L'equipaggio rimane sconcertato quando il Capitano Janeway e Sette di Nove iniziano un'importante e segretissima operazione in risposta a uno strano disturbo subspaziale. Chakotay riesce, dopo molte insistenze, a convincere il capitano a parlare, almeno con gli ufficiali, del problema, in modo da poterlo affrontare insieme. Janeway spiega che i sensori della Voyager hanno scoperto la presenza di una sostanza altamente pericolosa e completamente instabile, chiamata Omega. La molecola ha la capacità di distruggere il subspazio in modo da impedire ogni spostamento a velocità curvatura. Gli ordini della Flotta stellare riguardanti Omega, classificati al più alto livello di sicurezza, sono di distruggere ogni molecola di tale sostanza appena la si incontra. Sette di Nove afferma però che i Borg credono di avere conoscenze sufficienti per imbrigliare e stabilizzare Omega, in modo che non sia più un pericolo, conoscenze che lei vorrebbe utilizzare.