Terwijl Jack worstelt met zijn persoonlijke problemen, dreigt een groep terroristen een dodelijk virus los te laten tenzij hun leider wordt vrijgelaten uit de gevangenis.

Jack komt achter de relatie tussen Kim en Chase en gaat samen met Chase op zoek naar informatie over de contacten van Goss. Wayne ontdekt een geheim over Anne.

Jack vindt Kyle's zak met het verdachte witte poeder. Palmer komt meer te weten over de beschuldigingen aan het adres van Anne en Chase raakt geïrriteerd als hij door Jack buiten het onderzoek wordt gehouden.

Wanneer CTU Kyle's spoor kwijtraakt en Palmer geconfronteerd wordt met de keuze toe te geven aan de terroristen of een catastrofale virusuitbraak te riskeren, stelt Jack een riskante derde optie voor.

Tijdens hun ontsnappingspoging uit de gevangenis worden Jack en Salazar gegijzeld door de andere gevangenen. CTU komt steeds dichterbij Kyle. Kim en Chloe komen achter Jacks drugsgebruik.

Nadat Kyle gevangen genomen is, proberen de CTU agenten Jack te weerhouden te ontsnappen met Ramon Salazar.

Terwijl Jack Ramon probeert te weerhouden hem te vermoorden, komt CTU erachter dat Gael samenwerkt met de Salazars, en gaat Chase op eigen houtje op zoek naar Jack.

Tony legt uit hoe hij en Gael Jack hebben geholpen opnieuw te infiltreren bij de Salazars. Jack probeert een ontmoeting op te zetten tussen de Salazars en de verkopers van het virus.