O Japão foi arrasado pela Grande Catástrofe. Kiruko aceita levar um rapaz de nome Maru a um lugar chamado Paraíso. Entretanto, há crianças a viver por detrás dos muros de um orfanato entre paisagens verdejantes. Após receber uma mensagem misteriosa, Tokio começa a duvidar do mundo que o rodeia.

Tokio é levado a ver alguns bebés de aspeto bizarro e percebe o quão pouco sabe acerca do que o rodeia. Num navio sem escapatória, Maru e Kiruko são vítimas de um terrível ataque. Com tudo a falhar, cabe a Kiruko pensar numa nova estratégia.