Brennan i Zack przeszukują miejsce rozbicia samolotu z chińskimi dyplomatami i kobietą. Na miejscu zdarzenia Brennan znajduje fragmenty kości, które nie mogą należeć do żadnego z pasażerów, ale mogą należeć do człowieka, który zaginął pięć lat wcześniej. Dr Goodman nakazuje ekipie skupić się wyłącznie na sprawie dyplomatów, ale Bones decyduje się, za jego plecami prowadzić śledztwo w sprawie fragmentów kości.

Brennan jest w trakcie pracy przy wypadku kolejowym, gdy okazuje się, że ma nowego szefa – dr Camille Saroyan. Pociąg wiózł popularnego senatora i wykoleił się z powodu samochodu, który zatrzymał się na torach. Brennan szuka odpowiedzi na pytanie, dlaczego ciało martwego biznesmena zostało umieszczone w tym samochodzie. W tym odcinku Bones stara się odnaleźć swego ojca.

Trwa śledztwo w sprawie śmierci studenta szkoły filmowej, który robił dokumentalny film na temat legendy o bezgłowej czarownicy, mieszkającej w nawiedzonym lesie 300 lat temu. Brennan odczuwa silną więź z bratem ofiary.

Ekipa prowadzi dochodzenie w sprawie śmierci młodej Azjatki, z której ciała usunięto wszystkie kości. Sully składa Brennan kuszącą propozycję, której ona nie może jednak przyjąć.

Rozkładający się szkielet młodej kobiety zostaje znaleziony w wózku sklepowym. Jednak po rekonstrukcji twarzy okazuje się, że dziewczyna wyglądała na osiemdziesięciolatkę. Booth i Bones nie mogą znaleźć nikogo, kto chciałby zabić dziewczynę. W międzyczasie Max Kennan, ojciec Bones, pojawia się z informacją z jej przeszłości. Angela i Hodgins chcą się pobrać, ale gdy stają przed ołtarzem, nic nie idzie zgodnie z planem.