La Voyager está atravesando una extensa franja del espacio en la que sólo existe el vacío. Pronto se dan cuenta de que hay una serie de naves alienígenas que utilizan el vacío para algo inesperado.

Unos alienígenas invaden la Voyager y están convencidos que el programa holográfico Las aventuras del capitán Protón, de Tom Paris, es real. Con el fin de que los alienígenas logren derrotar al villano del programa holográfico, la tripulación de la Voyager decide colaborar representado personajes de la aventura.

Mientras la Voyager es zarandeada por una serie de ondas distorsionantes que la envían hacia atrás y hacia delante en el tiempo, un Chakotay inmune colabora con la tripulación repartida entre los periodos temporales para restaurar la estabilidad de la nave.