Pete-t és Myka-t ezúttal egy kisvárosba küldik, hogy vizsgálják ki, mi lehet az oka az ott lakók furcsa viselkedésének. Mindeközben, Artie-nak most az energia ingadozás okoz problémát a raktárban.

Egy misztikus szobor ellopása vezeti el Myka-t és Peter-t egy felszentelt ősi indián barlangba, amely őrzi a teremtés titkát.. és megsemmisítését.

MacPherson egy titkos cselszövést folytat a háttérben, melynek keretében kiárusítja a raktár értékes leleteit. Egy nyom azonban, mégis közvetlenül hozzá vezeti Artie-t, Pete-t és Myka-t, akik rájönnek a tervre.

Artie szerencsésen túléli a robbanást, miután MacPherson egy újabb rabot szöktet meg a 'Bronz Szektor'-ból, és Európába utazik, hogy folytassa terve megvalósítását. Pete és Myka felfedik a szökött fegyenc személyét, aki nem más, mint H. G. Wells. Mindeközben, Mrs. Frederic-nek sikerül beazonosítania az igazi árulót és Claudia egy rövid időre újra találkozik a bátyjával.

A csapat megpróbál lenyomozni egy gazfickót, és felkutatni egy ereklyét, mely kiszámíthatatlan erővel bír. Mindeközben, Pete-nek választania kell Kelly és a küldetésük között és Claudia elcsodálkozik a raktárral kapcsolatos jövőjén.

Miközben Artie és Claudia Jimi Hendrix megkergült gitárját hatástalanítja, a kilépett Myka helyére Artie új társat talál Steve Jinks ügynök személyében, aki mindig tudja, ha valaki hazudik. Első közös ügyükben az elveszett fóliáns oldalai ölik az embereket. Pete Myka segítségét kéri az ügyben, és megismerkednek Sally Stukowski FBI-ügynökkel. Mrs. Frederic a bebörtönzött, de holografikus képként megjelenő H. G. Wells ügynök segítségével ráveszi Mykát, hogy visszatérjen a 13-as raktárba

In the aftermath of the warehouse's destruction, the Warehouse team races against the clock to find a way to undo time itself and put right what went wrong. However, Artie finds himself facing a difficult decision when he is warned that saving the warehouse will unleash an even greater evil.

Pete végre megnyugodhat, miután az orvosi vizsgálatok során kiderül, hogy Myka cisztája jóindulatú. Steve és Artie mindeközben próbálják kijuttatni a raktárból Claudia-t, aki nagy veszélyben van. Paracelsus lett a raktár mindenható ura és gondnoka, miután Pete halhatatlanná tette.