『週刊少年グローリー』で10年以上連載を続けている国民的大ヒット漫画『ミリオンジョー』。それを生み出す漫画家の真加田（三浦誠己）は締め切り間際のある日、呉井（北山宏光）に「心臓が痛い」と電話をするが、締め切りを伸ばすために使う常套手段に呉井はそっけなく電話を切る。いよいよこのままだと原稿が落ちてしまう、と呉井はしぶしぶ真加田の元に向かうが、なんと真加田は死んでいた…。果たして大ヒット中の『ミリオンジョー』は、どうなってしまうのか！？

無事校了を終えた呉井（北山宏光）は、偶然出会ったタクシー運転手（木下ほうか）から「『ミリオンジョー』が人生を救ってくれた」と言われたことをきっかけに、『ミリオンジョー』宛てのファンレターに目を通す。そこで心のこもった手紙が多数届いていたことを知り、自らの手で連載を続けることを決意する。呉井の友人・岸本（深水元基）を仲間に加え、寺師（萩原聖人）と共に3人は、真加田（三浦誠己）の死を隠蔽することに。そんな中、『グローリー』40周年の企画が呉井たちをピンチに追い込む!?

『グローリー』40周年企画のことを真加田（三浦誠己）へ直々に話したいと言う編集長の橋爪（菅原大吉）。慌てた呉井（北山宏光）は岸本（深水元基）に真加田の影武者を急いで用意してくれとお願いするが、影武者探しは難航し、約束の日が近づいてしまう。一方、新キャラのデザインが上手くいかない寺師（萩原聖人）は焦燥に駆られ、“成りすまし連載”の続行に不安を抱く。そして、呉井の前には真加田を崇拝する漫画家の森秋（今泉佑唯）が現れ…。

橋爪（菅原大吉）と真加田（三浦誠己）の影武者との対面は無事に切り抜けたが、大規模な『グローリー』４０周年企画を受けることに。未だ新キャラのデザインに納得できていない寺師（萩原聖人）に、真加田が書き残していた資料の最終章を読んでほしいと提案する呉井（北山宏光）。改めて、真加田の思いを受け取った寺師は…。“成りすまし”の新シリーズが進み、世間の反響が明らかに…！もう誰にも止められない！

呉井（北山宏光）と寺師（萩原聖人）は『ミリオンジョー』のアンケート結果が下がった原因が分からず焦りを感じていた。そこで、呉井たちは禁断の作戦を決行することに。ピンチを切り抜けたかに見えたが、ある日、佐藤（永野）に漫画家・森秋（今泉佑唯）が声を掛け…一体、森秋の目的は…？一方、真加田が持つ多額の資産の使い道で盛り上がる呉井たちは、“成りすまし連載”を最後まで成功させようと再び、意気込む。

佐藤（永野）は、森秋(今泉佑唯)との出来事を呉井（北山宏光）たちに言えずにいた。さらに、徐々に人気が低迷してきた“成りすまし”『ミリオンジョー』にネット掲示板では、怪しむコメントが増えてきた…。そんな中、真加田の電話に『ミリオンジョー』の前担当編集者から連絡が…。追い詰められた呉井達は、“成りすまし連載”の新たな計画始動！さらに、森秋の本性が明らかに!?

本性を現した森秋（今泉佑唯）は、呉井（北山宏光）を問い詰め、核心をつく。森秋に誤魔化すことはもう出来ない…。呉井は一か八かの行動に出る。そして、森秋が提示したのは驚愕の条件だった。一方、アンケート票を取り戻した『ミリオンジョー』は“成りすまし連載”を続け、初版部数が日本記録を更新。しかし、真加田が書いていないことを見抜いた人物が呉井の前に現れ…。編集部内でも『ミリオンジョー』を不審に思う人が増え、ついに左子（津田寛治）が、決定的な証拠を見つける!?

呉井（北山宏光）の“成りすまし”『ミリオンジョー』の証拠を見つけた左子（津田寛治）は、怒りに震えていた。そんな中、呉井は旧友の漫画家・小川アヤカ（草刈麻有）の休載を知り、会って話すことに。“成りすまし”にも慣れ、漫画家としての発言をしてしまう呉井は危機感が薄れ始め…。さらに、40周年のコラボについて、憧れの大御所漫画家・甲野晃（渡辺裕之）との打ち合わせを終えた呉井は、有頂天に。しかし、左子の行動で呉井にピンチ再来!?

左子（津田寛治）は、見つけた証拠を手に編集長の橋爪（菅原大吉）に呉井(北山宏光)の“成りすまし”の真相を伝えようとするが、呉井から、左子の知らない真相を打ち明けられ…。一方、岸本（深水元基）は、その場しのぎの嘘を重ねる呉井に計画はもう潮時だと告げ、真加田のお金をおろすことを提案。ミリオンジョー』の完結を目指す呉井と喧嘩になってしまう。危機感を覚えた岸本は単独である作戦を決行する…！さらに、寺師（萩原聖人）にも予想外の出来事が…!? 徐々に崩壊に向かう呉井たちの運命は!?

寺師（萩原聖人）は、呉井（北山宏光）、岸本（深水元基）、佐藤（永野）、森秋（今泉佑唯）に、『ミリオンジョー』の生命線である創作ノートの最終章が入っていたカバンを盗られてしまったと謝る。最大のピンチに口論するメンバーだが…呉井がある驚異的な才能を発揮し…ついに『ミリオンジョー』の最終章が開幕し、読者の盛り上がりも最高潮に！一方、呉井らは“預金引き出し計画”を実行。しかし、呉井の知らないところで、別の計画が進んでいた…!?

現金到着当日、岸本（深水元基）から連絡を受けた呉井（北山宏光）の嫌な予感は的中した。35億円を受け取った森秋（今泉佑唯）、寺師（萩原聖人）、佐藤（永野）は逃亡。一方編集部内では、校了日にもかかわらず呉井と連絡が取れず慌てていた。寺師と森秋も消えたことを知り、共通点は真加田（三浦誠己）だと考え、橋爪（菅原大吉）と石田（武田航平）は真加田の家へ向かうが…。そして、逃亡中の森秋たちの前に意外な人物が現れ…!?

東京へ戻ることにした呉井（北山宏光）と岸本（深水元基）。しかし、真加田（三浦誠己）のマンションにはすでに警察が！なんとか逃げ切った2人だったが、『ミリオンジョー』の連載は未完のまま終了し、呉井は逃亡者に…。その頃、佐藤（永野）と森秋（今泉佑唯）は真加田のことを話していた。そして、覚悟を決めて寺師（萩原聖人）は、ある場所へ…。真加田の死により交わったそれぞれの人生が、再び別々の道へ…。『ミリオンジョー』を完結させることが出来なかった呉井の衝撃の結末とは…!?