Viene ritrovato il cadavere semi decomposto di un presunto giovane. Booth e Bones scoprono la sua identità: si tratta di un ragazzo solitario frequentante un clan dedito al fanatismo per i giochi di ruolo e le storie a fumetti. Zack, effettuando la pulizia delle ossa del cadavere, rileva la presenza di un altro osso non appartenente alla vittima: è caccia al suo assassino.

Brennan va a New Orleans per aiutare a identificare i corpi dissotterrati dal passaggio dell'uragano Katrina.