失去了幼年记忆的的希斯特利亚睁开眼睛，发现了一个名为罗德·雷斯的男子自称是她的父亲。罗德一边抱住希斯特利亚，一边说出了关于雷斯家的重大秘密。另一方面，韩吉也通过俘虏的中央宪兵了解了雷斯家的秘密。为了决定今后方针，韩吉告知了艾尔文关于雷斯家的情报。那时，艾尔文正在会见皮克西斯，表明了要推翻王政的决心。

调查兵团在中央宪兵的设计诬陷下背负了杀害平民的罪行。利威尔班因此遭到王政府的通缉，奉命搜捕调查兵的宪兵马尔洛和希琪踏入了利威尔班躲藏着的森林。发现了打水的阿尔敏，但二人随后便被埋伏的利威尔等人控制。对宪兵团的做法抱有疑问的马尔洛提出了协助调查兵团的请求。利威尔把处理两名宪兵的任务交给了让……

希斯特利亚违背了罗德的意志，打算带着艾伦从礼堂逃出。舔舐了洒在地上的巨人脊髓液的罗德巨人化了。赶来的调查兵团的伙伴们将被巨人化形成的热浪击飞的希斯特利亚和被囚禁的艾伦救了出来。与此同时，罗德变成了比超大型巨人还要大上一倍的巨人。自己和伙伴们再次面临着危机，这一次，艾伦选择了相信自己......

阿尔敏的作战成功了，艾伦来到了阿尔敏面前。正在艾伦悲伤之时，两道身影出现在城墙上……

艾伦的父亲格里沙留下的日记中记载着他过去的记忆。彼时还是年幼少年的格里沙，在那一天突然面对了这个世界的真相……