Jessica e D.L. scoprono che Linderman vuole ottenere qualcos'altro da loro e da Micah. Hiro e Ando seguono Sylar, ma Hiro si blocca di fronte all'enormità dell'atto di uccidere un altro essere umano... Intanto, Angela Petrelli cerca di convincere Nathan ad aderire al piano da lei concepito anni prima insieme a Linderman.

Sylar, ancora impegnato in una improbabile alleanza, affronta una crisi d'identità mentre il suo nuovo potere comincia ad influenzarlo in strani modi. Hiro ed Ando cercano di abbattere l'edificio 26 mentre Matt lotta con la paternità. Nathan inizia a mettere insieme un piano per sistemare le cose.

Sylar comincia a ritrovare la sua vera identità. Peter e HRG sono alla ricerca di qualcuno che possa salvare Hiro.