Japón quedó destruido tras el Gran Desastre. Kiruko acepta el pedido de llevar a un chico llamado Maru al "paraíso". Por otro lado, hay niños que viven encerrados en un orfanato lleno de vegetación exuberante. Tokio recibe un mensaje misterioso y empieza a dudar de todo lo que lo rodea.

Maru y Kiruko están en una extraña taberna y les empieza a dar mucho sueño. Cuando despiertan, ven algo monstruoso iluminado levemente por la luz de la luna. En el orfanato, Tokio sospecha más y más del mundo que lo rodea. Mientras tanto, Shiro recibe un mensaje inesperado.

Tokio ve a unos bebés de apariencia extraña y se da cuenta de lo poco que conoce su entorno. Maru y Kiruko sufren un ataque espantoso a bordo de un barco del que no pueden escapar. Nada parece dar resultado, así que todo dependerá de que Kiruko idee una estrategia nueva.

Maru y Kiruko descubren que el Dr. Usami tenía un botón con el mismo patrón que el logo que encontraron en el rayo Kiru. Deciden seguir su rastro y se encuentran con un misterioso informante en el camino. Mientras tanto, la sala de maternidad tiene una reunión de emergencia.

Maru y Kiruko llegan a un próspero mercado. Es la ciudad donde el rumoreado Ministerio de Reconstrucción controla todo. Mientras tanto, la academia es atacada de repente. Mientras intentan refugiarse, los niños encuentran un agujero en la pared.