Un Boeing 747 en provenance de Berlin explose en plein vol. Les membres de la CAT s'activent pour mettre la main sur la liste des passagers. Jack soupçonne l'un d'entre eux d'être le tueur commandité pour éliminer le sénateur Palmer. Pendant ce temps, Teri est toujours à la recherche de Kim, prisonnière en compagnie de son amie Janet de deux jeunes délinquants à la solde d'un mystérieux personnage...

Richard Walsh est assassiné sous les yeux d'un Jack impuissant. De retour à l'agence, ce dernier charge Jamey, l'informaticienne, d'enquêter sur la carte magnétique que lui a donnée son patron avant de mourir. Il soupçonne Nina d'être la taupe de la CAT. Or elle nie énergiquement. De son côté, Teri a reçu un appel peu rassurant de Kim. Toujours retenue prisonnière, celle-ci prend soin de Janet, blessée au bras par Dan, l'un des ravisseurs. Pendant ce temps, la famille Palmer est informée des menaces qui planent sur la vie du sénateur. Mais le politicien a d'autres chats à fouetter : les journalistes sont sur le point de ressortir une vieille affaire concernant ses enfants...

Heurtée par une voiture, Janet est abandonnée par ses ravisseurs qui ramènent Kim dans leur camionnette. A l'agence, Jamey, Nina et Jack travaillent de concert pour démasquer le traître. De plus en plus méfiant, Tony confie ses soupçons à Mason. En compagnie de ses acolytes, ce dernier fait irruption au sein de la Cellule antiterroriste et la place en quarantaine. Heureusement, Jack parvient à s'enfuir et fonce à l'adresse trouvée par Jamey, une usine désaffectée. Là, il est pris pour cible par un tireur isolé. De retour chez lui, le sénateur Palmer cherche à savoir qui accuse son fils de meurtre...

George Mason enlève Jack avant que ce dernier puisse interroger le tueur. Lequel a tout de même eu le temps de lui confesser qu'il doit se rendre dans une cabine téléphonique du nord de Hollywood et y attendre un coup de fil d'Ira Gaines. Décidé coûte que coûte à poursuivre son enquête, Jack échappe à la vigilance de ses ravisseurs et rejoint Ira Gaines qui lui ordonne de se débarrasser d'un corps placé dans une voiture. Maureen, elle, confirme à Keith que le violeur s'est bien débattu avant de succomber. Teri appelle Jack pour lui dire que Janet a été victime d'un accident.

Les hommes de la CAT ont finalement identifié le cadavre mutilé découvert dans le coffre d'une voiture. Il s'agit d'Alan York, le père de Janet. Nina voudrait prévenir immédiatement Jack mais ne parvient pas à le joindre. Elle se résout à appeler Teri laquelle se trouve en compagnie du faux Alan. Pendant ce temps, les tensions s'exacerbent entre David Palmer et Keith. Le sénateur annonce à son fils qu'il va révéler publiquement ce qu'il sait du meurtre de Gibson. De son côté, Kim tente de convaincre Rick de l'aider à échapper aux griffes d'Ira Gaines. Ce dernier oblige Jack à se rendre à la C.A.T afin de dérober la carte magnétique capable de l'identifier...

Les électeurs sont appelés aux urnes. Tous les sondages donnent Palmer largement vainqueur. David doit s'exprimer ce matin devant les syndicats d'une centrale électrique, à San Clarita. Contre l'avis de sa femme et de son fils, il réécrit son discours... Les hommes de Gaines font Teri prisonnière et la ramènent à leur repaire où se trouve déjà Kim. Les deux femmes tombent dans les bras l'une de l'autre... Toujours sous contrôle, Jack est contraint de tirer sur Nina avant de se rendre à la centrale où il doit remettre une mallette au tueur. Pendant ce temps, Tony, inquiet pour sa partenaire, finit par découvrir le nom de la taupe qui se cache au sein de la Cellule Anti-Terroriste...

L'attentat contre Palmer échoue grâce à l'intervention désespérée de Jack. Ce dernier est arrêté par les services secrets, lesquels s'empressent également de mettre le sénateur à l'abri. De leur côté, Nina et Tony s'attèlent à convaincre la taupe de la C.A.T. de coopérer et de calmer un Ira Gaines à bout de nerf. Pendant ce temps, Jack ne parvient pas à faire preuve de sa bonne foi auprès du chef de la sécurité. A bout d'arguments, il finit par s'échapper, menottes aux poignets, prend une serveuse en otage, et l'oblige à le conduire dans un coin reculé de la ville. Ramené à son QG de campagne, David est toujours préoccupé par les révélations qu'il n'a pu faire...

La C.A.T est sur la piste d'un second tueur arrivé tout droit de Belgrade. Saine et sauve, la famille Bauer est héliporté jusqu'à l'agence. Pendant que Teri et Kim sont conduites à l'hôpital pour subir des examens médicaux, Jack est assigné à résidence et remis entre les mains du FBI par Alberta. L'agent a juste le temps de demander à Nina de veiller sur sa famille. De son côté, David annonce à sa femme qu'il est victime d'un chantage de la part des financiers de sa campagne. S'il parle du meurtre de Ferragamo, leur fils Keith sera accusé... Teri confie à une infirmière qu'elle a été victime d'un viol...

Robert Elliot meurt assassiné alors qu'il était en ligne avec Jack. Ce dernier est en train de prévenir les autorités de La Nouvelle-Orléans lorsque Milo débarque dans son bureau avec les photos de trois terroristes potentiels. Parmi elles figurent celle d'Alexis Drazen, fils de l'homme tué par Jack deux ans plus tôt au Kosovo. Bauer envoie les négatifs à l'équipe de Palmer. Elizabeth reconnaît immédiatement son amant et se dit prête à collaborer avec la C.A.T. Pendant ce temps, Nina poursuit son interrogatoire auprès de Kim et de Teri. Mais cette dernière, qui a découvert les véritables liens unissant Jack à sa collègue, se montre très irritable...

Kim est à la recherche de sa mère. Choquée, celle-ci a perdu la mémoire et erre sur les routes. Elle est prise en stop par une jeune femme compatissante qui propose de la conduire à l'hôpital. Pendant ce temps, Nina et Jack escortent Elizabeth Nash à l'hôtel où le jeune femme doit retrouver Alexis Drazen. Tout est prêt pour que le piège se referme sur le terroriste. Pourtant, le sénateur Palmer se montre très inquiet, réticent à l'idée de mettre la vie de sa collaboratrice en danger. De retour en ville, Kim prévient la C.A.T. de la disparition de sa mère. Mais Mason refuse d'avertir Jack...

Gravement blessé, Alexis est conduit à l'hôpital pendant que les agents de la Cellule Anti-Terroriste fouillent sa chambre de fond en comble. Nina met le main sur deux titres au porteur... Jack se rend au rendez-vous en se faisant passer pour Drazen. De son côté, Kim retrouve Rick. Ensemble, ils cherchent un indice leur permettant de retrouver Teri. Cette dernière est prise en charge par le docteur Phil Parslow, l'un de ses amis chirurgien. Quant à Jack, il ne sait pas encore que sa femme a disparu... David Palmer n'a toujours pas renoncé à faire éclater la vérité au grand jour. Il envisage de donner la cassette compromettante à la police. Mais Sherry et son directeur de campagne tentent de l'en dissuader...

Toujours amnésique, Teri, accompagnée de Phil Parslow, est de retour chez elle où l'attend un homme de Drazen, prêt à tirer. Mais en franchissant la porte d'entrée, la jeune femme déclenche l'alarme, provocant l'arrivée immédiate de la police... L'opération menée par Jack a mal tourné : le suspect est mort, tué par l'un de ses collègues. Escorté par Mason, Bauer se rend à Saugus, lieu où la victime devait couper l'alimentation électrique. Pendant ce temps, Kim et Rick peinent à calmer l'impatience du frère de Dan, de plus en plus soupçonneux. Rick finit par lui révéler la vérité. Chez les Palmer, l'ambiance est des plus tendues : David a convoqué la presse bien décidé à tout avouer au sujet du meurtre de Ferragamo...

Le président David Palmer interrompt ses vacances lorsqu'il apprend que des terroristes vont faire exploser une bombe atomique quelque part dans Los Angeles aujourd'hui même. Sur ces entrefaites, la NSA demande la réintégration de Jack Bauer à la CAT. Mais ce dernier est davantage préoccupé par sa relation tendue avec sa fille avec qui il tente de rétablir le contact. Kim travaille en tant que jeune fille au pair pour la famille Matheson...