This opens like a documentary that you would see on the History Channel, with a narrator giving background details on the fictional Rambaldi character. Then it is intercut with a scene of Kevin Weisman and Rachel Nichols. There are interviews with J.J. Abrams, Jennifer Garner, Property Master Chris Call, Rachel Nichols, and Producer Robert M. Williams, Jr, Michael Vartan, Property Master Parker Swanson, Executive Story Editor Breen Frazier, and Ron Rifkin. They talk about Rambaldi's role in the show. Various artifacts/props are displayed.

Sydney Bristow est à la fois étudiante et agent pour le compte d'une branche secrète de la CIA, le SD-6. Personne,pas même ses deux meilleurs amis Francie et Will ne sont au courant de sa double vie,mais lorsque Danny la demande en mariage, elle décide de lui réveler son secret.Malheureusement,quand le SD-6 apprend que Danny sait la vérité,ils le font assassiner.Le père de Sydney,Jack Bristow,lui aussi membre du SD-6, l'aide à échapper à des tueurs et lui apprend que le SD-6 n'appartient pas à la CIA mais à une organisation secrète: l'alliance des 12. Décidée à détruire le SD-6, elle se rend à la CIA pour tt leur dire et devient leur agent double.

Sydeny est maintenant agent double pour le compte de la CIA et son agent de liaison est l'agent vaughn. Sloane, le chef du SD-6, l'envoie elle et son partenaire Dixon en mission à Moscou : ils sont chargés de récupérer des fichiers volés contenant des information sur des arsenaux nucléaires sovietico-américains.Ceux-ci apprennent à Sloane qu'une bombe nucléaire datant de la guerre froide est cachée quelque part aux USA, Sydney est chargée de la retrouver. Vaughn l'informe ensuite que le SD-6 a vendu la bombe à un trafiquant du nom de Ineni Hassan.la CIA la charge de la retrouver et de la détruire ...

La vie de Sydney est en danger quand elle doit aller à Madrid, retrouver un parchemin de 500 ans avec une série de chiffres et rencontre l'agent du K-D, Anna Espinosa. Pendant ce temps, Will cherche la cause de la mort de Danny et découvre une anomalie très étrange.

Sydney et Dixon vont dans une dangereuse affaire pour protéger un membre de l'OMC. Francie confronte Charlie à propos de son rendez-vous amoureux avec une autre femme et Will continue de chercher la vérité sur le meurtre de Danny.

Le statut d'agent double de Sydney est découvert après avoir enlevé un ingénieur en biotechnologie dans le SD-6 pendant sa mission à Berlin. Will rencontre une femme qui confesse que Danny avait une relation avec elle un peu avant sa mort et Vaughn informe Sydney que son père pourrait travailler avec une troisième agence.

Sydney va incognito dans un hôpital psychiatrique pour avoir des informations de la part de Shepard, un homme qui a été programmé pour être un tueur endormi. Pendant ce temps, Sydney commence à être convaincue que son père est responsable de la mort de sa mère 20 ans plus tôt. Will découvre la véritable identité de la femme qui affirme avoir eu une relation avec Danny et Francie découvre que son mari n'a aucune relation avec une autre femme. Marshall découvre lui, que le virus implanté dans les ordinateurs du SD-6 a été envoyé par la CIA.

En aidant Shepard à sortir de son asile à Bucarest, Sydney découvre la choquante connection qu'il a avec son passé. Pendant ce temps après avoir traqué le virus de la CIA, Sloane est confronté au représentant de l'Alliance, Alain Christophe qui suggère que une ou plusieurs taupes auraient infiltré le SD-6. Will continue d'enquêter sur la femme qui affirme avoir été la maîtresse de Danny et Sydney découvre la vérité sur l'implication de son père dans la mort de sa mère 20 ans avant.

Sydney se rend vite compte qu?un agent du SD-6 la suit. Son père Jack Bristow trouve cela inhabituel. Elle est envoyé par le SD-6 chercher avec Dixon des manuscrits de Rambaldi. Tandis qu?elle récupère les documents dans un tunnel, Dixon resté à l?extérieur est blessé lors d?un combat.

Sydney sort du tunnel et trouve Dixon sérieusement blessé. En dernier ressort, elle appelle la CIA pour obtenir de l'aide. L'agence envoie un hélicoptère afin de transporter Dixon. Dixon étant toujours à l'hôpital, Sydney part seule en Italie. Elle doit récupérer le n° de compte d'un businessman égyptien véreux à partir de l'ordinateur de Gérace, un milliardaire tout aussi douteux. Vaughn révèle à Sydney que le SD-6 veut prouver à travers cette mission qu'elle est une taupe de la CIA. De son côté, Will poursuit son enquête sur la mort de Danny.

Après sa capture, Sydney, qui a été démasquée, se réveille dans une cellule délabrée du SD-6. Elle est conduite dans une salle de torture mais au dernier moment, l'interrogatoire qu'elle doit subir est annulé. Russek, qui est dans la ligne de mire du SD-6, n'a pas autant de chance qu?elle : il est torturé avant d'être executé. Sydney, heureuse d'être en vie, fait le récit de son évasion à Vaughn.

Sydney est envoyée à la Havane pour sortir son père des griffes de Hassan, un trafiquant d'arme bien connu de Sydney. Le père et la fille sortent victorieux de cette délicate mission et apprennent à mieux se connaître. Mais Vaughn détruit la faible confiance que Sydney porte à son père en lui annonçant qu'autrefois Jack travaillait pour le KGB et qu'il serait responsable des meurtres d'une vingtaines d'agents de la CIA, dont le propre père de Vaughn.

Des hommes armés prennent le commandement du SD-6. Cole McKenas est à leur tête, il prend sa revanche sur son ex-patron Sloane. Sydney et Jack s'allient pour sauver leurs collègues. De son côté, la CIA s'interroge sur les relations entre Vaughn et Sydney ...

Cole, le mercenaire qui a pris en otage les membres du SD-6, recherche un flacon qui a un rapport avec Rambaldi. Il soumet Sloane à un interrogatoire musclé. Dixon parvient à envoyer discrètement un mail pour alerter la CIA. Vaughn, qui n'est plus l'agent traitant de Sydney, fait tout pour qu'une intervention soit déclenchée, mais ses supérieurs sont sceptiques. Pour en avoir le coeur net, il se rend seul au SD-6 et aperçoit une étrange camionnette garée au sous-sol ...

Après l'assaut sur SD-6 par une organisation secrète, Sydney découvre que le clan rival FTL a été attaqué et son leader exécuté exactement à la même date. Sloane, lui explique que ce groupe mystérieux a contacté K-Directorate, leur proposant de partager l'information. L'objectif de SD-6 est de déterminer le moment et l'endroit du rendez-vous entre ce groupe mystérieux et K-Directorate ...

Alors que les balles sifflent autour d'elle, Sydney réussit à se cacher dans l'immeuble le plus proche et échappe de justesse à ses poursuivants avec l'aide de Dixon. Elle retourne au SD-6 avec la vidéo de la rencontre entre le mystérieux Mr Sark et K-Directorate et en donne une copie à Vaugh ...

Un espion du Département de Recherche Spéciale mène l'enquête sur les liens personnels de Sydney avec le réseau Rambaldi. Au même moment, au Brésil, Sydney, poursuivie par des hommes armés, tente de sauver sa peau. Elle arrive au sommet d'une falaise et saute, sauvée par son parachute ...

Dissimulée sous sa perruque, Sydney se cache derrière les roues d'une grosse voiture américaine, tentant d'échapper à une escouade de policiers... Où va-t-elle ? D'où s'est elle échappée ? La cavale se termine sur un quai d'embarquement, n'ayant pas d'autre issue, elle appuie son pied sur l'accélérateur et plonge avec sa voiture dans l'eau ...

Suite à son échappée sous-marine, Sydney s'est rendue au Mont Subasio en Italie, elle escalade les montagnes, prouvant de cette façon qu'elle n'est pas au coeur de la prophétie Rambaldi. Arrivée en haut, elle appelle la CIA via son téléphone-satellite ...

En sécurité dans la maison de garde champêtre de la forêt d'Arkhangels, Sydney dort tout contre Noah. Cet instant de bonheur est interrompu quand les soldats de Khasinau prennent d'assaut la maison. Sydney et Noah parviennent à s'échapper par un passage secret ...

Pour attraper Khasinau et se rapprocher ainsi de sa mère, Sydney épaulée par Vaughn, met en place une transaction secrète avec un représentant du réseau Rambaldi : Mr Sark. Mais le secret de Sydney risque d'être compromis par un agent SD-6, envoyé pour empêcher la négociation ...

Dixon a compromis l'échange des diamants contre l'ampoule. Afin de répliquer, Vaughn lance une grenade dans la cour. Sydney tente de s'échapper et se blesse à l'épaule en se battant avec son coéquipier ...

Will battu brutalement et évanoui, est traîné jusque dans une réserve sombre, où Mr Sark lui pose quelques questions à propos de «La circonférence», mais celui-ci reste sans réponse ... Un horrible interrogateur de Taiwan «costume et lunettes» qui avait torturé Sydney quelques mois plus tôt pénètre dans la pièce équipé d'une panoplie d'armes effrayante. Sydney reçoit un appel de Sark pour organiser le transfert de son ami en échange de l'ampoule de solution et de la page Rambaldi qui avait été volée à Paris. L'échange doit avoir lieu à Taipei dans 24 heures ...

Sydney récapitule sa mission la plus récente à un psychiatre de la CIA : attachée à une chaise quelque part dans Taipei, Khasinau lui présente son supérieur : Irina Derevko. Celle-ci n'est autre que la mère de Sydney qu'elle croyait morte ...

Sous la surveillance de l'assistant du Directeur Kendall, Irina est conduite enchaînée dans une cellule d'une prison secrète de la CIA. Jack doute de la sincérité d'Irina envers Sydney. De son côté, Sydney confie à Vaughn qu'elle soupçonne Sloane d'avoir tué sa femme ...

Sydney apprend que la caméra qu'elle a volée est seulement un prototype, la vraie caméra est sur le point d'être lancée dans l'espace à partir d'un site au Sri Lanka dans 72 heures. Cette caméra permet de voir sous la croûte terrestre ...

Alors que Sydney nage entre deux eaux, elle prend l'arme d'un collègue noyé et tire à travers la glace. Dixon l'aide à se hisser dehors. Dans les bureaux du SD-6, Sydney dit à Sloane que Sark s'est enfui avec la boîte à musique qui était rouillée de toute façon. Sloane se demande pourquoi Rambaldi a placé l'objet dans la glace ...

Sydney informe les membres de la CIA que Jack l'a sauvée du piège tendu par sa mère Irina. Le SD6 est à présent sur les traces d'une nouvelle arme ...

Sloane informe Sydney que Richter a été infecté par le virus d'ebola que Sark a mis au point. Jack laisse entendre à Sydney que bien qu'il lui ait fait passer les tests, enfant, il n'a jamais voulu la forcer à devenir une espionne. Le procès d'Irina approche ...

Vaughn enveloppe ses ongles en sang et se dirige vers la cellule d'Irina. Elle le remercie d'avoir prouvé l'engagement de Jack à Madagascar. Vaughn admets qu'il est malade et demande à Irina ce que Khasinau a appris de son expérience sur les gens exposés à la «balle rouge» ...

Sydney dit à Sark que s'il la dénonce, elle fera de même. Sark essaye de la rassurer, lui disant qu'il doit aussi se taire pour sa propre sécurité. Plus tard, Sydney, inquiète, demande à Irina si elle a dit à Sark qu'elle était un agent double. Irina lui assure qu'elle a su se taire mais que cela ne veut pas dire qu'elle n'est pas en danger ...

Sydney dit à Sark que s'il la dénonce, elle fera de même. Sark essaye de la rassurer, lui disant qu'il doit aussi se taire pour sa propre sécurité. Plus tard, Sydney, inquiète, demande à Irina si elle a dit à Sark qu'elle était un agent double. Irina lui assure qu'elle a su se taire mais que cela ne veut pas dire qu'elle n'est pas en danger ...

Sydney dit à Will que Delvin approuverait qu'il fasse des recherches, s'il surmonte un test d'évaluation psychologique. Francie entre dans leur conversation et leur demande pourquoi il y a tant de secrets entre eux. Plus tard, Irina essaye d'expliquer à Syd pourquoi elle a travaillé avec le KGB, et lui dit qu'elle a été folle d'abandonner sa fille ...

Sydney révèle sa mission sur le système Echelon à Will et croit que Marshall est en sécurité avec la CIA. Marshall est en fait en train d'être torturé par Suit et Glasses, qui demande à savoir où le système Echelon est localisé. Terrorisé par la mort, Marshall accepte plus tard d'utiliser sa mémoire photographique pour réécrire le code d'Echelon ...

Jack est attaqué lors sa rencontre avec un contact dans un sombre cinéma. Alors qu'il prend la fuite, Sydney arrive et le secours. Il lui explique que l'Alliance est après lui parce qu'elle le suspecte d'avoir extorqué 100 millions de dollars à Sloane. Sydney est déçue qu'il ne lui ai pas dit avant. De retour à la CIA, Jack explique à Sydney le scénario du chantage qui va impliquer Sloane et Emily ...

Dans un confortable 747, Sydney joue les call-girls pour un homme. Elle se rapproche de lui et l'oblige à lui révéler l'endroit où se trouve le serveur 47. Ayant eu l'info, elle le frappe et court télécharger les données du terminal. Avant de partir, elle doit maîtriser un garde. Mais le type de tout à l'heure braque une arme sur elle ...

L'agent de la CIA, Jim Lennox est au lit avec sa partenaire, Emma Wallace. Elle lui propose de retourner aux Iles Fidji. Après avoir donner son accord, il va prendre une douche. Emma tape un e-mail : Mission Avortée. Lennox est un ? ... Lennox l'assomme avant qu'elle ait le temps de finir le message. Il appelle Sloane pour lui dire qu'il a été démasqué ...

Sydney et Vaughn se réveillent dans les bras l'un de l'autre. Syd l'informe qu'elle souhaite quitter la CIA et changer de vie. Kendall, son supérieur hiérarchique, ne veut pas la laisser partir et l'informe que si elle décide de quitter l'agence elle ne pourrait plus voir sa mère. Sark kidnappe Caplan, un brillant mathématicien, pour le compte de Sloane, pour qu'il l'aide à décrypter un manuscrit de Rambaldi ...

Sydney et Sloane partent de la banque pendant que Vaughn désarme la bombe dans le sous-sol de la banque. Sloane parvient une de fois de plus à échapper à la CIA. Vaughn et Sydney découvrent que son appartement est sous écoute. Marshall les informe qu'il a fabriqué ce matériel d'écoutes alors qu'il était encore au SD-6. Sloane est à la recherche d'une nouvelle arme destructrice de grande envergure ...

Un ascenseur tombe de 40 étages tuant ses trois occupants. Sark récupère sur l'un d'entre eux, Karpachev, une clef dans son portefeuille. Irina dit a Jack que Karpachev avait un manuscrit de Rambaldi dans son coffre. Sydney apprend qu'une enquête est ouverte sur Vaughn car il est soupçonné de travailler pour l'ennemi ...

Tandis que Vaughn est mis hors jeu en raison de l'enquête dont il fait l'objet, Sydney apprend que sa mère a trahi la CIA en volant le manuscrit de Rambaldi et rejoignant Sloane. Irian et Sloane doivent être retrouvé et Jack est officiellement nommé pour diriger la mission ...

Dixon s'excuse auprès de Sydney pour avoir tiré sur Emily et l'informe qu'il a demandé à être réévalué. Avide de vengeance, Sloane, en a oublié sa quête Rambaldi et dit à Irina qu'il veut à tout prix connaître l'assassin de sa femme ...

Aux funérailles de Diane, Vaughn observe un Dixon affligé avalant secrètement des pilules. Plus tard, il dit à Sydney que Dixon est sous calmants et devrait prendre un peu de repos avant de retourner travailler. Sark suggère que Sloane se rende à Panama City. Bouleversé, Sloane refuse et lui donne un numéro à appeler pour obtenir ce dont il a besoin pendant l'absence d'Irina. Sloane réalise que tuer Diane ne le console pas pour autant de la mort de son épouse. Il continue de baisser les bras et passe les rênes à Sark ...

Francine dit à Sark que la CIA pense que Will a été démasqué. Irina, mise au courant par Sark, refuse de permettre à Francine de tuer Will mais soutient son plan afin de le sortir des griffes de la CIA. Sydney refuse de croire que son ami Will est un agent double et décide de tout faire pour prouver son innocence ...

Irina envoie à Sydney l'ADN du double. Ce qui permet de laver Will de tout soupçon. Sloane, ayant réussi à voler les 24 pièces de Rambaldi appartenant à la CIA, s'apprête à construire grâce aux 47 pièces «l'arme» qui pourrait changer le monde comme le prédisait Rambaldi ...

Sydney vit un véritable cauchemar. Réveillée en plein coeur de Hong Kong deux ans après la bagarre avec le double de Francie, elle n'a aucun souvenir de ce qui a pu lui arriver depuis. La confrontation avec la réalité lui est des plus pénibles. Elle découvre que tout le monde la croyait morte, que Vaughn est remarié et ne travaille plus pour la CIA, que son père est en prison, que Dixon est le nouveau directeur de l'Agence et... que Sloane serait désormais dans le camp des " gentils " depuis qu'il est parvenu à monter la machine de Rambaldi !

Après avoir visionné une vidéo sur laquelle on la voit tuer un diplôme russe, Sydney est plus que jamais décidée à élucider le mystère qui plane sur ces deux années de sa vie. Elle se replonge immédiatement dans le travail et apprend que la Convention, une bande de nationalistes russes anciennement membres du KGB, réclame la libération de Sark contre un de leurs agents...Vaughn avoue à Sydney qu'après sa prétendue mort, il était tellement désespéré qu'il a failli mettre fin à ses jours... Jack soupçonne Sloane d'être lié à la disparition de Sydney et pense que les infos qu'il donne pour démanteler des cellules terroristes ne sont qu'une façade ...

Sydney rencontre Laureen Reed la femme de Michael Vaughn qui travaille à la NSC pour assister la CIA dans la lutte contre la Convention. Elle estégalement chargé d'enqueter sur la mort de Lazarey, un diplomate Russe... Après le crash d'un satellite russe sur leur propre territoire, la CIA décide de surveiller Sark qui est soupconné de créer une riposte nucléaire aux USA. De plus,il pourrait les mener au chef de la Convention ...

Sydney est hantée par le meurtre qu'elle a commis sur Lazaray le diplomate russe ... Pendant ce temps, une équipe de 4 hommes a dérobé dans un labo français des fioles contenant des souches du virus Ebola. Un des hommes a été infecté par le virus lors du cambriolage. Il a été arrêté et Sydney et Laureen sont chargées de son interrogation. Celui-ci leur avoue qu'un second cambriolage va avoir lieu afin de dérober une autre substance qui pourrait rendre le virus Ebola encore plus dangereux ...

Sydney a infiltré une équipe payée par la Convention. Ensemble ils dérobent un agent biologique. Pendant l'opération Vaughn est pris par l'équipe et Sydney doit lui tirer dessus pour prouver sa loyauté. Vaughn est laissé pourmort... Sark, de son côté, récupère l'agent biologique avant que Sydney puisse le récupérer...Vaughn, inconscient et gravement blessé, est récupéré par la CIA. Il est immédiatement transféré à l'hôpital, où Sydney apprend à Lauren que c'est elle qui l'a poignardé ...

Sloane, devenu agent double à la Convention pour le compte de la CIA, demande à Sydney de devenir son intermédiaire ... La Convention veut récupérer un appareil qui leur donnera accès à l'arsenal stratégique de Russie créé par un certain Lang, ingénieur informaticien. C'est une machine testant les failles de sécurité dans lescentres nucléaires. Ayant découvert qu'il ne travaillait pas pour le gouvernement russe, Lang est en cavale pour empêcher la Convention demettre la main sur l'appareil. Sydney et Vaughn ont pour mission de retrouver Lang avant la Convention ...

Sydney réussit à intercepter l'appareil convoité par la Convention et lors de la confrontation finale, elle abat Allison. Mais de son transfert vers l'hôpital, cette dernière parvient à s'échapper en dépit de ses blessures ... Un peu plus tard, Sydney rencontre le psychologue de la CIA afin de lui faire part de son désir d'entamer une procédure expérimentale permettant de luirendre la mémoire. Mais celui-ci tente de l'en dissuader ... Pour sa prochaine mission, Sydney doit accompagner Sloane afin de voler une arme laser destructrice dont veut s'approprier la Convention ...

La NSC découvre que c'est Sydney qui a tué le diplomate Russe Lazaray. La jeune femme est retrouvée à Rome - sur les traces de son passé - puis jetée en prison. Lindsay prend le contrôle de la CIA et décide de faire subir une opération à Sydney afin de lui faire recouvrer la mémoire sur ce qui lui est arrivé durant ces 2 dernières années ... Jack, Vaughn et Sloane s'unissent et mettent au point un plan pour éviter à Sydney, détenue par la NSC, cette opération qui lui détruirait la cerveau ...

Sydney, toujours entre les mains de Lindsay, leur livre sous la torture de fausses informations puis l'équipe réunie par Jack réussit son extraction juste avant l'opération fatale ... Maintenant fugitive, Sydney part avec son père sur le lieu des coordonnées décodées. Ils y découvrent une main humaine avec un symbole deRambaldi dessus ... Pendant ce temps, Dixon est arrêté devant sa famille par le FBI pourobstruction à une enquête fédérale. De plus, une autre piste pourrait permettre à Sydney de retrouver la mémoire avec une thérapie non-chirurgicale développée par le Dr Brezzel ...

De mèche avec Jack et Michael, Lauren fait croire à Lindsay que la Convention réclame la machine de Rambaldi en échange de la libération de Sydney ... Pour des raisons obscures, Lindsay demande à Sloane d'engager un sniper afin d'éliminer Sydney durant la transaction ... Avec l'aide du Dr Brezzel, Sydney retrouve des bribes de souvenirs. Lorsqu'au cours de la thérapie, elle voit Will, elle comprend que son ami a des informations qui peuvent l'aider. Elle décide alors de le retrouver ...

Durant la transaction pour la libération de Sydney, Lindsay est assassiné sur ordre de Sloane. La fiole trouvée dans un hôtel de Varsovie par Sydney et qui s'avère être l'ADN de Rambaldi est récupérée par le Département des Recherches Spéciales de la CIA pour analyses. Peu de temps après, Sydney est enlevée dans son appartement par Kendall qui lui révèle en détails toute l'histoire des 2 années manquantes de sa vie ...

La CIA réussit à retrouver puis à détruire la fiole contenant l'ADN de Rambaldi qui devait servir à fertiliser les ovules de Sydney, l'Elue et la mère supposée de son fils. En même temps Lazaray est libéré puis est assassiné un peu plus tard lors de son arrivée à l'hôpital par Lauren qui se trouve être agent double pour la Convention. En échange de son extraction etde son immunité, un membre de la Convention est prêt à dévoiler tout ce qu'il sait sur ses employeurs. Vaughn et Sydney sont chargés de le récupérer et partent pour la Corée du Nord ...

D'après les infos communiquées par Lisenker à la CIA, un micro-disque contient l'agenda Delyack qui dévoile les plans des 6 cellules du Covenant dont les noms et les quartiers généraux des leaders de ces cellules. La CIA veut mettre la main sur ce micro-disque caché dans un chalet à Chamonix. Le système de sécurité ultra-perfectionné étant impossible à franchir, Sydney et Weiss doivent en retrouver l'auteur : Toni Cummings... Sark, de son côté, entre en contact avec Lauren et lui propose de s'allier pour éliminer les leaders du Covenant afin d'en prendre le contrôle ...

La CIA a intercepté une transmission indiquant qu'un groupe de terroristes serait en possession d'une charge à plasma, une bombe qui pourrait causer beaucoup de dommages. Afin de localiser et intercepter la bombe, Sydney et Vaughn doivent accéder aux ordinateurs d'un bâtiment d'entreposage digital à Vancouver ... Jack est chargé de coordonner une enquête pour découvrir s'il y a une taupe au sein de la CIA ...

Un certain Daniel Ryan a apporté une amélioration à la bombe à plasma qui la rend impossible à désamorcer. Pour en faire la démonstration, il a fait exploser un bâtiment du centre-ville. Comme Ryan s'apprête à vendre la bombe au Covenant, la CIA décide de le contacter en se faisant passer pour le Covenant ...

Le sénateur Reed débarque à la CIA pour superviser l'interrogatoire de Sark. Mais ce dernier parvient à s'échapper mystérieusement de l'avion qui le ramenait de France. Peu de temps après, Dixon apprend que Sark retient ses enfants et qu'il exige en échange la libération de 5 agents du Covenant détenus par différents gouvernements. Dixon a alors une décision difficile à prendre qui aura une influence déterminante sur la vie de ses gosses ...

Le Covenant s'est emparé de l'artefact 45 sur lequel est inscrit 'Irina', mais il ne pourra pas l'ouvrir sans la clé. La CIA est d'ailleurs sur la piste d'une carte qui mènera à cette clé. Sydney apprend que la mystérieuse boîte de Rambaldi pourrait renfermer la trace d'une arme biologique capable de tuer des millions de gens ... Lauren est inquiète : pendant que Jack Bristow manifeste des soupçons quant à sa loyauté, Vaughn lui annonce que leur mariage est un échec ...

Le suicide du sénateur Reed et l'aveu de sa trahison innocentent Lauren. Mais Sydney et Jack demeurent perplexes ... Vaughn tente de se rapprocher de son épouse pour l'épauler suite à la mort de son père... En possession du coeur Di Regno, Bomani et Sark sont près de décrypter "Il Dire", la révélation qui mènera au "Passagé" ... Pendant ce temps, la CIA doit enrayer une une cyber-attaque terroriste provenant d'un serveur à Berlin. Le virus semble viser les bâtiments médicaux, les universités, les laboratoires et les hôpitaux ...

Dans 3 jours, Sloane sera donc exécuté. Mais sachant que ce dernier a eu une liaison Irina durant leur mariage, Jack refuse de pardonner à son vieil ami et de l'aider à prouver son innocence ... Au Népal, Sark kidnappe un disciple de Rambaldi susceptible d'avoir des informations capitales ... Après avoir découvert que son épouse est un traître, Vaughn, sur les conseils de la CIA, fait comme s'il ne savait rien afin de surveiller Lauren et d'en savoir plus sur le Covenant et le Passagé ...

Guère enthousiaste, Vaughn doit continuer à jouer double-jeu avec Lauren pour que la CIA puisse 'l'utiliser' ... Sloane explique à Jack et Sydney que d'après Rambaldi, si on injecte l'élixir au Passagé, celui-ci entrera dans un état second qui l'amènera à délivrer un message, message censé être la clé de l'objectif final de Rambaldi. Jack, Sydney et Sloane unissent alors leurs forces pour retrouver le Passagé ... Entretemps, Thomas Brill confie à Vaughn que son père était un disciple de Rambaldi et qu'il a sacrifié sa vie pour protéger la jeune fille que tout le monde recherche. Il demande alors au jeune homme d'empêcher cela d'arriver ...

Retenant Nadia prisonnière, Sloane lui injecte un élixir qui permet au Passagé de délivrer un message venant de Rambaldi lui-même ... Par l'intermédiaire d'Echelon, la CIA intercepte un appel de Sloane qui a contacté un mercenaire ... Sorti de l'hôpital plus tôt que prévu, Vaughn reprend du service. Le jeune homme semble prêt à tout pour mettre fin aux agissements de Lauren ...

Lauren tente de récupérer l'équation dessinée par Nadia avant que Marshall parvienne à la décrypter. L'équation doit révéler les coordonnées d'un endroit qui mènera à Rambaldi ... Sydney s'inquiète du comportement inconscient de Vaughn. Sa haine envers Lauren le pousse à agir sans se soucier des conséquences et des vies qu'il met en danger ...

Tribunal opens with F.B.I. Assistant Director Kendall telling a home-sick Sydney that returning home would jeopardize the lives of the people she loves, including Michael Vaughn. He reminds her that The Covenant could be more deadly than The Alliance, which is why it is imperative that Sydney continues as Julia Thorne since The Covenant think they have Sydney programmed. Reluctantly, Sydney acquiesces.

Suite à une mission déplorable à Shanghaï, Sydney est accusée d'avoir violé le protocole à plusieurs reprises. Son supérieur, la directrice Chase, estime que le comportement de la jeune espionne met en péril la CIA. Elle décide alors de la transférer en Virginie au service du courrier ... Weiss rend visite à Vaughn. Ce dernier n'est plus en service depuis qu'il a mis le feu à sa maison pour faire table rase sur les terribles événements de l'année écoulée et son mariage foireux avec Lauren ...

Après un douloureux face à face avec son père, Sydney confie à Vaughn ce qu'elle a découvert dans le coffre à Wittenberg grâce aux indications données par Lauren ... Nadia apprend à Sydney que le meilleur moyen de trouver Vadik est de passer par Tamazaki, son bras droit. Sachant que celui-ci a tenté, 5 ans auparavant, de dérober un sabre au musée de Londres, l'équipe de APO décide de voler le sabre pour avoir une bonne raison d'entrer en contact avec Tamazaki. Pour les aider à pénétrer dans l'un des musées les mieux gardés au monde, ils font appel aux services du brillant Marshall ...

L'équipe de APO a pour mission de récupérer le valta, un ordinateur à la pointe de la technologie qui a été dérobé il y a 10 jours alors qu'il était transféré aux quartiers généraux de la NSA. Un tel outil, qui devrait révolutionner la collecte d'informations depuis les réseaux de satellites, serait un véritable désastre dans de mauvaises mains. Sydney et ses amis doivent retrouver le Valta avant qu'il soit livré aux Badenliga, un nouveau réseau terroriste d'Allemagne ... Récemment intégrée à l'équipe, Nadia ne partira pas sur le terrain avec ses collègues. En effet, Jack Bristow a suggéré de lui faire passer une série de tests psychologiques afin de voir comment elle réagit à une situation de fort stress ...

Derek Modell est entré en contact avec la CIA pour leur vendre un nouvel agent biologique appelée Cryo 5 qu'il a volé à un trafiquant d'armes du Monténégro. Mais l'échange ne se déroule pas comme prévu. Sydney infiltre alors un hôpital du Monténégro où Modell y travaillait en tant que secouriste pour mettre la main sur un échantillon viable de Cryo 5 ... Vaughn est troublé car il semble voir Lauren partout. Et Nadia s'interroge en découvrant une photo montrant sa mère en train de tenir un bébé autre que Sydney ...

Une arme électromagnétique capable d'altérer les circuits électriques dans un rayon de 15 km a été volée dans un entrepôt en Russie. Le voleur, Yuri Kurelko, un ancien du KGB, fait partie d'un groupe extrémiste connu sous le nom de October Contingent. Sydney et Vaughn sont envoyés en mission pour infiltrer le groupe afin de connaître leurs intentions et de récupérer cette arme électromagnétique susceptible de causer d'immenses pertes dans une ville en neutralisant tous les systèmes électriques et informatiques ...

Nancy Cahill, agent infiltrée depuis 3 ans en tant que professeur à l'université d'Amsterdam, se tire une balle devant l'une de ses étudiantes. Sydney se rend aux Pays-Bas pour retrouver le mari. Elle tombe sur un homme qui vit enfermé depuis des semaines et semble atteint de paranoïa. D'après les analyses, le couple, spécialisé dans le développement de nouvelles molécules, est entré en contact avec une drogue qui affecte le système nerveux et peut provoquer des comportements inhabituels menant jusqu'à des actes d'une grande violence. Sydney, mordue par Jason Cahill, serait-elle infectée ?

Sydney est très contrariée lorsqu'en rentrant de mission, elle trouve Sloane chez elle en train de dicuter avec Nadia ... Une fiole de thorine noire, un explosif très puissant, a été volée en Russie. Une piste amène l'APO sur les traces de Boris Tambor, un magnat du pétrole russe. Sydney et sa soeur font équipe pour cette délicate mission ...

Ancienne agent du K-Directorate, Anna Espinosa refait surface. APO a intercepté une communication révélant qu'elle doit retrouver un contact à Bruxelles. Alors que Sydney s'apprête à partir pour la Belgique pour l'appréhender, Anna kidnappe Nadia pour obliger sa rivale à suivre ses consignes ...

Grièvement blessée par Anna Espinosa, Nadia est dans un état critique. Les médecins l'ont plongée dans un coma pour lui permettre de retrouver un minimum de ses fonctions métaboliques ... Sark accepte de négocier avec APO à condition d'avoir Sloane pour interlocuteur. Selon lui, le seul moyen de mettre la main sur la bombe est de retrouver Ushek San'ko, le dirigeant du Cadmus Revolutionary Front pour lequel travaille Anna. Mais avant de les mener jusqu'à San'ko, Sark a des exigences ...

Vaughn prend quelques jours pour se rendre au chevet de son oncle souffrant ... Autrefois entre les mains de l'Alliance, l'index Blackwell vient d'être volé à la CIA. Encodée dans un terminal mobile, cette liste rassemblent des renseignements incriminant des chefs de groupes, des membres de gouvernements, et autres criminels ordinaires. Personne n'avait jusqu'à présent pu décoder cette liste. Mais les autorités françaises sont depuis peu, sans le savoir, en possession du décodeur. N'ayant pas le temps de procéder par les voies officielles, Sloane charge Sydney de dérober le mini-disc ...

Un dispositif de ciblage biométrique couplé à un système d'armement a été développé par le réseau d'un certain Korjev. Pendant que Sydney part en mission en Autriche pour mettre la main sur cette arme perfectionnée, Jack Bristow se porte volontaire pour retrouver la trace de Sasha Korjev et le neutraliser ... Vaughn, de son côté, requiert l'aide de Weiss pour trouver des informations pouvant l'amener à en savoir plus sur son père ...

Vaughn met Sydney au courant des découvertes récentes qu'il a faites au sujet de son père ... Parallèlement, APO a pour mission de retrouver un dispositif optique capable d'amplifier une impulsion laser susceptible de causer d'énormes dégâts. L'affaire confronte Nadia à son passé puisqu'un argentin du nom de César Martinez est également sur la piste du verre amplificateur. Nadia et César ont un passé commun trouble ...

Sydney est à Cuba pour rencontrer un informateur. Celui-ci permet à APO d'accéder à un disque dur contenant des données cruciales sur un attentat de grande ampleur susceptible de causer la mort de nombreux civils. Mais le disque dur libère une bactérie mortelle dans les conduites d'aération des locaux d'APO ... Pendant ce temps, Sydney tombeentre de mauvaises mains ...

Hanté par les récentes découvertes entourant la mort de son père, Vaughn poursuit son enquête sans beaucoup de résultat. Notamment sur la signification de Nightingale ! Malgré le refus de Michael, Sydney demande l'aide de son père pour accéder plus facilement à des informations. Pour cela, elle est obligée de le mettre au courant de la situation. Et Jack s'empresse de prévenir Sloane que Sydney et Vaughn cherchent des renseignements sur Nightingale ...

A la suite de sa dernière mission, Vaughn disparaît avec la bobine de conversion. N'ayant pas confiance en Sloane, il préfère faire cavalier seul et utiliser l'engin pour obtenir des informations sur son père. Il retrouve son contact à Paris ... Nadia rend visite à sa tante, Katya, emprisonnée au centre de détention de Quantico. Celle-ci se sert de sa jeune nièce pour obliger Sydney à lui parler ... Sloane tente de convaincre Sydney de prévenir APO dès qu'elle saura où se trouve Vaughn ...

De retour à Los Angeles, Vaughn explique à Sydney que toute cette affaire sur la soit disant non-mort de son père a été orchestée par Sloane. Son père a bien été tué en 1979 par Irina Derevko, et Sloane a tiré les ficelles pour lui faire croire que son père était toujours en vie. Troublée, Sydney lui apprend qu'elle a découvert grâce aux enregistrements bancaires que ce n'est pas sa mère qui avait passé un contrat sur sa vie mais Sloane. Informé, Jack Bristow décide d'en avoir le coeur net en confrontant Sloane à la vérité ... Pendant ce temps, une spécialiste en physique nucléaire est kidnappée par un homme qui se fait appeler ... M. Sloane !

Une nouvelle organisation terroriste a orchestré un attentat à l'ambassade indonésienne de Copenhague. Il s'agit déjà de leur 4ème attaque. Un agent placé sous couverture dans l'organisation n'ayant plus donné signe de vie, Dixon et Vaughn sont envoyés en mission sur le terrain ... Nadia reçoit la visite surprise de Sophia, celle qui a toujours veillé sur elle lorsqu'elle était enfant. Les deux femmes ne se sont pas revues depuis dix ans ... Et Jack, sous surveillance médicale suite à son exposition aux radiations, tient à ce que ses problèmes de santé restent confidentiels ... jusqu'à l'apparition des premiers symptômes ?

A Vienne, Sydney, Vaughn et Dixon tentent d'intercepter l'hydrosec. Mais l'intervention d'un troisième homme manque de faire échouer la mission. Sophia profite de l'hospitalité de Nadia pour essayer d'obtenir des infos et reprendre l'hydrosec à la CIA ... Sydney s'inquiète de ne pas avoir de nouvelles de son père. En inspectant son appartement, elle comprend que Jack a des ennuis de santé ...

Dans un monastère situé au Mont Inferno, le clone de Arvin Sloane tente de s'emparer de la molécule de l'orchidée de Rambaldi. Cette molécule utilisée pour réguler l'agressivité des abeilles aurait des propriétés chimiques qui renforceraient les sensibilités des récepteurs nerveux. Appliquée sur des humains à l'aide du dispositif de Mueller, les conséquences seraient catastrophiques. APO se lance donc à la recherche du double de Sloane ...

Vaughn fait part à Jack de son intention de demander sa fille en mariage. Mais ils sont interrompus par une fouille officielle dans les locaux d'APO. Suite à plusieurs incidents tracés sur l'ordinateur portable de l'Agent Santos, Chase fait confisquer tous les documents importants et s'apprête à arrêter Nadia. Mais en découvrant un micro émetteur dans le médaillon offert par Sophia à la jeune femme, ils comprennent qu'ils se sont trompés de cible. Bouleversée d'avoir été flouée, Nadia est déterminée à retrouver Sophia ...

Hospitalisé dans un état critique, Dixon confie à Sydney qu'il a vu sa mère retenue prisonnière par Sophia alias Elena Derevko. La jeune femme ne peut croire que sa mère soit en vie. Elle pense plutôt à un piège. Mais Jack semble déterminé à explorer toutes les pistes. L'une des pistes mène vers Lucien Nisard, un ancien du Covenant, identifié comme étant un des associés d'Elena. Quant à Nadia, elle apprend enfin la vérité sur l'assassinat de sa mère ...

La famille Bristow a deux heures pour désactiver le dispositif avant que les frappes aériennes russes ne tentent de le détruire. Sa destruction libèrera des toxines capables de causer de terribles dégâts pour la planète. Ils doivent alors se dépêcher de localiser le dispositif que seule Irina peut désactiver... Associé à Elena, Sloane part diriger l'équipe d'assaut sur le terrain pour empêcher l'équipe d'APO de leur mettre des bâtons dans les roues ...

Alors qu'il s'apprêtait à faire une importante révélation à la femme de sa vie, Vaughn et Sydney ont un accident de voiture. Lorsqu'elle reprend connaissance, Sydney réalise que des inconnus sont sur le point d'enlever Vaughn. Redoutant le sort qui lui est réservé, elle parvient à s'échapper mais ne peut les empêcher d'embarquer son fiancé pour une destination inconnue. Une fois en sécurité, la jeune femme est interrogée par un certain Gordon Dean du Département des Enquêtes Spéciales. Celui-ci mène une enquête sur l'agent Vaughn, soupçonné d'être un agent double ...

Sydney retrouve la trace de Renée Rienne, infiltrée dans un bar de Londres. Enceinte, la jeune espionne lui propose de travailler ensemble pour retrouver les hommes qui ont commandité l'assassinat de Vaughn ... Jack met ses agents sur une nouvelle piste menant à Ivan Curtis, l'homme qui a tué Vaughn. Et il doit également recruter un nouvel agent pour combler la place laissée vacante par Vaughn ...

Des fioles contenant un neurotoxique appelé Substance 33 ont été dérobées dans un centre de recherche à Istanbul. Cet acte aurait bien pu être commandité par Gordon Dean, un ancien de la CIA devenu indépendant. Marshall pense qu'un hacker a aidé le voleur à pirater le système de sécurité. Pour mieux localiser l'ordinateur, il doit se rendre à Prague d'où vient la source du signal. Sydney est obligée de faire équipe avec Thomas Grace, le nouvel agent ... Pendant ce temps, Dixon doit accompagner Sloane qui a obtenu une permission de sortie de 72 heures pour rencontrer un contact susceptible de l'aider à trouver un traitement qui sauverait Nadia ...

En garde à vue chez APO, Rachel note les renseignements qui peuvent être utiles pour mettre fin aux agissements de Gordon Dean. Ce dernier s'organise de son côté pour faire disparaître les traces. Tous ses comptes ont été transférés vers un compte de secours aux îles Caïmans. Rachel peut aider les agents d'APO à saisir la totalité de l'argent ... Pendant ce temps, Sloane comparaît devant le Ministère de la justice qui doit statuer sur son sort ...

Libéré de prison, Sloane demande à être réintégrer chez APO. Il espère ainsi utiliser les ressources de la CIA pour trouver un remède pour sauver Nadia ... Renée Rienne s'est introduit dans un entrepôt militaire afin de se procurer un stimulant expérimental capable de ressusciter les blessés graves. APO pense que la jeune femme a volé le corps il y a un mois au labo. Sydney décide de la rencontrer pour connaître ses intentions ...

Surveillée par Gordon Dean, la famille de Rachel Gibson est en danger. APO décide de lui faire bénéficier du programme de protection des témoins ... Sloane ayant réintégré APO, Gordon lui demande d'utiliser les moyens de l'agence pour retrouver Janos Vark, un concepteur d'armes. Sachant que Gordon traque Vak depuis 6 mois, Sloane convainc sans mal Jack que s'ils le retrouvent les premiers, ils pourraient l'utiliser comme appât pour attraper Gordon ...

Avec l'aide de Renée, Sydney double Gordon Dean en se procurant un carte d'accès qu'il convoitait ... Selon le médecin, il n'y aucune chance que l'état de Nadia s'améliore. Alors que Sloane commence à perdre espoir, Dean le contacte et lui demander de récupérer la carte pour lui ...

Quelques transmissions interceptées portent à croire que les britanniques sont en train de se porter acquéreurs d'une Bombe à Micro-Impulsions, capable de faire entrer en combustion spontanée les personnes dans les alentours. Accompagné de Sydney, Jack se rend en Angleterre pour rencontrer son contact du MI-6. Il lui faut savoir si le MI-6 est derrière les événements survenus en Sibérie ...

L'APO est alertée. Un service de stockage de données sensibles a été attaqué par un membre de Prophète 5, et toutes les informations concernant Vaughn ont été dérobées. Sydney prend contact avec Renée Rienne pour savoir si elle a une idée de ce qu'ils recherchent ...

Prisonnière sur un cargo en pleine mer, Sydney tente d'échapper à ses poursuivants. Elle parvient in extremis à envoyer un appel au secours par radio. Transmission que Marshall intercepte sans mal. Mais le message, situé sur un serveur chez Langley, a été endommagé. Ce qui signifie qu'une taupe se cache au siège de la CIA. Le seul moyen pour APO - de récupérer le message et ainsi tenter de localiser Sydney sans alerter le traître - est de pénétrer par effraction au siège de la CIA ...

Suite à la trahison d'un dirigeant de la CIA, l'APO est surveillée de prêt par Devlin. Jack et son équipe doivent donc prendre certaines décisions discrètement.

Sydney passe un examen à l'hôpital, qui lui rèvele que son bébé et elle-même sont en bonne santé, et même que l'opération qu'elle a subi dans le cargo leur a permis d'aller bien. Le convoi qui doit transferer Davenport est intercepté, et celui ci est exécuté par Irina Derevko, après qu'elle se soit assurée de ce qui avait été transmis à Jack. Celle-ci rejoint Sydney à son domicile pour avoir une nouvelle chance de trouver l'Horizon, mais cette fois-ci en passant pour la maman attentionnée. Sydney, Jack et Irina partent en mission pour chercher l'Horizon mais Irina les trahit, et envoie Kelly Peyton sur leurs traces. Jack part s'occuper de Peyton, alors que Sidney tient sa mère ne joue. À son retour, Jack trouve sa fille sur le point d'accoucher. Aidée de ses parents, elle donne naissance à sa fille dans un immeuble abandonné. Irina en profite pour disparaître avec l'Horizon.

Kelly Peyton engage Anna Espinosa, qu'elle aide à s'évader de sa prison.

Toutes deux s'attaquent à Will Tippin, pourtant sous le programme de protection des témoins. Jack et Sloane en informent Sydney, qui décide de mettre fin à son congé de maternité pour retrouver son ami le plus vite possible. Ce qu'elle ignore, c'est que l'enlèvement de Will n'est qu'un appât pour cacher une opération très spéciale.

Sloane obtient enfin l'antidote qui peut sauver Nadia, mais il se retrouve devant un dilemme : il peut la tuer en cherchant à la sauver ... Cependant, Jack a des doutes concernant la provenance de cet antidote et par conséquent, des agissements de Sloane.

Sydney doit poursuivre Anna qui sait désormais où se cache Vaughn. Il est en route pour en savoir plus sur la puce que Renée détenait dans son corps. Quant à Sloane, il voit des morts, et plus précisément Nadia, qui le hante alors qu'il travaille pour Prophet 5.

Sydney doit se faire passer pour Anna, afin d'en savoir plus sur les plans de Sloane et sur Prophet 5. Elle est donc ensuite obligée de travailler avec Sark, pour récupérer le dernier objet de Rambaldi dont Sloane a besoin pour achever son plan machiavélique.

Rachel et Marshall sont capturés par Sloane afin qu'ils l'aident à trouver un endroit précis, nécessaire au plan final de Rambaldi. Etant donné l'absence de Marshall, c'est sa femme Carrie qui prend le relais et va aider l'APO à retrouver les deux agents manquants.

L'APO est détruit et tous les membres de Prophet 5 ont été assassinés. Sloane court toujours, plus dangereux que jamais. Réfugiés à Sienne, Vaughn et Sydney élaborent un plan pour le stopper définitivement. Ils kidnappent Peyton pour obtenir des informations sur ses projets. Mais Sloane, toujours à la poursuite du secret de Rambaldi, découvre son tombeau en Mongolie et peut enfin enclencher la phase finale de son plan diabolique.