Depuis les événements survenus 18 mois plus tôt, Jack Bauer, mort aux yeux de tous, se cache sous un faux nom. Seules quatre personnes connaissent la vérité ! Il est dans un petit bled en Californie lorsqu'il apprend par la télévision la terrible nouvelle... Michelle, également informée par les médias, décide de se rendre à la CAT pour apporter son aide. Elle se heurte au refus de Tony, qui préfère laisser le passé derrière eux et se consacrer à leur nouvelle vie. Le couple a en effet coupé tout lien avec la CAT depuis plus d'un an... Le Président Logan, de son côté, se prépare à recevoir le Président Russe Yuri Suvarov...

Sachant que son épouse a arrêté son traitement, le Président Logan pense qu'elle est à nouveau en proie à des délires et qu'elle a inventé la conversation téléphonique avec Palmer qui l'avertissait d'un problème de sécurité nationale. Pour s'en assurer, Walt décide de vérifier les enregistrements des appels... Une image de la vidéo de surveillance prouve que Jack Bauer était dans le bâtiment situé en face de celui où Palmer a été tué, une heure avant que le coup de feu n'ait été tiré. Buchanan informe le Président Logan que Bauer est leur principal suspect... Jack décide de se rendre sur le lieu du crime pour tenter de trouver des indices susceptibles de lui indiquer qui veut lui faire porter la responsabilité de la mort de l'ex-Président...

A l'aéroport Ontario, Jack trouve Chevensky, dont le nom figurait caché dans le manuscrit de Palmer. Alors que l'ex-agent de la CAT s'apprête à l'interroger, ils sont interrompus par plusieurs hommes équipés d'armes automatiques et de gilets explosifs qui pénètrent dans le terminal, tuant les agents de la sécurité et prenant les civils en otage. A l'extérieur, les autorités établissent immédiatement un périmètre de sécurité, empêchant Diane de rejoindre son fils qui est à l'intérieur au coeur du conflit...

Dénoncé et mis au pied du mur, Jack est contraint de se laisser capturer par les terroristes afin de sauver la vie de Derek. La CAT ayant perdu le contact avec Bauer, leur assaut est compromis. Le Président Logan refuse d'accéder à la demande des terroristes. La signature de traité est maintenue et un nouvel otage est exécuté... Martha attend le bon moment pour montrer la retranscription de sa conversation téléphonique avec David Palmer, pour lui prouver ainsi qu'elle n'a rien inventé... Un nouveau représentant du District débarque à la CAT et interfère dans le travail de toute l'équipe...

Alors qu'il aurait bien été utile sur le terrain pour aider à retrouver le suspect caché parmi les otages, Jack est convoqué à la CAT. L'agent Manning et ses hommes prennent le relais et tentent de localiser le complice... Informé de l'état de son épouse, le Président Logan se laisse convaincre par Walt de la nécessité de faire interner Martha... McGill demande à Audrey d'interroger Diane Huxley...

Jack Bauer propose à la CAT de révéler en secret à Mike Novick la trahison de Walt Cummings. Alors que les deux hommes conviennent d'une rencontre, l'appel est intercepté par Cummings... Traquée par le service de sécurité du Président, la Première Dame refuse de se laisser interner. Parviendra-t-elle à trouver de l'aide ?... Pendant ce temps, les tubes de gaz sont placés dans un container, prêts à quitter le pays...

Cummings voit son plan partir en fumée. Impuissant, il ne peut aider Jack à retrouver les neurotoxiques... Le Président demande personnellement à Bauer de les aider à sortir de cette crise... La CAT intercepte un appel entre Erwich et un inconnu qui va l'aider à dévérouiller les tubes de gaz. Il leur faut localiser l'appel et identifier l'interlocuteur. Chloé propose de réintégrer Spencer temporairement pour accélérer les choses...

Erwich a contacté des cellules terroristes dormantes dans le pays pour obtenir de l'aide afin de propager le neurotoxique. Rossler, qui s'apprêtait à lui vendre la puce lui permettrant d'activer les tubes et libérer les gaz, est tué par la jeune fille qu'il retennait prisonnier. Jack décide de se rendre au rendez-vous à la place du défunt... Mike tente de convaincre le Président qu'il préférable de cacher au public les véritables raisons de la mort de Cummings...

La CAT a perdu la seule piste qui pouvait les amener jusqu'aux neurotoxiques. Après avoir subit les foudres du Président, McGill tente de prendre les choses en mains. Il ordonne l'arrestation de Bauer qu'il tient pour responsable de l'échec de la mission. Selon lui, l'ex-agent a désobéi aux ordres et compromis sa couverture, réduisant à néant leurs chances de retrouver les 19 tubes de Sentox... Furieux d'avoir été floué, Bierko prend la direction des opérations. Il veut retrouver Nathanson, le traître...

Bouleversé, le Président Logan apprend que son épouse est dans le convoi qui amène les Suvarov tout droit dans un piège. La Première Dame espère ainsi forcer la main à son mari... A bout, Lynn met la pression sur tout le personnel. Audrey continue d'aider Jack tant bien que mal. Ensemble, ils découvrent que la société Omicron a fabriqué le Sentox pour la Défense. Et l'un des dirigeants de cette entreprise s'avère être un ancien de la CAT, qui a eu quelques problèmes avec la justice...

Tony reprend connaissance. Le médecin préfère lui cacher la mort de son épouse pour éviter d'aggraver son cas... Bierko, furieux de n'avoir pu atteindre les Suvarov, met ses menaces à exécution. Pour cela, il a d'abord besoin de la carte d'accès de Lynn McGill qu'un de ses hommes doit récupérer. Entretemps, il décide de faire diversion avec l'un des tubes... Jack tente de localiser Henderson afin d'arriver jusqu'aux terroristes...

Jack ramène Henderson à la CAT pour l'interroger. La Cellule déploie ses forces pour tenter de localiser le lieu de la prochaine attaque. Le Président Logan, inquiet de la tournure des événements, fait appel aux conseils avisés de son Vice-Président, outrepassant l'avis de Mike... Grâce à la carte d'accès de Lynn McGill, un terroriste parvient à s'infiltrer à la CAT...

La CAT est en état d'alerte. Du sentox a été répandu dans le système d'aération et la majeure partie du personnel a déjà succombé. Pour limiter les dégâts, certaines pièces ont été isolées en attendant l'équipe de décontamination. En état de choc, Chloé n'est pas opérationnelle pour aider ses compagnons. Après tous les événements du jour, assister impuissante à la mort d'Edgar est la goute d'eau qui a fait déborder le vase... Jack veut s'assurer que Henderson, sa seule piste, ait pu rejoindre l'infirmerie à temps... Vu les circonstances, le Président autorise une mesure de restructuration d'urgence pour reprendre le contrôle de la CAT...

Henderson a pu échapper à la CAT. Chloé a heureusement découvert sur son ordinateur un fichier liant une certaine Collette Stenger à Bierko. Celle-ci aurait actuellement une réservation dans un hôtel à Los Angeles. Jack accompagne Curtis sur le terrain... Malgré les efforts de son épouse pour l'en empêcher, le Président déclare publiquement la Loi martiale, imposant à toute la population un couvre-feu dans l'agglomération de Los Angeles... Sous le prétexte d'une évaluation ordonnée par la Maison Blanche, Karen Hayes s'apprête à prendre le contrôle des opérations à la CAT...

Audrey est en état d'arrestation. Elle serait selon Collette Stenger le contact au Ministère de la Défense lui ayant permis d'accéder aux informations que Bierko a l'intention d'utiliser pour sa prochaine attaque. Malgré le scepticisme de Bill et Jack, Karen Hayes, désormais aux commandes de la CAT, tient à ce que l'interrogatoire d'Audrey Raines soit efficace et assez agressif pour la faire passer aux aveux...

L'explosion des réservoirs de gaz naturel a permis de neutraliser le Sentox qui y était mélangé, juste à temps avant son évacuation par le pipeline. De son côté, Jack est parvenu à coincer Bierko. Ce dernier, inconscient, a besoin de soins médicaux. Il est transféré d'urgence à la CAT. Pendant ce temps, Henderson est toujours dans la nature. Bauer est persuadé qu'il travaille pour quelqu'un de très haut placé. Henderson est la priorité de la CAT. Mais l'enquête risque d'être mise à mal par le démantellement de la cellule orchestrée par Karen Hayes et son acolyte Miles Papazian, sous la pression du vice-Président Hal Gardner...

Grâce à l'intervention de Jack et de Wayne, Evelyn a pu récupérer sa fille. Henderson, qui la retenait en otage, en échange de la preuve de l'implication du Président Logan dans les événements du jour, a pris la fuite une fois de plus. Jack met Evelyn en sûreté avant de passer à la banque récupérer la précieuse preuve : un enregistrement d'une communication entre le Président et Henderson, datant du matin même...

Grâce à l'irruption de la police, Bauer a échappé aux hommes de Henderson. Il est enfin en possession de l'enregistrement compromettant le Président des Etats-Unis. Il lui faut maintenant remettre la preuve à quelqu'un de crédible qui pourra la rendre publique. Le Secrétaire de la Défense James Heller s'apprête justement à rejoindre sa fille Audrey... Le Président Logan fait pression sur Karen Hayes pour que Bauer soit localisé au plus vite. Miles décide pour cela de se servir de Chloé à son insu...

Henderson parvient à s'emparer de l'enregistrement. Il laisse Audrey grièvement blessée... Informé, le Président Logan n'a plus de raisons de céder au chantage. Il exige la démission du Secrétaire Heller et le fait expulser de son bureau... Jack tente de joindre Chloé pour localiser Henderson...

Karen voit ses doutes sur l'implication du Président Logan se confirmer. Elle prévient aussitôt Bill et Chloé que Miles a envoyé une équipe pour arrêter la jeune femme. Elle lui demande de fuir et de garder le contact avec elle pour la tenir informer de l'avancement de ses investigations... A l'insu de tous, Jack grimpe à bord du mystérieux vol diplomatique. Il doit retrouver le contact de Henderson, qui est en possession de l'enregistrement compromettant...

A bord du vol diplomatique, Jack détient enfin la preuve incriminant Logan dans l'assassinat du Président Palmer. Il demande la protection de la CAT pour mettre cet enregistrement en lieu sûr. Mais pendant ce temps, Logan met au point un plan pour abattre l'avion avant qu'il ne soit trop tard...

Alors qu'ils s'apprêtaient à entrer en contact avec le procureur général pour lui révéler une preuve accablante sur le Président Logan, Jack et la CAT découvrent que l'enregistrement a été effacé. Pendant ce temps, Bierko est parvenu à s'échapper lors de son transfert. Tout porte à croire qu'il est encore en possession de Sentox et qu'il se prépare à une nouvelle attaque...

Bierko et ses hommes ont pris le contrôle d'un sous-marin russe à l'armement sophistiqué. Ils arment aussitôt les missiles vers 12 cibles stratégiques. L'armée envoie des chasseurs pour anéantir le sous-marin, mais d'après les estimations ils n'arriveront pas à temps pour empêcher les attaques. Sur le terrain avec Henderson, Jack est le seul à pouvoir tenter quelque chose...

Martha est parvenue à gagner du temps pour retenir son époux à ses côtés. Du temps mis à profit par Jack pour prendre la place du copilote dans l'hélicoptère qui doit conduire le Président rendre un dernier hommage à David Palmer. Bauer projette de confronter Logan à la vérité et l'obliger à passer aux aveux...

Le territoire américain est assigié depuis 11 jours par de nombreuses attaques qui ont causé plus 900 morts dans 10 villes différentes. Une nouvelle bombe fait 23 victimes de plus à Los Angeles. Les mililtants islamiques apparaissent comme les premiers suspects, avec en tête un certain Hamri Al-Assad. Wayne Palmer, qui a prêté serment à la Maison Blanche 3 mois auparavant, a négocié à prix fort la libération de Jack Bauer avec le gouvernement chinois. Le Président compte utiliser l'ex-agent de la CAT comme monnaie d'échange contre des informations permettant de localiser le terroriste soupçonné d'être derrière tous ces massacres. De retour au pays après 20 mois de détention, Bauer doit être remis entre les mains d'Abu Fayed. Ce dernier, déterminé à venger la mort de son frère, veut plus que tout voir Jack mort...

A partir des infos fournies par Fayed, la CAT déploie ses forces armées vers leur cible. Entretemps, Jack est parvenu à échapper à Fayed. Il contacte la CAT pour les prévenir qu'ils vont s'en prendre à la mauvaise personne. Guère convaincu, et étant donné la situation de crise, le Président Palmer donne l'autorisation d'éliminer Al-Assad... Ahmed Amar est chargé par Fayed lui-même d'une importante livraison... Sandra, la soeur du Président Palmer, défend ses principes et les droits de son organisation lorsque des agents du FBI viennent réclamer les dossier du personnel. Elle refuse qu'une sorte de profiling ethnique soit effectué...

Fayed contacte le Président Palmer. Il exige la libération de 110 combattants de son pays dans l'heure qui suit en contre-partie d'un cessez-le-feu. Wayne ne croit pas aux bonnes intentions du terroriste mais il est décidé à accéder à sa demande pour gagner du temps... Bauer convainc Hamri Al-Assad qu'ils doivent collaborer avec la CAT pour retrouver la trace de Fayed... Sandra Palmer et Walid sont emmenés dans un camp de détention provisoire où sont retenus d'éventuels suspects...

Avec l'aide d'un complice au sein de la Garde Nationale, Hasan Numair parvient à s'échapper. Spécialiste de l'armement, celui-ci est une pièce maîtresse du plan de Fayed. Le terroriste est en possession d'une arme nucléaire qui, si elle explose en ville, pourrait faire des milliers de morts...

Une bombe nucléaire explose à Valencia, à la périphérie de Los Angeles, faisant des dégâts sur une zone de 1 km². Le pays est en alerte, d'autant plus que la CAT a découvert l'existence de 4 autres bombes. Fayed est furieux car la bombe n'a pas atteint la cible prévue. Et son scientifique est mort sur place. Il lui faut quelqu'un d'urgence avec les détonateurs adéquats pour activer les autres bombes...

Karen découvre que Tom a autorisé une véritable opération paramilitaire dans tout le pays sans le consentement du Président. Des camps de détention ont été créés dans les plus grandes villes pour y séquestrer tout individu sur lequel pèserait des doutes, surtout ceux d'origine musulmane... Jack parvient à faire parler son frère Graham. Leur père serait sur les traces d'un certain Darren McCarthy, engagé par leur société pour désamorcer des bombes. Bombes qui auraient été vendues à Fayed...

Profitant de la démission de Karen Hayes, Tom Lennox tente de convaincre le Président d'accepter son plan destiné à restreindre les libertés civiques afin de multiplier les chances de mettre fin aux agissements de Sayed... Jack est en pleine tragédie familiale. Sa responsabilité dans les événements du jour ayant été découverte, Graham donne l'ordre à ses hommes de se débarrasser de son frère et de son père... McCarthy trouve un profil compétent susceptible d'armer les bombes restantes de Fayed. Reste à convaincre cette personne de coopérer...

Morris tombe dans le piège tendu par McCarthy. Celui-ci compte bien le mener à Fayed qui a besoin de lui pour activer les autres bombes. Avec les moyens de la CAT, Jack tente de retrouver le mari de Chloé... Tom a du mal à encaisser que le Président ait rejeté toutes ses propositions sur les mesures à prendre...

Fayed est parvenu une fois de plus à échapper à la CAT de justesse. Il est désormais en possession, grâce à la collaboration forcée de Morris, d'un dispositif lui permettant de re-programmer les bombes restantes... De son côté, la CAT suit une nouvelle piste. Milo a découvert un lien entre Fayed et Gredenko, un ex-général russe... Le Président Palmer n'adhère pas du tout aux méthodes extrêmes de son équipe. Il préfère pousser Al-Assad à demander le soutien de la popularition musulmane via la télévision...

Jack échappe de justesse au piège qui lui était tendu. La maison indiquée par Marilyn était remplie d'explosifs. Il essaie de retrouver Marilyn et Milo, qui sont poursuivis par les hommes de Phillip Bauer... Tom Lennox fournit à Reed Pollock l'itinéraire du Président pour que soit mis en place son assassinat. Une fois Palmer éliminé, le vice-Président prendra le relais et des mesures radicales pourront être mises en place pour sortir le pays de la crise... Rongé par la culpabilité, Morris a du mal à tenir le coup...

L'ex-général russe Gredenko rassemble les pièces de son plan : il coopère avec Fayed afin de prendre sa revanche sur les Américains tout en rejetant la faute sur les extrêmistes islamistes... Jack suit une nouvelle piste qui pourrait l'amener à Gredenko. L'ex-Président Charles Logan, actuellement en résidence surveillée, prétend avoir les moyens de localiser Gredenko... Chloé prend des risques en couvrant Morris. Mais est-ce vraiment une bonne idée ?...

A la suite d'un attentat à la bombe, le Président Palmer est entre les mains des médecins. Son état enfin stabilisé, Wayne Palmer est toujours inconscient. Le Vice-Président Daniels, partisan d'une action plus agressive contre le terrorisme, est chargé de le remplacer aussitôt. L'absence de Tom Lennox commence sérieusement à inquiéter tout le monde. Reed tente de persuader Lennox de se rallier à leur cause... Jack Bauer conduit Charles Logan jusqu'au consul russe Markov. L'ex-Président est persuadé que celui-ci sait où se trouve Gredenko, l'homme qui a vendu les bombes à Fayed...

Jack Bauer est retenu captif au consulat russe. La CAT organise aussitôt un plan d'assaut pour libérer Jack et vérifier si le consul Markov est bel et bien lié à Gredenko. L'agent Mike Doyle prend la direction des opérations sur le terrain... Charles Logan conduit à la CAT propose de faire appel à Martha pour les aider... Le Vice-Président Daniels compte sur le soutien de Tom Lennox...

L'équipe de Doyle libère Jack du consulat russe. Alerté par l'arrivée imminente des américains, Gredenko presse Fayed de lancer un seul drone sur les trois prévus, pour leur laisser le temps de fuir. La CAT a redirigé les satellites pour suivre le parcours du missile mais ils perdent mystérieusement le contact visuel avec l'engin. Une arme nuclaire survole le sol américain et personne ne peut la localiser. Remonté, le Vice-Président Daniels réunit l'Etat-major pour préparer une contre-attaque militaire...

Jack est parvenu à éviter que le drone atteigne sa cible. Lors de son atterrissage dans une zone industrielle, le choc a provoqué une fuite radioactive qui a contaminée les membre de l'équipe de secours. Une raison suffisante pour le Vice-président Daniels pour ordonner une attaque nucléaire contre le pays de Fayed... La CAT suit une nouvelle piste à l'aide d'une communication interceptée entre Gredenko et un certain Mark Hauser... Doyle détient la preuve que Nadia n'y était pour rien sur la fuite opérée à partir de son poste de travail. Ce rebondissement pourrait bien lui coûter des ennuis. Va-t-il garder le secret sur cette nouvelle information ?

Sorti du coma, Wayne Palmer annule la frappe nucléaire contre le pays de Fayed ordonnée par son Vice-Président. Daniels invoque aussitôt le 25ème amendement, prétextant que le Président n'est pas en état de diriger le pays. Les membres du Cabinet doivent se réunir et statuer sur cet état de fait... Gredenko négocie la livraison de Fayed contre son immunité...

Pendant que Jack tente de faire parler Fayed, Tom et Karen apprennent, décontenancés, que le Président Palmer a autorisé une attaque nucléaire. Ils ne comprennent pas son comportement et tentent par tous les moyens d'empêcher que le missile atteigne sa cible. En vain. Alerté de l'attaque imminente, l'ambassadeur prévient Palmer qu'ils ont une nouvelle piste : le général Mohmar Habib qui aurait aidé Fayed à coordonner les attaques...

Les chinois utilisent Audrey Raines comme monnaie d'échange. Ils font pression sur Bauer pour qu'il leur fournisse un composant de la bombe nucléaire qui contient tous les codes de défenses russes. Si les russes apprennent que les américains ont fourni de telles infos à la Chine, les répercussions seront très graves. Mais Jack n'a pas le choix... En dépit de son état de santé fragile, le Président Palmer lance un ultimatum à Daniels...

Sur ordre de Noah Daniels, la CAT doit empêcher Jack de remettre les informations sur les russes aux chinois. Celui-ci parvient à se débarrasser de Doyle. Il ne veut pas prendre le risque de faire capoter l'opération : les russes pourraient alors s'en prendre à Audrey ! De son côté, Karen Hayes se retrouve dans une position délicate...

A cause de l'intervention de Doyle et de ses hommes, les Chinois parviennent à s'enfuir avec la technologie russe. Jack, menotté, et Audrey, sous le choc, sont conduits à la CAT où Nadia a pris la direction des opérations... Le Vice-Président Daniels est contacté par le Président Suvarov...

Grâce à l'information communiquée par Audrey, la CAT s'apprête à intervenir dans une usine désacfectée qui pourraient bien abriter le quartier général des chinois. Pendant ce temps, les Chinois se préparent pour un assaut... A la Maison Blanche, Tom et Noah utilisent Lisa pour dérouter les russes...

Les hommes de Cheng ont attaqué la CAT pour kidnapper Josh Bauer, leur monnaie d'échange contre le dispositif réparé que leur fournira Phillip Bauer. Le personnel de la CAT est retenu en otage. Jack se prépare à intervenir rapidement pour pouvoir suivre les traces de Josh avant qu'il ne soit trop tard... Lisa Miller a pour mission de duper Mark Bishop, l'espion russe. Mais son comportement pourrait bien susciter des soupçons chez son amant...

Mis au pied du mur par l'ultimatum du Président russe, Daniels donne l'ordre à la CAT de monter une opération afin d'échanger Josh Bauer contre le dispositif. Placé en détention provisoire, Jack a les mains liés. Il sait que l'échange aura lieu pour rien, son père ne donnera pas le dispositif, qui reste un précieux moyen de pression. Il fait appel à Karen pour prendre les mesures nécessaires...

Grièvement blessé au visage, Doyle est tombé dans le piège tendu par Phillip Bauer. Arrivé trop tard sur le lieu de l'échange, Jack pense que son père se cache sur l'une de ses plates-formes pétrolières. Un sous-marin chinois est d'ailleurs en route pour récupérer Phillip et son petit-fils. Les russes, de leur côté, se préparent à ouvrir le feu sur une base militaire américaine en Asie du Sud-Est. Sur les conseils de son Secrétaire à la Défense, Daniels ordonne une attaque aérienne pour s'assurer de la destruction du dispositif avant qu'il ne leur échappe totalement. Mais Jack, refusant que son neveu soit sacrifié, est décidé à intervenir coûte que coûte...

Quelques semaines après la prise de pouvoir d'Allison Taylor. La Cellule Anti-Terroristes de Los Angeles a été démantelée pour violation des Droits de l'Homme. Ses principaux acteurs ont comparu devant une Commission Sénatoriale pour être jugés de leurs actes, et parmi ces membres de la CTU, il y'a Jack Bauer, qui a sillonné le monde ces 4 dernières années. Alors qu'il comparait devant le sénateur Mayer dans un tribunal de Washington DC, il est appelé par le FBI pour venir immédiatement à leurs bureaux. En effet, les transports aériens de la ville sont sous contrôle terroriste, et une des personnes apparemment derrière tout ça est une vieille connaissance de Jack... De son côté, un ingénieur, Michael Latham, est enlevé en pleine rue de DC par ses hommes cagoulés sous les yeux de sa fille adolescente, Emily.

Alors que la tour de contrôle de l'aéroport JFK à Washington demande à parler immédiatement au FBI après qu'ils se soient rendus compte qu'ils avaient perdu le contrôle des communications radios avec un avion, les équipes du FBI déployées autour du building Columbia recherche le sniper qui vient de tuer Gabriel Schecter, cerné dans l'immeuble, et l'ancien président Motobo a un entretien avec la présidente Taylor tandis que le mari de cette dernière va rencontrer Samantha Roth, l'ancienne petite-ami de Roger Taylor, tué il y'a plusieurs mois en s'étant apparemment suicidé.

Tony est ramené au siège du FBI pour interrogatoire alors qu'Alan Tanner, l'homme qui a 'conduit' Renee et Jack au bateau où se trouvait Tony et Masters, a été blessé par balle sur le pont quelques minutes plus tôt et doit être emmené d'urgence à l'hôpital. Alors qu'Henry Taylor est ramené à la Maison-Blanche, il apprend par Ethan Kanin que son fils se serait suicidé à cause d'un blanchissement d'argent, il se serait fait repéré et n'aurait pas supporté de devoir répondre de ça. Henry reste malgré tout suspicieux et ne croit toujours pas au suicide pour une raison de la sorte.

Après leur spectaculaire échappée du siège du FBI, Jack et Tony, accompagnés de Bill Buchanan, se rendent à l'endroit où Bill et Chloé travaillent. Jack demande de sérieuses explications sur certaines questions comme le fait que Tony est vivant et pourquoi ce dernier ne travaille-t-il pas pour Dubaku comme le FBI le croit. De son côté, Henry Taylor se rend à un rendez-vous fixé par Samantha Roth, au sujet du suicide de son fils. Il a désormais la confirmation que ce n'en est pas un et que son meurtre fait partie d'une conspiration, au sein même du Gouvernement, liée aux évenements au Sangala...

Emerson doit livrer l'ex-Préssident Matobo au Colonel Dubaku. Pour Jack et Tony, c'est l'occasion de remonter la piste jusqu'au module. Mais Matobo et son épouse se sont enfermés dans un bunker. L'agent Walker, qui a réussi à faire parler Tanner eu usant de la force, se rend sur les lieux malgré le désaccord de son supérieur...

Bauer et Almeida ont aidé à kidnapper Matobo et son épouse pour remonter jusqu'à Dubaku et au module. Ils ont dû sacrifier en route l'agent Walker, pour rassurer Emerson sur leur entière coopération. Dubaku, de son côté, apprend que la Président Taylor n'a toujours retiré ses troupes. Le temps est venu de faire une démonstration de force...

La Présidence n'ayant toujours pas accédé à sa demande, Dubaku prépare une nouvelle attaque sur le territoire américain. Jack et ses anciens complices de la CAT suivent la trace des Matobo, livrés à Dubaku. Ils espèrent ainsi remonter la filière et arrêter le massacre...

Ignorant que son époux est tombé entre les mains de Dubaku, la Présidente Taylor fait une déclaration publique assurant au peuple américian qu'elle ne cèdera pas aux pressions des terroristes. Jack, Bill, Renée et Matobo se rendent à la Maison-Blanche pour convaincre la Présidente d'unir leurs forces afin de neutraliser Dubaku...

Pris au piège, Dubaku se prépare à quitter le pays. La Présidente Taylor est informée du déroulement des derniers événements. En dépit d'une invasion militaire à gérer et de taupes infiltrées au sein des services secrets, elle décide de prendre le risque de se rendre à l'hôpital au chevet de son époux...

La fuite de Dubaku n´aura pas duré longtemps après qu´il ait décidé d´emmener, malgré tout, sa copine avec lui. Jack et Renée sont à ses trousses. Les taupes au sein du FBI sont démasquées lorsque les talents de décryptage de Chloé sont mis à l´épreuve par Sean, qui tente de sauver sa peau coûte que coûte.

Dubaku ayant échoué dans sa mission, c'est son boss, le général Juma lui-même, qui décide de prendre les choses en main. Ce dernier est à Washington avec une troupe de soldats... De son côté Jack suit la piste de Tony et avec l'aide de Chloé, il se rend à la maison blanche pour interroger le suspect...

Renee Walker sait désormais que la cible est la maison blanche, mais elle est poursuivie par le fils de Dubaku... Elle n'a ni arme, ni téléphone. L'opération de Jack est un échec, ce dernier est en état d'arrestation. Les terroristes s'infiltrent dans la maison blanche... Renee parvient finalement à prévenir le FBI qui alerte immédiatement les services secrets...

La vie de sa fille étant menacée, la Présidente Taylor se rend entre les mains de Juma. Celui-ci veut l'obliger à faire une déclaration publique rendant responsables les Etats-Unis d'actes criminels au Sangala...

Jack est poursuivi par le FBI, il se rend avec l'aide de Renée chez le sénateur Mayer pour essayer de trouver qui a aidé Juma. Ce qui va entraîner l'arrestation de Renée et un sort dramatique pour le Sénateur.

Jack, avec l'aide de Tony tente de trouver l'arme biologique alors qu'il est toujours traqué par toutes les agences fédérales. Mais de nouveaux éléments vont aider Larry à croire de plus en plus en l'innocence de Jack. Pendant ce temps, Ethan Kanin remets sa démission au Président Taylor...

Tony est aidé par Greg Seaton,le bras droit de Hodges, contre son immunité présidentielle il va indiquer l'endroit où sont cachées les armes biologiques. Jack a bel et bien été infecté . A la maison blanche Olivia Taylor remplace provisoirement Ethan Kanin.

Alors que Jack est avec Renée au FBI aidant Tony à s'infiltrer dans les locaux de l'ennemi. A la Maison Blanche, la riposte se met en place avec L'agent Moss, tandis qu'Olivia s'éclipse en pleine crise...

Jack arrive à convaincre la Présidente qu'il faut faire exploser la base de Starkwood, Tony resté sur les lieux va réussir à détruire le site. Mais un homme va réussir à s'échapper avec une capsule contenant l'agent pathogène. Pendant ce temps là, Kim Bauer arrive au siège du FBI...

La santé de Jack se dégrade toujours, Mais il va s'entêter à repartir sur le terrain contre l'avis de Renee pour découvrir qui est responsable des derniers évènements qui a refroidi le FBI et la maisn Blanche...

Jonas Hodges est en soins intensifs et survéillé au FBI. JAck va avoir l'autorisation de la Présidente de l'interroger et passer un marché. Tony Almeida Tente de Convaincre ses employeurs qu'il faut mettre en place une nouvelle attaque sans plus attendre.

Jack révèle à Chloé qu'il est condamné, Malgré le peu de temps qu'il lui reste il préfère s'acharner à retrouver Tony, Renee va lui laisser le commandement des opérations. Pendant ce temps à la Maison Blanche Olivia commandite l'assassinat de Jonas Hodges...

Tony finalise les derniers détails de l'attentat dans la métro, Kim est à l'aéroport attendant son avion, mais elle se sent surveillée, Janis et Cloé vont parvenir à localiser Tony malgré la tension montante entre elles, Jack finira par réussir à contacter Jibraan dans le métro...

Jack n'a pas d'autres choix que d'aider Tony à s'échapper mais il informe tout de même Renee des raisons de sa trahison. Lui et Tony échappent au FBI et Jack est prit en otage : comme il a été infecté par l'arme biologique, l'agent pathogène peut être recréé à partir de lui. A l'aéroport, Kim commence à douter du couple avec qui elle a fait connaissance. Renee parvient à la contacter pour la mettre en garde. Ethan Kanin récupère l'enregistrement audio prouvant la participation d'Olivia dans la mort de Jonas Hodges. Olivia essaie de détruire l'enregistrement mais Ethan réussi à l'échanger contre une copie vierge. De retour à l'aéroport, les agents du FBI sont sur le point de sauver Kim et d'arrêter les complices de Tony. L'homme parvient à s'échapper mais est poursuivit par Kim qui transmet sa position au FBI et sauve l'ordinateur portable qu'il a utilisé pour la surveiller. Chloé, Kim et Renee se servent de l'ordinateur pour localiser Cara Bowden. Tony continu de négocier sa monté en grade avec l'un des principaux conspirateurs en révélant son plan pour lancer une nouvelle attaque biologique. Willson accepte avec réticence une rencontre face à face avec Tony. Jack parvient à échapper au médecin qui essai d'extraire l'agent pathogène de son corps.

Afin de localiser Jack, Chloé essaie de remonter à la source des communications reçues par l'ordinateur portable du complice de Tony. Pendant ce temps, Jack se cache dans un garage et tente de s'échapper, ou à défaut, de s'immoler pour empêcher Tony d'utiliser son corps pour recréer l'agent pathogène. Tony parvient à recapturer Jack. A la Maison Blanche, Ethan révèle à Olivia qu'elle n'a pas détruit le vrai enregistrement audio. Supporté par l'agent Pierce, Ethan donne la possibilité à Olivia d'avouer la vérité à sa mère. Alan Wilson, le mystérieux instigateur du complot et responsable de la mort de Michelle Dessler, accepte de rencontrer Tony. Tony révèle à Jack que son plan a toujours été de venger la mort de sa femme. Alors que Wilson arrive sur les lieux du rendez-vous, le FBI envahit le complexe. Cara et Wilson parviennent à s'échapper mais Tony les rattrape. Il tue Cara mais l'arrivé de Jack et Renee l'empêche d'exécuter Wilson. Wilson est placé en garde à vue mais nie toute participation au complot. A la Maison Blanche, Olivia se confesse à ses parents. En tant que présidente des États-Unis, la Présidente Taylor décide qu'elle ne peut pas dissimuler les actions de sa fille. L'état de santé de Jack se détériore rapidement mais il accepte son sort. Cependant, Kim n'est pas prête à laisser son père mourir et se soumet à la procédure du traitement par cellule-souche.