In de hoop het bio-wapen te vinden, betrekt Jack, die inmiddels besmet is met virus, de FBI bij een inval op het terrein van Starkwood. Het terrein blijkt verlaten en al snel worden ze omsingeld door vijandige medewerkers van Starkwood.

Hoewel Tony erin slaagt om de raketten en bio-granaten te vernietigen, weet een medewerker van Starkwood met een intacte granaat van het terrein te ontsnappen. Moss wordt gedood tijdens het vuurgevecht dat hierop volgt. Renee roept ondertussen de hulp in van Kim Bauer om een kuur voor Jack te vinden.

De jacht op Galvez, de medewerker van Starkwood die Moss heeft vermoord en een granaat van het bio-wapen heeft gestolen, wordt voortgezet. De FBI tast nog steeds in het duister omtrent Tony's ware bedoelingen. Zo ook Jack, die Galvez helpt te ontkomen.

President Taylor wordt gedwongen om te onderhandelen met een terrorist, een man die ook verantwoordelijk is voor de dood van haar zoon, om Tony en het laatste biowapen te vinden. Tony wil het bio-wapen nu gebruiken voor een aanslag op Amerikaans grondgebied.