"Emily Lake" prvi je dio zadnje epizode treće sezone "Skladišta 13". Kad Claudia u Skladištu pronalazi nanite, male robotske špijune koje je podmetnuo Sykes kako bi doznao tajnu dosjea Atlas 66, Myka želi krenuti na teren kako bi osobno onesposobila Sykesa. Ali Jane kao regentica zabranjuje agentima da se miješaju jer su regenti već pokrenuli svoj plan... Ipak, Pete i Myka istražuju na svoju ruku i opet nailaze na H. G. Wells. Ali nju za svoje mračne planove traži i Sykes.

2. dio finala treće sezone Agenti su ipak krenuli u potragu za Sykesom i za njim jure diljem svijeta. Iz prošlosti je ponovno iskrsnula Helena G. Wells kao naivna učiteljica koju Sykes otima. Tu je i Jinks koji se udružio s njihovim najgorim neprijateljem, a kad ga nalaze mrtva u Sykesovu skloništu, otkrivaju da im je Jinks pomagao sve do svoje smrti...

Ekipa dobiva vijest koja će zauvijek promijeniti njihovu i budućnost Skladišta.