哈里·金一觉之后，意外发现自己不知什么原因身处旧金山的家中，惊慌之下，哈里试图找出自己为何会身处地球，他从服役记录中发现几个月前自己没能登上航海家号，而是调至星际舰队总部从事星舰设计工作，现在的自己已经和女朋友结了婚，生活幸福美满。哈里不敢相信眼前的一切，在过着美好生活的同时也感到惶恐不安，认为对不起航海家号上的同伴。他找到了该为时空错乱负责的外星人，对方告诉他，要想修复时间线就必须冒着时空紊乱的风险，重现异常开始的那一刻，哈里在马赛找到汤姆·派里斯——后者因为在深空九号斗殴，也没登上航海家号——想要让他帮忙，但此刻的派里斯完全是个扶不起的阿斗，不肯帮忙，更糟糕的是，因为非法入侵航海家号数据库，哈里被星际舰队当成间谍四处追捕。汤姆·派里斯和哈里金登上了原型舰黄石号，逃了出去。就在星舰即将爆炸时，启动了紧急传送……一瞬间哈里回到了航海家号上。