Il padre di Claire ha un nuovo partner, mentre Hiro ed Ando seguono Daphne fino in Germania e Tracy Strauss si mette alla ricerca di risposte su Niki. Entrano in scena quattro nuovi nemici.

Mentre il presidente inizia ad indagare sulle attività di Nathan, Sylar si prepara a trovare suo padre. Hiro, Ando e Matt viaggiano verso l'India per trovare un nuovo alleato e Claire affronta l'ira del padre per proteggere un nuovo amico.