La Do-Re-Mi, farta dels fracassos amorosos, decideix entrar en una botiga màgica, s'hi troba la Majòrica, l'assenyala amb el dit dient-li que és una bruixa i la converteix en una mena de granota. Ara la Do-Re-Mi també s'haurà de fer bruixa.

La Do-Re-Mi té moltes ganes d'explicar a la seva millor amiga, la Hazuki, que és aprenenta de bruixa, però si ho fa també es convertirà en una mena de granota llefiscosa, igual que la Majòrica. Amb la màgia es canviaran l'una per l'altra.

La Do-Re-Mi decideix portar les seves amigues, la Hazuki i l'Aiko, a la botiga màgica per dir a la Majòrica que en sospiten. Al final no quedarà altre remei que convertir les tres nenes en aprenentes de bruixa.

La Do-Re-Mi, la Hazuki i l'Aiko reformen la botiga màgica i l'obren per vendre objectes màgics que han fet elles mateixes. Han de treballar per pagar-se les boletes màgiques que necessiten per practicar els trucs de màgia.

La Nobuko és una nena molt mentidera, que s'inventa tota mena d'històries. A través d'una de les seves fantasies, les aprenentes de bruixa li faran veure que no està gens bé, això de dir mentides, encara que no ho faci de mala fe.

Ha arribat el gran moment! Les tres amigues hauran d'aprovar l'examen del nivell 9 si es volen convertir en bruixes. La Do-Re-Mi es queda amb una sola boleta màgica per anar a l'examen. La Hazuki i l'Aiko ho tindran més bé.

La Dela, la bruixa comerciant, explica a les nenes que hi haurà una convocatòria especial per les que hagin suspès l'examen del nivell 9. Serà l'oportunitat de la Do-Re-Mi per posar-se al mateix nivell que les seves amigues.

La DO-DO és tan desastre com la Do-Re-Mi i la nostra amiga no para de renyar-la. Un dia, la DO-DO s'enfada i se'n va de casa. Ara que les tres nenes ja han aprovat el primer examen, uniran els seus poders per trobar la fada de la Do-Re-Mi.

La Kanae, la reportera de la revista de l'escola, descobreix unes fotos de la Do-Re-Mi, la Hazuki i l'Aiko treballant a la botiga màgica. Com que va en contra de les normes, la senyoreta Seki i el subdirector ho aniran a comprovar.

La Marina Koizumi matina cada dia per anar a cuidar les flors de l'escola. Els nens es riuen d'ella i deixa de fer-ho. Una tempesta molt forta farà que les tres aprenentes de bruixa hagin de fer mans i mànigues per protegir el jardí de l'escola.

Un bon dia apareix en nen a la botiga màgica, que vol un amulet en forma de pilota de futbol. A canvi els deixa una samarreta. En Misaki té un germà més gran que vol ser titular de l'equip de futbol; per això li regala l'amulet.

L'examen del vuitè nivell no sembla gaire difícil, però les examinadores, la Mota i la Mota-Mota, demanen a les tres aprenentes que escriguin en un paper les coses que els fan més por. Al final arriben tres segons tard. Les aprovarà, la Reina de les Bruixes?

Els S.O.S. no paren de fer befa de la Naomi, i al final la fan plorar. En Yuuji, un dels tres nens que formen el S.O.S. queda tan afectat, que perquè la Naomi el perdoni, haurà d'aconseguir que la nena es cargoli de riure.

La Popi va a veure la seva germana, la Do-Re-Mi, a la botiga màgica i descobreix la Majòrica. Se n'enamora, d'aquell ninot llefiscós de color verd, i se l'emporta a la guarderia. Com que la bruixa no té la seva bola màgica, no se'n pot escapar.

La Do-Re-Mi s'enamora d'en Shingo i se'n va a pescar amb ell i el seu pare. La Hazuki i l'Aiko els acompanyaran per crear un ambient romàntic a base de trucs de màgia, però al final resultarà que en Shingo té altres coses al cap.

En Masaru és un nen molt conflictiu. El seu pare, després de molts anys a l'estranger, torna a casa, però hi ha un malentès i la policia el pren per un lladre. La Hazuki, que el coneix de petit, sap que en Masaru no és així i vol ajudar-lo.

La Do-Re-Mi, la Hazuki i l'Aiko coneixen una nena, la Nanako, que diu que odia els animals. Per fer que li tornin a agradar li donen un conill, però un gat li fa mal. La Hazuki se'n sent culpable i cura el conill fent servir la màgia.

Els germans Papaya segresten la Hazuki, que és de família molt rica, per demanar un rescat. La Hazuki, que està castigada sense poder fer trucs de màgia per haver fet servir la màgia prohibida, s'haurà de refiar de les seves amigues.

La bruixa Majòrica, que té molts deutes, decideix jugar-s'ho tot a pòquer amb la Dela, i acaba perdent la botiga màgica. La seva rival des de l'escola de bruixeria, la bruixa Majòruca, vindrà per quedar-se amb la botiga.

La Majòruca fa servir els seus cabells per fer més efectius els objectes màgics, i esclar, a la botiga en venen més que mai. Però, de cop i volta, tots els que els han fet servir es comencen a trobar malament.

La Dela diu a les tres nenes que aquesta mateixa nit es poden presentar al sisè nivell. El problema és que l'única entrada al Món de les Bruixes és a la botiga de la Majòruca, i no els hi deixa entrar.

La situació no pot ser pitjor: no tenen la Botiga Màgica, no venen amulets i no els queden boles màgiques. Les aprenentes decideixen anar al Món de les Bruixes a buscar feina. Hauran de tallar un munt de llenya per a Sa Majestat.

La Majòruca proposa un repte a la Do-Re-Mi, l'Hazuki i l'Aiko. Si perden, treballaran per ella, i, si guanyen, els tornarà la Botiga Màgica. La Popi acaba descobrint que la seva germana i les seves amigues són bruixes.

La Popi, que ha descobert que el seu "Gomi" parla, i que en realitat és la Majòrica, una bruixa, ara també s'haurà de convertir en aprenenta de bruixa. Per aconseguir-ho, decideix entrar a treballar a la botiga.

Les tres aprenentes ja han aprovat el sisè nivell i reben una bola certificada que té molt més poder que les altres. La Do-Re-Mi descobreix que una companya seva ha d'anar a treballar al restaurant de casa, on no vol entrar ningú, i decideix ajudar-la.

La Do-Re-Mi, l'Hazuki i l'Aiko que s'han convertit en les purarreines, han de buscar objectes que porten mala sort, treure'n la carta negra i segellar-los en un petit cofre portàtil que està custodiat per un personatge ben peculiar: l'Oyajide.

Les nenes decideixen anar de vacances a casa de la Hazuki, on es troben amb la Reika Tamaki. Ella i la Do-Re-Mi s'enamoren d'en Yutaka Kashiwagi, que els diu que sempre que intenta declarar-se a una nena, passa alguna cosa terrible.

A la Botiga Màgica decideixen muntar una paradeta per la festa d'estiu. L'enrenou que provoca un lladre fa que la Do-Re-Mi perdi el seu disc d'aprenenta. El disc el recull una gosseta, que es converteix en bruixa.

Tots els nens de la classe van a passar els últims dies de vacances al Temple dels Yamauchi. En Nobauki els explica que pel cementiri hi viu el fantasma del seu avi, i que el voldria veure per demanar-li perdó pel que li va dir abans de morir-se.

La Shino vol fer un regal a un amic seu de Mongòlia, que li ha regalat un cavallet de bambú, i demana consell a la Do-Re-Mi, la Hazuki i l'Aiko. A més de no poder-la ajudar, es queden sense boles màgiques per presentar-se al nivell 5.

La Reika ha sigut sempre la delegada de classe. Aquest any, però, s'hi presenta en Masaharu Miyamoto, i la Do-Re-Mi, la Hazuki i l'Aiko decideixen donar-li el vot.

És la primera i l'última vegada que els germans Hamada podran participar en el festival esportiu que se celebra cada tardor. En adonar-se que les coses no rutllen gaire bé, les noies sospiten que hi ha d'haver algun objecte que els porta mala sort.

La mare de l'Aiko vol veure la seva filla com sigui, però la mala sort fa que no es puguin trobar mai. Quan descobreix que el seu pare li havia amagat totes les cartes que li havia enviat la seva mare, decideix anar-se'n amb les seves amigues a Osaka.

L'Onpu Segawa, una jove estrella, arriba a l'escola de Misora. Es presenta a un càsting per fer d'actriu principal i, com que és aprenenta de bruixa, fa servir màgia prohibida per influir en la decisió del jurat, pensant que no li passarà res.

Aquesta vegada no s'examinen les nenes, sinó les seves fades: la Dodó, la Reré i la Mimí. Les hauran d'ajudar a arribar a la meta abans que la llebre i que la tortuga, com en el conte.

Hi ha hagut una gran tempesta que ha obert una porta en el món de les bruixes. Una vintena de granotes bruixes han anat a parar al món dels humans amb moltes ganes de passar-s'ho bé.

Tots els nens de tercer han de fer ninots de paper o de plastilina dels sers que més els agraden. A en Ryota no li surt el seu monstre preferit, el Gazamadon, i comença a dir-ne fàstics. Les tres noies intentaran fer-li recuperar l'amor que hi sentia.

Arran d'un encanteri de l'Onpu, en Shuzo s'enamora de la Do-Re-Mi. Per fi, la nena que es considera la més desgraciada del món té nòvio! Però en realitat, a en Shuzo li agrada una altra nena, la Mika.

Fins ara, les nenes han tingut molta sort amb els exàmens de bruixeria. El del nivell tres, però, l'hauran de fer per separat. Hauran de passar per les tres portes del món en un temps i uns encanteris limitats, i evitant tota mena de distraccions.

A en Taniyama, un company de classe, li encanten els escacs japonesos, però el seu pare no vol que s'hi dediqui. Al campionat infantil, les nenes descobreixen que hi ha una peça que li porta mala sort i decideixen ajudar-lo.

L'Amano és un apassionat dels Power Ranger i en Hashimoto no para de molestar l'Onpu. Acaben barallant-se i les nenes decideixen aturar-los fent de Bruixes Power Ranger.

El senyor Tamaki, pare de la Reika, no la renya mai quan es porta malament, i es pensa que no l'estima. S'escapa de casa amb la Shiori, que també s'ha discutit amb el seu pare, i decideixen anar a Kamakura, a veure l'àvia de la Shiori.

La Mutsumi sent una gran admiració per la Candy Ito, una lluitadora molt famosa, i decideix que de gran voldrà ser lluitadora professional. Al final, la decisió dependrà d'un combat que farà la seva heroïna.

Ha arribat la Nit de Nadal i la Popi i els seus amics de la guarderia busquen el Pare Noel per dir-li una cosa molt important. Les tres nenes coneixen el Pare Noel, que està malalt, i l'ajuden a repartir els regals.

L'examen del nivell dos de bruixeria consisteix a fer un truc de màgia davant de totes les bruixes i que els agradi. Amb en Michiaki Watanabe, un company de classe, faran les pràctiques i sense fer cap encanteri miraran d'aprovar.

L'Aiko, pensant que la mare ha refet la seva vida, aconsella al pare que vagi a la cita que li ha proposat el seu cap. La Midori sembla una dona molt agradable, però l'Aiko, que no vol cap altra mare, no l'hi posarà gens fàcil.

L'Onpu té una pàgina web del seu club de fans, però la que li contesta els correus és la fada Hehe, que li organitza un bon enrenou dient que aquest diumenge l'Onpu està disposada a quedar amb tots els seus admiradors.

Fa tres mesos que l'Onpu no veu el seu pare. El pare li ha enviat uns bitllets de tren, perquè el vagi a veure, però abans s'ha de presentar a un càsting per una pel·lícula. Allà hi ha la Karen, que també somia en el paper.

L'últim examen consisteix a fer alguna cosa bona i que algú els en doni les gràcies. D'entrada sembla fàcil, però ben aviat s'adonaran que és més difícil del que es pensaven. ¿Arribaran a ser bruixes, les nostres tres amigues?

L'Onpu, que veu que els familiars i els amics poden descobrir les bruixes, fa servir màgia prohibida per esborra'ls-hi els records i acaba en coma. Si les bruixes no ho solucionen, no es podrà despertar fins d'aquí a 100 anys.