Ein Reh hat sich in den Garten der Browns gewagt. Die Familie hofft, dass das gar nicht so scheue Wildtier bald in den Wald zurückkehrt, doch es scheint so, als habe es den Brownschen Garten als seine neue Heimat auserkoren. So machen sich Ephram und sein Vater auf den Weg in die Wildnis, um das anhängliche Reh an einen sicheren Ort zu bringen.Eine unangenehme Aufgabe steht Ephram kurz darauf bevor: Er muss Amy gestehen, dass er seinen Vater nie gefragt hat, ob er ihren Freund Colin operiert. Delia hat unterdessen ganz andere Probleme: Sie ist sich plötzlich nicht mehr sicher, ob es einen Gott gibt oder nicht.

Delia und ihre Großmutter Ruth geben eine festliche Geburtstagsparty für die mürrische Edna, die Geburtstage hasst. Sie muss sich jedoch auf eine lange Nacht einstellen, da plötzlich ein heftiger Schneesturm ausbricht und nun alle Gäste im Haus gefangen sind. Ausgerechnet jetzt erleidet Bright einen Blinddarmdurchbruch, und Dr. Abbott und Dr. Brown sind dazu gezwungen, ihn ohne professionelle Ausrüstung zu operieren. Die angespannte Situation führt zudem zu der längst fälligen Aussprache zwischen Ephram und Andy, in der all die seit Monaten aufgestauten Gefühle ans Tageslicht kommen – und Ephram seinem Vater droht, zu seinen Großeltern nach New York zu ziehen.

Trotz Amys Protesten hat Ephram Colins Einladung zum Ski-Ausflug der Kirchengemeinde angenommen. Während Amy und Colin sich dabei erstmals wieder näher kommen, macht Ephram die Bekanntschaft von Colins jüngerer Schwester Laynie, die gerade aus dem Internat heimgekehrt ist. Und auch Bright ist mit Liebesdingen beschäftigt: Er hofft, dass seine Beziehung zu Gemma endlich ein neues Stadium erreicht. Zu Hause in Everwood bringt sich Dr. Brown unterdessen selbst in eine unangenehme Situation: Er verspricht dem geschiedenen Reverend Thomas Keyes, mit ihm eine Single-Party zu besuchen.

Ein Journalist kommt nach Everwood, um Andy zu interviewen und herauszufinden, warum der einst so berühmte Neurochirurg nun eine Landarztpraxis tief in den verschneiten Rocky Mountains führt. Dabei kommt die Sprache auch auf Colin, und trotz Andys Einwänden konzentriert sich der Journalist fortan auf dessen wundersame Genesung. Unterdessen rastet Colin in der Schule ein weiteres Mal aus und demoliert die Einrichtung eines Lehrerbüros, während Delia beschließt, die Nacht in einem Museum zu verbringen. Andy ist außer sich vor Sorge, als er ihr Verschwinden bemerkt.

Im Vorfeld von Colins Gehirnoperation reist Dr. Brown mit seinen Kindern nach New York, um sich mit seinem Mentor Dr. Donald Douglas zu treffen und zu beraten. Als Dr. Douglas jedoch erfährt, dass Colin nur durch eine völlig neue Methode zu retten wäre, rät er seinem ehemaligen Schüler dringend von der Operation ab. Zu Hause in Everwood „kidnappt“ Colin seine Freundin Amy und ihren Bruder Bright, um am letzten Tag vor seiner geplanten Operation für ein unvergessliches Erlebnis zu sorgen. Nach einem schönen Tag verabschieden sich die Freunde in der Hoffnung, sich bald wiederzusehen. Bei der Operation kommt es jedoch zu ernsthaften Komplikationen.

Andy befürchtet, dass Ephram sich nicht genug für seine College-Zulassung anstrengt. Ephram hat jedoch ohnehin andere Pläne: Er will an der renommierten Juilliard School Musik studieren und konzentriert sich voll und ganz auf sein Vorstellungsgespräch. Das Urteil der Juilliard-Jury ist allerdings niederschmetternd, und Ephram bleibt nichts anderes übrig, als seinen großen Traum zu begraben. Auch bei den Abbott-Kindern gibt es Probleme mit den College-Zulassungen: Aufgrund seiner schlechten Noten fliegt Bright aus dem Football-Team. Ein College-Zugang über den Sport wäre aber seine einzige Chance gewesen, da er schon immer ein schlechter Schüler gewesen ist. Vollkommen egal scheint das College dagegen seiner Schwester Amy zu sein. Sie interessiert sich seit Colins Tod weder für die Schule noch für ihre Zukunft.

Eine Kohlemine ist eingestürzt. Sofort eilen Andy, Linda und Harold zur Unfallstelle, um die Verschütteten zu retten. Einer der verschütteten Arbeiter ist Will Cleveland, ein ehemaliger Jazz-Pianist, der seit kurzem Ephrams Mentor ist. Ebenfalls in der Mine gefangen sind Andys Patientin Ellie Beels und Harolds Nachbar Daniel Sullivan, der wegen seiner grauenvollen Bauvorhaben immer wieder in Streit mit dem Arzt gerät. Alle drei Ärzte geben ihr Bestes, um die Überlebenden unter schlechtesten Bedingungen optimal zu versorgen, doch es ist schließlich Andy, der sich seinen schlimmsten Ängsten stellen muss, um ein Leben retten zu können.

Das Verhältnis zwischen Amy und dem Rest ihrer Familie ist noch immer höchst angespannt. Als Tommy bei einer Sportveranstaltung ihren Bruder Bright anspricht, um die Sache aus der Welt zu schaffen, kann dieser sich nicht beherrschen und schlägt zu. Damit brockt er sich jedoch nicht nur eine Suspendierung von Unterricht ein, sondern gefährdet auch seine Uni-Zulassung. Während Andy sich nach wie vor scheut, seine Gefühle für Linda offen auszuleben, wird die Bindung zwischen Ephram und Madison immer enger. Da Madison sich aber noch immer nicht mit ihm in der Öffentlichkeit sehen lassen will, kommt es schon bald zum Streit. Unterdessen bekommt Dr. Brown es mit dem 15-jährigen Gavin zu tun: Um sein Kampfgewicht als Ringer zu erreichen, ist der Junge zum Bulimiker geworden. Dr. Browns Warnungen verhallen jedoch ungehört.

Nachdem Delia sie bei der Einnahme ihres täglichen Pillencocktails beobachtet hat, erzählt Linda ihr im Vertrauen von ihrer HIV-Infektion. Delia erzählt es jedoch Brittany, die es wiederum ihren Eltern berichtet. So dauert es nicht lange, bis die ganze Stadt über Lindas Krankheit bescheid weiß. Die Konsequenzen sind verheerend: Die Bürger von Everwood drohen den Abbotts mit einer Klage wegen Zufügung von seelischem Leid, wenn Linda die Praxis nicht sofort verlässt. Obwohl Harold sich kämpferisch zeigt, beschließt Linda schon bald von sich aus, die Praxis zu verlassen. Der nächste schwere Schritt steht Linda jedoch noch bevor: Sie muss die Kinder einweihen. Während Bright und Amy ehrlich betroffen sind, zeigt Ephram keinerlei Verständnis. Er bezichtigt seinen Vater sogar der Verantwortungslosigkeit gegenüber ihm und Delia. Andy ist daraufhin total verunsichert und beendet die Beziehung mit Linda.

Für Ephram erfüllt sich ein Traum: Er darf am Sommerseminar der Juilliard School in New York teilnehmen und wird dort von den besten Pianisten der Welt unterrichtet. Einen Wehrmutstropfen hat dieser Erfolg jedoch, denn er muss Amy zurücklassen, mit der er gerade eine Beziehung begonnen hat. Da seine Praxis nach wie vor geschlossen ist, versucht sich Harold mit einem Bagel-Shop. Die Sache endet jedoch in einem Desaster, da niemand in Everwood Bagels kaufen will. Verzweifelt springt Harold daraufhin über seinen Schatten und bietet seinem Erzfeind Andy an, Teilhaber an seiner Praxis zu werden. Während Amy überraschenderweise mit Ephram im Flugzeug nach New York sitzt, taucht Madison in Andys Praxis auf. Sie ist schwanger, und zwar von Ephram. Andy beschließt, seinem Sohn nichts davon zu sagen und bietet Madison als „Schweigegeld“ finanzielle Unterstützung an.

Ephram hat sich von Dr. Hartman auf Geschlechtskrankheiten untersuchen lassen. Dieser gibt Andy nun durch die Blume Hinweise, woraufhin Andy sofort in Panik gerät, Ephram könne auch Amy schwängern. Kurzerhand sucht er Hilfe bei Dr. Abbott, der nun um jeden Preis zu verhindern versucht, dass seine Tochter mit Ephram schläft. Der Ärger ist vorprogrammiert. Während Nina endlich einen Schritt auf Andy zugeht, nimmt auch Hannah all ihren Mut zusammen und besucht Bright im Restaurant. Überraschenderweise lädt er sie daraufhin sogar ins Kino ein, doch als sie ihn zum Abschied küssen will, erlebt sie eine herbe Enttäuschung: Bright sagt ihr, er sei nur mit ihr ausgegangen, weil sie ihn so angehimmelt habe.

Bright hat während der Arbeit so heftig mit einer Kollegin geflirtet, dass man ihn gefeuert hat. Zu Hause erzählt er jedoch, er habe gekündigt, um sich nach Aufgaben umzusehen, die ihn mehr fordern. Harold und Rose sind überglücklich und setzen alle Hebel in Bewegung, um ihm einen neuen Job zu besorgen. Dann erfährt Harold jedoch, dass Bright sie belogen hat. Ein Familienkrach ist unausweichlich. Andy will Amandas Mann John helfen und verabreicht ihm ein neues Medikament, das in Verbindung mit Musiktherapie emotionale Reaktionen hervorrufen könnte. Er fährt mit Amanda und John in die Berge, wo die beiden sich verlobt hatten. Die Therapie scheint Erfolg zu haben: Während Amanda davon erzählt, wie einsam sie sich fühlt, beginnt John zu weinen. Amanda ist außer sich, doch Andy erkennt schon bald, dass die Träne nur eine Reaktion auf den kalten Wind in den Bergen war.

Nachdem Harold seine Tochter Amy von Madisons Schwangerschaft in Kenntnis setzen musste, will Andy endlich auch Ephram reinen Wein einschenken. Er befürchtet jedoch, Ephram könne deshalb die Aufnahmeprüfung an der Juilliard School verhauen und rückt weiterhin nicht mit der Sprache raus. Abgesehen von dieser Kleinigkeit fühlt Andy sich in New York, wohin er seinen Sohn begleitet hat, pudelwohl: Er lebt sichtbar auf und lässt sogar seinen Kummer wegen Amanda hinter sich. Dann kommt es jedoch zu einer überraschenden Begegnung mit Madison, die Ephram unbedingt die Wahrheit sagen will. Im Fitnesscenter erfährt Harold unterdessen, dass Irv bei Edna ausgezogen ist. Weil er ganz genau weiß, dass seine Mutter zu halsstarrig ist, um sich auf ein Gespräch mit Irv einzulassen, setzt er seine Frau Rose auf Edna an. Kurzerhand lädt diese ihre Schwiegermutter daraufhin zum Abendessen ein, ohne zu ahnen, dass Harold bereits Irv eingeladen hat. Nun ist der Ärger vorprogrammiert – zumal Irv in Begleitung einer fremden Frau zum Essen erscheint.

Gegen Harolds Widerstand übernimmt Andy die Operation von Rose. Darüber ist Harold so erbost, dass er Andy auf das Übelste beschimpft und ihm vorwirft, sein Leben in Everwood sei eine einzige Lüge. Nach gelungener Operation wird Harold jedoch klar, dass er sich bei Andy entschuldigen muss. Der ist mittlerweile allerdings zu dem Schluss gekommen, dass Harold mit seinen Anschuldigungen Recht hat und zieht deshalb ernsthaft in Erwägung, ein Angebot aus Chicago anzunehmen. Während Bright der schüchternen Hannah endlich seine Gefühle gesteht, erkennt Harold, wie wichtig ihm die Freundschaft mit Andy geworden ist. Um ihn zum Bleiben zu bewegen, organisiert er in der Praxis ein Zusammentreffen zwischen Andy und all seinen Patienten, die ihn ebenfalls daran hindern wollen, die Stadt zu verlassen. Doch erst als Rose einschreitet, kommt Andy wieder zur Vernunft. Plötzlich wird ihm nicht nur klar, dass er in Everwood ein Zuhause und viele Freunde gefunden hat, sondern auch, dass seine Nachbarin Nina die Richtige für ihn ist. Er nimmt all seinen Mut zusammen und geht zu Nina, wo Jake sich gerade häuslich eingerichtet hat.