El equipo del Jeffersonian investiga la muerte de una mujer cuyo cuerpo se encontró mutilado y desechado en un contenedor de basura de la ciudad.

Al despertar, Angela y Hodgins encuentran un cadáver sangriento colgado sobre la cama y deciden comenzar una investigación sin participar al equipo del Jeffersonian.

El equipo del Jeffersonian investiga los restos de dos cuerpos de mujer encontrados en el mismo sitio: una de las cuales padeció cáncer, acompañada de su "doula" (rol dentro de las creencias brahmánicas), quien fue su guía a través de su proceso de duelo con la enfermedad. El caso saca a la luz lo que cada cual -Brennan y Booth- ha dispuesto como arreglos posteriores a la muerte. Asimismo, Daisy Wick, la ex-novia de Sweet, regresa para su primer caso después de su ruptura.

Cuando a Brennan le disparan mientras trabajaba tarde en el laboratorio del Jeffersonian, llega al hospital en condición crítica. Mientras está allí, lucha con visiones de su madre que desafía lo lógica usual. Mientras tanto, todas las evidencias sugieren que el atacante de Breenan puede estar vinculado con el Jeffersonian.

El equipo del Jeffersonian investiga la muerte de Symchay Conteh, un joven cuyos restos fueron encontrados en un barril en una empresa de eliminación de residuos peligrosos. Pronto descubren que la víctima era un inmigrante de Sierra Leona que tenía varios empleos basura. Mientras el equipo se adentra más en la investigación, Cam y Arastoo encuentran aún más difícil mantener su relación en secreto. Paralelamente Brennan y Booth discuten sobre su destino de vacaciones.

Un cadáver carbonizado en un búnker lleva al FBI hasta un infante de marina licenciado y hasta un grupo de supervivencia. La manera en que se produjo la explosión es la clave para descubrir al culpable. Mientras tanto, Sweets puede haber encontrado un nuevo apartamento.

Christopher Pelant reaparece y asesina a varios agentes del FBI que compartieron pasado con Booth. Sweets se da cuenta a través de las evidencias de que algo le resulta familiar, y descubre que se está basando en unos documentos inéditos escritos por él. Brennan reevalúa su relación con Booth, temiendo que él sea su objetivo final, por lo que cambia su manera de pensar respecto a su situación de pareja.