포드 042의 보고. 서력 5012년. '외계인'이라 불리는 생명체가 지구 침략을 개시. 인류가 달로 도망간 이후 지상에서는 인류가 만들어낸 '안드로이드'와 외계인이 만들어낸 '기계 생명체' 간의 싸움이 오랫동안 이어지고 있다. 해당 기체는 수행 지원 유닛 '포드 042'. 11945년 3월 10일부로 결행된 '제243차 강하 작전'에서 '요르하 부대' 소속 안드로이드 '2B' 지원을 담당한다. 이후 동일한 작전에서 같은 요르하 소속 '9S'의 수행 지원을 담당하는 '포드 153'과 함께 정기적인 임무 보고를 진행한다.

포드 153의 보고. 지상에서 탐색을 진행하던 중 아카이브에 등록되지 않은 신규 데이터를 발견. 공유 서버에 전송한다. 그 기계 생명체에게 있어 안드로이드를 파괴하는 것은 사명이었습니다. 하지만 그 기계 생명체에게 안드로이드와 싸우고자 하는 의지는 더 이상 없었습니다. 그 기계 생명체는 한 송이의 작은 꽃을 찾았습니다. 그 기계 생명체는, 자신 안에서 알 수 없는 '무언가'가 싹트기 시작한 것을 느꼈습니다.

포드 042의 보고. 요르하 기체 2B와 9S는 기계 생명체의 습격을 받고 있던 레지스탕스 집단을 구출. '릴리'라고 하는 레지스탕스 부대 리더의 안내로, 그들의 거주지인 레지스탕스 캠프로 안내받았다. 캠프 체류 중에 레지스탕스의 멤버인 잭애스로부터 기계 생명체 중 특수 개체에 대한 정보를 습득. 해당 정보는 2B, 9S 양쪽에게 내려진 조사 임무와도 같은 내용인 것으로 판단. 잭애스와 함께 사막 지대에서 조사를 개시한다.

포드 153의 보고. 사막 지대에서의 조사 결과 '말을 하는 기계 생명체', '안드로이드를 모방한 외견의 기계 생명체' 등 과거 기록 데이터에 없는 특수 개체를 다수 확인. 이에 대한 자세한 정보는 서버에 업로드 완료. 또한 2B와 9S는 사령관으로부터 요르하 부대원 수색 임무를 지시받음. 행방불명된 기체들은 지상에서 임무 중 연락이 끊어진 것으로 추정됨. 블랙박스의 신호 발생 지점은 특정이 된 관계로, 해당 지점에 대한 목표물 수색을 개시한다.

포드 042의 보고. 폐허 도시 지역에서 레지스탕스와 기계 생명체 간의 교역 정보를 확인. 안드로이드와 기계 생명체는 적대 관계이지만, 교역 대상인 기계 생명체에게선 적성 반응 및 전투 의지가 확인되지 않은 것으로 파악됨. 릴리로부터 기계 생명체들에게 소재를 전달할 것을 의뢰받은 2B, 9S 둘과 함께 해당 지역에 대한 조사를 개시함.

포드 042 · 포드 153 양쪽으로부터 보고. 과거의 기록이라고 추측되는 데이터를 발견. 공유 서버로 전송함. 11941년 12월 8일. 어떤 비밀 임무와 함께 지구로 파견된 안드로이드들과 조우. 낯선 모습을 하고 있는 그들은 스스로를 ′요르하 부대′라고 불렀다. 우리를 버린 사령부. 비밀 사항투성이고 수수께끼로 가득한 요르하 부대. 하지만 의심하기만 해서는 가족을 지킬 수 없다. 나의 선택이, 우리들의 싸움이, 오랜 시간 동안 이어져 온 소모전의 돌파구가 되기를 바란다.

포드 153의 보고. 현시점까지의 임무에 있어서 기계 생명체의 변이체와 다수 조우했고, 일부와는 전투까지 발생함. 각 개체의 정보는 저번과 같이 서버에 업로드 완료. 이후 적과의 조우에 대비해서 벙커에서의 정보 해석 및 그 결과 공유를 요청함. 개체 식별 신호 : '파스칼'의 반응을 확인. 기계 생명체들의 마을에서 거주하는 한 기체가 미아가 된 것으로 추정됨. 의뢰에 따라 숲의 왕국 에어리어에 대한 수색을 개시함.

포드 042의 보고. 숲의 왕국 에어리어에서 지명 수배 중인 요르하 기체 'A2'를 발견. 해당 기체는 임무를 포기했을 뿐만 아니라 현재까지 계속 도망쳐온 상태이므로 위험 개체로 지정됨. 사령관으로부터 2B, 9S는 A2를 추적 및 조사할 것을 명령받았고, 레지스탕스 및 파스칼과 접촉해 정보 수집을 개시함.

수몰 도시에서 A2와 비슷한 인영을 추적하다 실종된 9S. 2B는 그를 구하기 위해 그의 흔적을 추적하다 정체를 알 수 없는 공간에 들어왔고, 그곳에서 2B는 전에 사막 지대에서 조우한 적 있었던 특수 개체인 기계 생명체 아담과 만나게 되었다. 아담은 지금까지 자신은 인류에게 크나큰 흥미를 가지고 있었다고 말하며, 그녀에게 자신과 함께 인류가 가진 ′마음′의 신비에 도달해 보자고 제안했는데.

어찌어찌 9S를 구출하는 데에 성공한 2B. 이를 상부에 보고하자, 상부에서는 2B에게 지난번 공간에서 결국엔 놓친 특수 개체인 아담을 파괴하라고 명령을 내렸다. 이를 위해 2B가 해당 위치로 이동하자 그곳에는 파스칼의 공동체와는 다른 형태인 기계 생명체 공동체가 있었고, 그들은 마치 인간인 것마냥 어떤 ′신′이란 존재를 섬기고 있었는데.

포드 153의 보고. 새로운 기계 생명체 네트워크 구축을 확인. 그 중심은 '아담'이 담당하고 있을 것으로 추정됨. 아담 수색 중, 기계 생명체의 대규모 폭주가 발생. 같은 현상이 지상 각지에서 동시다발적으로 확인된 상황. 사령관으로부터 전 요르하 부대를 대상으로 한 적 기계 생명체 요격 명령이 발령됨. 현재 다수의 요르하 부대 및 레지스탕스로부터, 교전 보고 및 지원 요청이 쇄도하고 있음. 본기는 2B와 함께 레지스탕스 캠프 지원 활동을 개시함.

포드 042 & 포드 153 양쪽으로부터 보고. 포드 042 보고 : 폭주한 아담은 9S의 해킹, 레지스탕스의 요격 및 벙커로부터의 지원 포격에 의해 ---포드 042와의 통신을 복구 중입니다. 복구까지 12초------포드 153과의 통신을 복구 중입니다. 복구까지 15초--- 포드 042로부터 포드 153에게 : 지상 및 상공으로부터의 대규모 공격에 의해 일시적인 통신 에러가 발생. 현재 복구 작업 중. 포드 153으로부터 포드 042에게 : 본기도 같은 장해를 확인. 기록 시스템은 이상 없음. 포드 042로부터 포드 153에게 : 라져. 본기의 시스템 또한 현시점에서 이상은 발견되지 않음. 계속해서 수행 지원 대상인 2B와 함께 조사 임무와 그 기록을 수행하겠음. 포드 153으로부터 포드 042에게 : 라져. 본기 또한 9S와 임무 수행 및 기록을 수행하겠음.