Een man observeert een mysterieuze glazen doos, de politie van South Dakota ontdekt een afschuwelijke misdaad en Hawk ontvangt een cryptische boodschap over Special Agent Dale Cooper.

Hawk zoekt iets in het bos terwijl Cooper ontdekt dat zijn lot in de Zwarte Loge misschien toch niet bezegeld is.

Cooper roept hulp in, Agenten Gordon Cole, Albert Rosenfield en Tammy Preston onderzoeken de glasbakmoorden.

Coop doet zich voor als Dougie Jones, terwijl Gordon en de agenten Rosenfield en Preston de situatie rond Coop's dubbelganger onderzoeken.

Coop zit nog steeds vast in het lichaam van Dougie, terwijl zijn dubbelganger in de gevangenis zijn plannen uitvoert. Ondertussen duikt er nieuwe informatie op over majoor Garland Briggs.

Gordon Cole instrueert Albert om een oud contact te ontmoeten. Hawk doet een ontdekking over "het ontbrekende stuk" dat hem zal helpen Coop te vinden. Janey-E lost Dougie's gokschuld in, terwijl Coop nog steeds moeite heeft om wat hij weet over zijn verleden en de Zwarte Loge onder woorden te brengen. Tragedie slaat toe nadat een drugsdeal heeft plaatsgevonden.

Cooper en Janey-E komen voor een gewelddadige verrassing te staan op het Lucky 7 kantoor. Ondertussen proberen Gordon en Albert Diane in te schakelen om het mysterie op te lossen van de man waarvan ze denken dat het Cooper is.

Coop's dubbelganger wordt geconfronteerd met een situatie van leven of dood. In 1945 wordt een bom gedropt en het kwaad van de moderne mens wordt belichaamd.

Er komt meer over Dougie Jones leven aan het licht na een aanslag op diens leven. Ondertussen ontdekt Gordon Cole connecties met Cooper betreffende een Blue Rose zaak en majoor Garland Briggs.

De gebroeders Mitchum komen meer te weten over Dougie Jones. In Twin Peaks begaat Richard Horne gruwelijke daden en Hawk krijgt meer aanwijzingen van de Log Lady.

De zaak rond de gebroeders Mitchum en Dougie bereikt een hoogtepunt, terwijl er nog vreemdere dingen gebeuren met zowel het FBI-team als in het sheriffbureau van Twin Peaks.

Een oude FBI-zaak krijgt na vele jaren nieuwe rekruten, terwijl bekende bewoners van Twin Peaks voor problemen komen te staan.

Dougie komt thuis met geschenken terwijl Anthony op een riskante missie wordt gestuurd, Evil Cooper wil wraak.

Gordon herinnert zich een belangrijk moment uit zijn verleden. Andy, Bobby, Hawk en Truman gaan naar het bos. James hoort een verhaal over een handschoen op zijn verjaardag. Een onbekend facet van Sarah wordt onthuld.

Big Ed en Norma hebben een doorbraak in hun relatie. Evil Cooper probeert opnieuw contact te leggen met een oude vriend, terwijl Dougie Jones tot een opwindende ontdekking komt.

Dougie's dierbaren verzorgen hem in het ziekenhuis en Mr. C gaat richting de coördinaten. Ondertussen legt Diane een bekentenis af aan de FBI.

Cooper komt aan in Twin Peaks.

Cooper probeert een getroebleerde vrouw te helpen waarvan hij denkt dat het Laura Palmer is.