creo un chip del chiste, pero dicho chip hace que el muñeco le quite su cerebro y tener vida propia.

Jimmy and Timmy are at it again: bickering over the affections of Cindy, but somehow end up fighting off enemies together!

Jimmy Neutrón manda a los maestros (que venían de una convención) a una dimensión desconocida, y hace que no tengan clases, les dice a todos que pasaran la voz, pero Carl lo arruina llamando a sus padres, y estos fungen como sus maestros temporales, avergonzando a Jimmy y amigos.

Jimmy trata de hacer que los alumnos se rebelen con una formula, pero se la confiscan, y los adultos lo toman, y al final, regresan los maestros, y castigan a Jimmy por sus travesuras.

The kids become news anchors for a local television network.

El Padre de Sheen ya no se siente respetado por su hijo, porque el prefiere jugar con Ultra-Lord, entonces le pide ayuda a Jimmy, y ser el superheroe, "El magnifico" por un dia, pero su habilidad en refrigeración salvo a Sheen y Carl de una muerte segura.

Hubo un concurso de mascotas en Retroville, originalmente Goddard y Jimmy ganaron, pero fueron descalificados al ver que Goddard era una maquina y no mascota. debido a las criticas que le generaron, Goddard decide irse, argumentando que mereceria un perro de verdad, al final de cuentas logro salvar a Cindy y Humprey de una muerte segura, y gano un trofeo por su heroismo.