Un barril radiactivo se abre accidentalmente, liberando una espantosa bestia de alcantarilla que envuelve a sus víctimas en yogur helado.

Un misterioso camionero fantasma está aterrorizando Cueva Cristal. Además, todos los pomos de las puertas de la ciudad están desapareciendo.

Cuando una estudiante de intercambio llamada Mai Lee llega a la ciudad para quedarse con Velma, unos extraños magos del kung fu atacan la ciudad para atraparla.

El misterio llega a su fin. La pandilla de Scooby finalmente llega al fondo de lo que sucedió con los originales Misterios, S. A. y por qué desaparecieron.

La pandilla se ha disuelto y Cueva Cristal está siendo atacada por el malvado Bebé Bufón.

Un extraño motero está raptando a todas las mujeres de Cueva Cristal, así que la pandilla debe intervenir.