In der Kleinstadt Twin Peaks wurde die 17-jährige Laura Palmer ermordet. Sheriff Truman und FBI-Agent Cooper machen sich auf die Suche nach dem Täter. Bei ihren Ermittlungen stellen die beiden bald fest, dass in Twin Peaks fast jeder etwas zu verbergen hat.

Sheriff Truman und Dale Cooper tappen in der Mordsache Laura Palmer im Dunkeln. Auf den ersten Blick scheint Laura ein beliebtes und hochanständiges Mädchen gewesen zu sein. Doch offenbar gab es Dinge in ihrem Leben, von denen nicht einmal ihre beste Freundin Donna wusste.

Von Audrey Horne erfährt Cooper, dass Laura Palmer im Warenhaus ihres Vaters gearbeitet hatte, genau wie das zweite Opfer Ronette Pulaski. Eine Autopsie bestätigt unterdessen Coopers Theorie: Laura war kokainabhängig.

In einem Magazin mit Kontaktanzeigen taucht ein äußerst freizügiges Foto von Laura Palmer auf. Es stellt sich heraus, dass Laura die Interessenten in Jacques Renaults Blockhaus empfing. Dale Cooper und Sheriff Truman machen sich auf die Suche nach der Hütte.

Audrey lässt sich als Hostess im "One-Eyed Jacks" engagieren. Währenddessen stattet Dale Cooper dem Kasino, das dem Bordell angeschlossen ist, einen Besuch ab. Donna und James stellen Dr. Jacoby, den sie für Lauras Mörder halten, eine Falle.

Agent Dale Cooper muss sich vor einem Untersuchungsausschuss verantworten. Ihm wird Rauschgifthandel und Mord vorgeworfen. Jocelyn erzählt Sheriff Truman, wer damals ihren Mann Andrew ermorden ließ.

Bobby Briggs erhält von Benjamin Horne den Auftrag, Hank Jennings zu beschatten. Er fotografiert diesen bei einem Treffen mit dem Verbrecher Jean Renault und Normas Stiefvater Ernie. Audrey stiehlt die brisanten Fotos und lässt sie Agent Cooper zukommen.

Auf der Jagd nach Windom Earle, der Annie entführt hat, wagt sich Cooper durch das Tor zu einer anderen Welt in die sagenumwobene Schwarze Hütte. Dort, jenseits von Leben und Tod, beherrschen die Geister das Geschehen.

Coopers Doppelgänger hat den Angriff überlebt und wird von zwei Komplizen wieder zusammengeflickt. Unterdessen nimmt die Polizei in Las Vegas den echten Coop genauer unter die Lupe. FBI-Vizedirektor Cole legt einen Zwischenstopp in South Dakota ein, wo einer der Toten als der vor 25 Jahren verschwundene Major Briggs identifiziert wurde. In Twin Peaks erhalten die Sheriffs von der Witwe des Majors eine Kapsel mit einer rätselhaften Botschaft.