Conan lebt allein mit seinem Großvater auf der Insel der Überbleibsel, bis ein junges Mädchen namens Lana an die Küste gespült wird. Zwei Soldaten aus Industria landen mit ihrem Wasserflugzeug vor der Insel und entführen Lana. Conans Großvater bedroht die Eindringlinge mit einer Rakete und wird schwer verletzt, als einer der Soldaten das Feuer eröffnet und die Rakete trifft.

Nachdem Lana von den beiden Soldaten entführt wurde, gelingt es Conan nicht, sie zu retten. Conans Großvater stirbt an seinen Verletzungen. Nachdem er seinen Großvater begraben hat, baut Conan ein Boot und macht sich auf den Weg, um Lana zu retten.

Conan erreicht eine Insel, auf der ein Junge namens Jimsy lebt. Nach anfänglichen Streitereien entwickeln die beiden eine Freundschaft. Die Barracuda kommt auf die gleiche Insel und fordert die Bewohner auf, Plastik einzusammeln. Als Conan herausfindet, dass die Barracuda aus Industria stammt, planen er und Jimsy sich als blinde Passagiere an Bord des Schiffes zu verstecken.

Jimsy und Conan schleichen sich auf das Schiff, aber Jimsy betrinkt sich und macht den Kapitän auf ihre Anwesenheit aufmerksam. Nachdem die Jungen gefangen wurden, lässt Kapitän Dyce die beiden mitfahren, insofern sie eine Strafe auf sich nehmen. Jimsy wird ohnmächtig und Conan muss die Strafe für beide einstecken.

In Industira angekommen, wird Conan in die Arrestzelle geworfen, nachdem er Monsley angegriffen hat. Lepka, der Verwaltungschef des Hohen Komitees von Industria, versucht Lana mit allen Mitteln dazu zu bringen, ihm zu sagen, wo ihr Großvater ist. Derweil beschließt Monsley Conan unter ihre Fittiche zu nehmen. Conan schafft es jedoch zu entkommen und Lana nach einigen Schwierigkeiten zu befreien.

Auf ihrer Flucht stoßen Conan und Lana auf ein Flugzeug aus der Zeit des großen Krieges, das Lepka für seine Pläne zur Welteroberung mit Dr. Laos Solarenergie antreiben will. Sie werden gefangen genommen und Lepka droht nun damit Conan zu verletzen, wenn Lana ihm nicht sagt, wo ihr Großvater ist.

Dyce gelingt die Flucht. Lepka erhält die Erlaubnis, das Gunboat und die Falco zu benutzen, um Dyce zu verfolgen. Conan entkommt aus dem Gefängnis und schleicht sich auf die Falco. Dyce geht mit Lana ins Gespräch. Als sie wütend wird, weil er Conan zurückgelassen hat, droht er sie aus dem Fenster zu werfen. Monsley gelingt es, das Schiff ausfindig zu machen.

Lana entkommt und rettet Conan mit einem Rettungsboot. Das Gunboat entert die Barracuda und nimmt Dyce und seine Crew gefangen. Lana und Conan gelingt es zu entkommen. Beim Versuch ans Ufer zu gelangen, wird ihr Boot gesprengt aber Conan und Lana überleben und schaffen es zu einer nahegelegenen Insel, wo sie ein altes Schlachtfeld voller Panzer entdecken. Lana empfängt eine Nachricht …

Nachdem sie die Wüste durchquert haben, werden Lana und Conan von einem Mann namens Patch entdeckt, der auf einer Bergungsplattform von Industria arbeitet. Nachdem Conan Patch seine Tauchfähigkeiten unter Beweis gestellt hat, machen er und Lana sich mit an die Arbeit. Terit, der sich in Industria eine höhere Stufe der Staatsbürgerschaft wünscht, versucht, sie zu identifizieren.

Terit kehrt nach Industria zurück und erhält ein Funkgerät, um Lepka zu informieren, wenn Lana ihren Großvater trifft. Doch ein Erdbeben erschüttert die einsame Insel; Patch wird bei einem Tauchgang eingeklemmt und von Conan gerettet. Als sich herausstellt, dass es sich bei Patch um Dr. Lao handelt, informiert Terit Industria umgehend über seine Anwesenheit. Ein erneutes Beben beginnt …

Nachdem sich die Lage beruhigt hat, kehren Lao, Lana und Conan zur Insel zurück, um die Flugmaschine des Doktors zu bergen. Die Maschine bedarf einiger Reparaturarbeiten, wofür sie sich nach Industria begeben müssen. Auf dem Weg dorthin, finden und retten sie Dyce in der Wüste, aber werden kurz darauf von der Falco überrascht. Nach der Ankunft machen sich Conan und Dyce auf den Weg …

Lana und Lao steigen zum Kernblock des Dreiecksturms hinab, um den Chip zu besorgen, den sie zur Reparatur benötigen. Während Dyce und seine Crew – abgesehen von Jimsy, der sich weigert, Conan im Stich zu lassen – abwandern, befreit Conan einige Gefangene, die gegen Lepka rebelliert haben. Luke führt Conan und Jimsy zum Kernblock. Auch Lepka und seine Soldaten treffen dort ein.

Lao setzt die Kinder auf der Barracuda ab und kehrt nach Industria zurück, um die Bürger vor der drohenden Katastrophe zu schützen. Die Barracuda fährt weiter nach High Harbor, wo die Anwohner dem Schiff zunächst feindselig begegnen, bis Lana erklären kann, dass sich die Besatzung nun auf ihre Seite gestellt hat. Die Crew muss ihr beschädigtes Schiff verlassen. Lana trifft dabei auf Orlo.

Conan, Jimsy und Lana begeben sich ins Windmühlendorf. Nach einer kurzen Führung beschließen Conan und Jimsy, mit Angeln und Jagen ihren Teil beizutragen. Beim Angeln lernt Conan Gull kennen und beginnt für ihn zu arbeiten.

Als sie den Berg erreichen, werden Conan und Jimsy von Orlos Anarchisten-Bande gefangen genommen. Orlo will über den Vorfall hinwegsehen, wenn sie beweisen können, dass sie das Schwein wirklich zur Strecke gebracht haben und in seinem Beisein ein weiteres erlegen. Mit Grips und Teamarbeit gelingt es den beiden.

Lana hat nachts eine Vision über einen Angriff der Industrianer auf High Harbor. Eine Nachricht, die sie sicher von ihrem Großvater bekommen hat. Um sie zu beruhigen, nimmt Conan sie mit in Titos Dorf, wo Jimsy Schweinehirte geworden ist.

Conan und Jimsy erkunden das Schiff, während Lana das Dorf vor dem Überfall warnt. Orlos Männer versuchen, die Eindringlinge zu bekämpfen, werden jedoch besiegt. Nachdem sie Tera gerettet haben, eilen Conan, Jimsy und Dyce zum Dorf, um den Dorfbewohnern bei der Organisation ihrer Verteidigung zu helfen.

Conan rettet Lana vor den Soldaten, wird jedoch bewusstlos. Lana schafft es, ihn zu verstecken, bevor sie gefangen genommen und an Bord des Gunboats gebracht wird. Industria besetzt High Harbor und Orlo wird als Marionettengouverneur eingesetzt.

Nach dem Verlust des Gunboats beschließt Monsley, die Barracuda reparieren zu lassen, während Orlos Bande losgeschickt wird, um Conan zu finden. Conan und Gull planen, auch die Barracuda in die Luft zu jagen. Auf der Flucht vor den Industrianern stößt Dyce im Fischweiher auf Lana.

Der Bürgermeister lässt die Soldaten in ihre Gemeinschaft eintreten. Conan beschließt, mit einem alten Wasserflugzeug, das Dr. Lao im Fischweiher zurückgelassen hat, nach Industria zurückzukehren. Zusammen mit Jimsy, Monsley, Lana als Last-Minute-Mitglied und Dyce als blindem Passagier verlässt Conan High Harbor.

Conan und Monsley stürzen in Industria ab und werden gefangen genommen. Während sie verfolgt werden, finden Lana, Dyce und Jimsy einen Weg in die unterirdischen Wohngebiete von Industria.Conan und Monsley stürzen in Industria ab und werden gefangen genommen. Während sie verfolgt werden, finden Lana, Dyce und Jimsy einen Weg in die unterirdischen Wohngebiete von Industria.

Conan steigt in das Wohngebiet hinab, um Lana zu retten. Nachdem er Lepkas Absichten, den Untergrund zu fluten, belauscht hat, versucht er, seinen Plan zu durchkreuzen.

Conan steigt den Turm hinauf, um Lepka zu konfrontieren, der mit Lana als Geisel versucht, mit Laos Flugmaschine zu fliehen. Conan legt die Flugmaschine lahm und rettet Lana, während Lepka offenbar an Bord der abstürzenden Maschine umkommt.

Während neue Erdbeben den Untergang Industrias ankündigen, leiten Lepka, der den Absturz seines Fliegers überlebt hat, und eine Truppe von Loyalisten heimlich Solarenergie in den Untergrund, um die Giganto aufzuladen. Als das Stromleck entdeckt und unterbrochen wird, besetzen Lepkas Streitkräfte heimlich den Kontrollraum.

Conan, Jimsy und Dyce beginnen die Giganto von innen heraus zu zerstören. Während Dyce und Jimsy schließlich mit dem Heckruder abgeworfen werden, konfrontiert Conan Lepka, der versucht, mit einer Rettungskapsel zu entkommen.

Auf dem Weg nach High Harbor holt das Passagierschiff Conan, Dyce und Jimsy aus dem Meer. Nachdem Dr. Lao Conan die Verantwortung für Lana übergibt, stirbt er zufrieden. Einige Zeit später veranstalten die alten und neuen Bewohner von High Harbor eine doppelte Feier rund um eine Hochzeit und der Instandsetzung der Barracuda.