Sam Evans wird neues Mitglied im Glee Club. Dort lautet diese Woche das Motto „Ein Duett“. Dem Gewinnerpaar spendiert Will ein Dinner bei „Breadsticks“. Quinn zögert nicht lange und schnappt sich Sam als Duettpartner. Finn will das verhindern, damit Sam nicht gleich zum Loser wird und den Club bald wieder verlassen muss. Auch Rachel erkennt den Ernst der Lage und will sogar auf ihr Duett mit Finn verzichten. Doch ihr Plan fliegt auf und die beiden müssen kurzerhand umdisponieren. Sie wollen eine ganz fürchterliche Gesangsdarbietung abliefern und sich quasi selbst disqualifizieren. Ihr Plan geht tatsächlich auf: da in Mike kein Meistersänger steckt und Artie und Brit erst im Bett und dann gesanglich stranden, gewinnen letztendlich Sam und Quinn den Wettbewerb. Die beiden kommen sich allmählich näher und lösen ihren Gewinnerpreis ein. Währenddessen pflegt Kurt zu Hause seinen Vater. Dieser macht ihm klar, dass man im Leben seinen Weg alleine gehen muss …

Schulleiter Figgins macht Will auf ein eklatantes Problem an der McKinley High aufmerksam: Alkoholmissbrauch. Immer mehr Schüler kommen betrunken in den Unterricht und auch der Glee-Club ist davon nicht ausgeschlossen – vor allem in berühmten Pop-Songs würde Alkoholkonsum immer mehr beschönigt. Figgins appelliert daher an Will, etwas dagegen zu unternehmen. Er soll mit dem Glee-Club ein Anti-Alkohol-Lied einstudieren und dies im Rahmen der Aktionswoche performen. Nachdem Puck herausgefunden hat, dass Rachels Vater am Wochenende nicht in der Stadt ist, versucht er sie davon zu überzeugen, bei sich zu Hause eine Party für den Glee-Club zu veranstalten. Zwar ist Rachel zunächst skeptisch, doch als Puck ihr vorwirft, langweilig zu sein, stimmt sie schließlich zu. Nun sieht Rachel darin die Chance, ihr „Prinzessin-Image“ ein für alle Mal abzulegen. Sehr zum Unmut aller Feierwütigen, bekommt jedoch jeder Gast von Rachel nur zwei Getränkecoupons ausgehändigt, damit ihre Party nicht in einem Trinkgelage endet. Doch schnell wird es vielen zu langweilig und die Stimmung droht zu kippen, bis Rachel Pucks Drängen endlich nachgibt und die Barschränke ihres Vaters öffnet. Beim Flaschendrehen müssen sich Rachel und Blaine küssen. Doch nach dem Kuss ist Blaine plötzlich verunsichert – ist er vielleicht doch nicht homosexuell? Aufgrund des Trinkgelages am Vorabend, gerät die Probe des Glee-Clubs am nächsten Tag zu einem Desaster. Will kann das Verhalten der Schüler nicht verstehen, doch nach Feierabend merkt Will schnell, dass er seiner Vorbildfunktion als Lehrer nicht immer gerecht wird: Er trifft sich mit Trainerin Beiste in einer Kneipe. Schon bald sind beide ebenfalls sehr betrunken und ausgerechnet in diesem Zustand beschließt Will, Emma anzurufen, um ihr seine wahren Gefühle zu gestehen. Doch statt mit ihr sprechen zu können, springt nur der Anrufbeantworter an und Will hinterlässt ihr eine liebestolle Nachricht. Beschämt entschuldigt sich Will am nächsten Tag bei Emma, doch dabei muss er geschockt feststellen, dass er in der Nacht nicht Emma, sondern offenbar einem fremden Anrufbeantworter seine Gefühle offenbart hat …

Die Wahl zum Königspaar des Abschlussballes geht in die heiße Phase. In einer Umfrage liegen Quinn und Finn auf dem ersten Platz, dicht gefolgt von Puck und Lauren. Die Vorbereitungen für das Schulevent des Jahres laufen derweil weiter auf Hochtouren: Mercedes ist frustriert, da sie kein Date für den Ball hat und Lauren ist verzweifelt auf der Suche nach einem passenden Kleid. Zu allem Übel gibt Schulleiter Figgins dann auch noch bekannt, dass der Glee-Club auf dem Ball auftreten soll, da die ursprünglich gebuchte Band abgesagt hat. Sue ist als Organisatorin und bekennende Glee-Club-Gegnerin natürlich sofort dagegen und ausnahmsweise muss Will ihr dieses Mal Recht geben. Denn die „Nationals“ stehen kurz bevor und Will fürchtet, dass die Schüler durch einen weiteren Auftritt zu sehr abgelenkt werden. Als Schulleiter Figgins dem Glee-Club für ihren Einsatz jedoch eine kleine Finanzspritze verspricht, sagt Will schließlich zu. Kurt bittet Blaine, ihn zum Abschlussball zu begleiten – und kassiert einen Korb: Blaine hat in der Vergangenheit schlechte Erfahrungen mit Schwulenhassern gemacht und hält sich seitdem von derartigen Veranstaltungen fern. Jessie St. James taucht überraschend auf und bittet Rachel um Verzeihung dafür, dass er in der Vergangenheit ihr Herz gebrochen hat. Finn gefällt dies überhaupt nicht und er macht seinem Ärger bei der ersten Gelegenheit Luft – auf dem Abschlussball kommt es zum Showdown. Doch über all den Ereignissen schwebt bis zum Schluss die Frage: Wer bekommt die Krone?

Ein neues Schuljahr beginnt und an der McKinley High ist einiges passiert. Nach langer Zeit haben Will und Emma nun endlich zueinander gefunden und genießen ihr Zusammenleben in vollen Zügen. Doch für den Glee-Club startet das Jahr mit weniger guten Neuigkeiten: Quinn, Sam und Lauren sind ausgestiegen und so fehlen dem Club nun neue Mitglieder. Doch wie sollen sie ihre Mitschüler davon überzeugen, bei ihnen mit zu machen? Will schlägt eine ungewöhnliche Lockmethode vor: Der Glee-Club hat von dem Musikliebhaber Al Motta lilafarbene Klaviere geschenkt bekommen. Um Aufmerksamkeit zu erregen, möchte Will diese Klaviere in der Schule verteilen und wann immer ein Glee-Schüler auf eines stößt, muss er darauf spielen. Doch als sich die Schülerin Sugar Motta, die Tochter des edlen Spenders, bewirbt, muss auch der übermotivierte Will erkennen, dass mit dieser Methode nicht nur große Talente angelockt werden. Sugar ist neu an der McKinley High und nicht nur absolut talentfrei, sondern macht bei ihrem Vorsingen auch noch einen überaus unsympathischen Eindruck.

Cheerleader-Trainerin Sue gibt auch in diesem Jahr ihren Plan, den Glee-Club zu zerstören nicht auf. Um endlich einmal im Kongress vorsprechen zu dürfen, hat sie sich ein besonders umstrittenes Thema überlegt, womit sie tatsächlich reichlich Stimmen sammeln könnte: Sie fordert die Auflösung aller Schulchöre, weil diese angeblich nur eine Verschwendung der Steuergelder darstellen. Ob sie damit durchkommen wird?

Kaum hat das neue Schuljahr angefangen, planen Rachel und Kurt schon ihre Zukunft. Sie wollen endlich ihre Träume verwirklichen und nach ihrem Abschluss an die renommierte New York Academy gehen, um sich dort zu Musical-Darstellern ausbilden zu lassen. Doch jährlich werden nur 20 Schüler aufgenommen und bei einem ersten Informationstreffen müssen Rachel und Kurt geschockt feststellen, dass die Konkurrenz keineswegs schläft …

Puck ist unsterblich in Shelby verliebt. Doch die Liebe zu seiner Lehrerin muss unter allen Umständen geheim bleiben – vor allem vor Quinn. Sie versucht immer noch, sich das Sorgerecht für ihre gemeinsame Tochter Beth mit allen Mitteln zu erkämpfen und Pucks Geständnis würde Quinn zu sehr schockieren. Puck ist sich sicher, dass Shelby die Frau seines Lebens ist, doch als er sie schließlich aufsucht, um ihr seine Gefühle zu offenbaren, wendet sich Shelby von ihm ab.

Um den Streitigkeiten zwischen den inzwischen konkurrierenden Schulchören an der McKinley High ein Ende zu setzen, schlagen Will und Shelby den Schülern einen „Mash Off“-Wettbewerb zwischen den „Troubletones“ und dem „Glee“-Club vor. Allerdings soll es wenig später nicht bloß bei einem gesanglichen Wettstreit bleiben: Auf dem Schulflur macht sich Santana, die inzwischen zum gegnerischen Chor gewechselt ist, über Finn lustig, so dass dieser daraufhin die Troubletones zu einem Völkerballturnier herausfordert – das blutig endet. Doch auch danach kann Santana es nicht lassen, weiter über Finn, dessen Tanzstil und seine Beziehung zu Rachel öffentlich herzuziehen und Finn kommt nicht umhin, der ganzen Schule endlich die Wahrheit und den Grund für Santanas Beleidigungen zu verraten: Santana ist lesbisch und unglücklich in Brittany verliebt.

Liebe liegt in der Luft und die Frühlingsgefühle spielen bei den Schülern der McKinley High total verrückt. Die kleine Becky hat sich in Artie verliebt, doch dieser hat schon ein Auge auf Sugar Motta geworfen. Allerdings kann er bei Sugar nicht landen, denn sie macht ihm schnell klar, dass sie an ihm nicht interessiert ist. Becky hingegen gibt nicht auf, Artie doch noch für sich zu gewinnen und dieser merkt plötzlich, dass er ebenfalls gerne Zeit mit ihr verbringt. Aber kann aus den beiden auch ein Liebespaar werden?

Shannon Beiste erzählt Emma im Lehrerzimmer, dass Cooter an Weihnachten um ihre Hand angehalten hat. Emma gerät sofort ins Schwärmen und denkt laut darüber nach, Will ebenfalls einen Antrag zu machen – nicht ahnend, dass Will in diesem Moment hinter ihr steht und alles mit anhört. Nun möchte Will seiner Freundin zuvor kommen, doch dafür muss er sich zunächst erneut Emmas Eltern stellen, um ihren Segen zu bekommen und das gestaltet sich schwieriger als gedacht.

Sam möchte derweil Mercedes’ Herz zurückerobern, doch die temperamentvolle Schülerin ist mittlerweile mit dem Football-Spieler Shane liiert. Sam möchte nun ebenfalls wieder dem Football-Team beitreten, doch der einzig freie Platz in einem Sportteam ist bei den Synchronschwimmern. Mercedes gibt sich allerdings unbeeindruckt von den sportlichen Avancen ihres Ex-Freundes. Erst als die „Glee“-Mitglieder die Ballade „The First Time That I Ever Saw Your Face“ singen, erinnert sich Mercedes an den Moment, als sie Sam das erste Mal sah. Klingt ganz so als bliebe es diese Woche nicht nur bei einem Heiratsantrag im „Glee“-Club. Aber wer wird der oder die Glückliche sein?

Nach Quinns schwerem Autounfall sitzt die schöne Schülerin im Rollstuhl. Doch von Trübsal blasen kann keine Rede sein – im Gegenteil: Quinn bewahrt Haltung, denn sie glaubt fest daran, dass ihre Lähmung irgendwann geheilt wird und sie zu den Nationals wieder fit ist. Alle sind beeindruckt von der starken Cheerleaderin, besonders Rollstuhlfahrer Artie kümmert sich rührend um Quinn. Doch am „Senior Ditch Day“, ein Tag, an dem die höheren Schulklassen den Unterricht schwänzen dürfen, scheint Quinns scheinbar so heldenhafte Fassade zu bröckeln.

Die „Glee“-Mitglieder kommen diese Woche in den Genuss einer Schauspielstunde von Blaines Bruder Cooper, der als Star eines Werbespots sehr bekannt ist. Alle sind begeistert von dem gutaussehenden Cooper, besonders die derzeit hormongesteuerte, schwangere Sue fällt regelrecht über ihn her. Doch Blaine ist von dem plötzlichen Auftauchen seines Bruders alles andere als begeistert, zu sehr stand er immer in dessen Schatten und hat darunter gelitten. Als Kurt die beiden Streithähne bei einem „Glee“-Treffen dazu ermuntert, im Duett zu singen, platzt Blaine kurz darauf der Kragen.

Die Hochzeitspläne von Rachel und Finn werden immer noch heiß debattiert. Auch Puck macht Finn noch einmal deutlich, dass dieser für Rachels Broadway-Traum nicht seine eigenen Pläne aufgeben darf. Alternativ schlägt Puck seinem Freund vor, gemeinsam einen Poolreinigungsservice in Los Angeles zu gründen. Aber lässt Finn sich tatsächlich dazu hinreißen?

Schulleiter Figgins ist der Meinung, dass Brittany ihr Amt als Jahrgangssprecher vernachlässigt und ermahnt sie, sich schleunigst ein Thema für den anstehenden Abschlussball auszudenken. Völlig überfordert wählt sie das unpassende Motto „Dinosaurier“ aus. Sue verkündet indes die Nominierten zur Wahl des Abschlussballkönigs und -königin, was bei einigen Schülern für allerlei Missmut sorgt: Die kleine Becky hatte fest mit einer Nominierung gerechnet und ist nun bitter enttäuscht, dass stattdessen Missy Gunderson, Santana und Quinn für die Wahl zur Abschlussballkönigin aufgestellt wurden. Rachel ist ebenfalls alles andere als begeistert. Nicht nur, dass ihr Vorsingen bei der Gesangsacademy ein Reinfall war, auch die Wahlplakate geben Rachel Grund zur Unzufriedenheit. Denn darauf sind ausgerechnet Quinn und Finn, der ebenfalls nominiert ist, in trauter Zweisamkeit zu sehen. Um den Schulball zu boykottieren, plant Rachel eine Gegenparty in einem Hotelzimmer. Doch die Partystimmung will bei ihren Gästen Kurt, Blaine, Becky und Puck nicht so recht aufkommen. Ob sie nicht doch besser auf den richtigen Ball gehen sollten? Und wer wird am Ende zum Königspaar des Abschlussballs gewählt?

Endlich ist es soweit: Der „Glee“-Club ist in Chicago angekommen, wo die diesjährigen „Nationals“ stattfinden. Doch kaum dort, bahnt sich eine Katastrophe an: Mercedes hat sich den Magen verdorben – und das ausgerechnet so kurz vor dem Wettbewerb. Will muss umdisponieren, hat jedoch Angst, dass seine Schützlinge bei einer Niederlage sehr enttäuscht sind. Emma muss ihn beruhigen und tatsächlich haben die Schüler so viel Energie und Ehrgeiz wie noch nie.

Nach ihrer Niederlage beim Vorsingen an der New York Academy gibt Rachel nicht auf und lädt die Schulleiterin Carmen Tibideaux persönlich zu den „Nationals“ ein, um sie davon zu überzeugen, dass Rachel das Zeug hat, an die renommierte Musicalschule zu gehen. Allerdings muss sie enttäuscht feststellen, dass Carmen ihre Einladung offenbar nicht angenommen hat, oder etwa doch?

Die drei Auftritte des „Glee“-Clubs sind ein voller Erfolg. Nun muss die berühmte Jury, bestehend unter anderem aus der Schauspielerin Lindsay Lohan und dem Internet-Blogger Perez Hilton entscheiden, welches Team das Bessere ist?

Blaine und Brittany kandidieren beide als Jahrgangssprecher und holen sich dafür tatkräftige Unterstützung ins Boot: Blaine wird von Sam unterstützt während Artie Brittanys Vize-Präsident ist. Bei der großen Debatte stellt Blaine Brittany als Tyrannin dar – doch kann er es tatsächlich gegen die beliebte Cheerleaderin aufnehmen oder hat er sich damit selbst ins Aus geschossen? Unterdessen mangelt es Will an Ideen für den Glee Club, seit er die Nationals mit den New Directions gewonnen hat. Er sucht nach Inspiration und neuen Herausforderungen und bewirbt sich auf eine externe Stelle, für die er die Schule verlassen muss. Was bedeutet seine Kündigung für den Glee-Club und die bevorstehende Hochzeit mit Emma? In New York tritt Kurt zum Bewerbungsgespräch für die Vogue an und trifft dort auf die Managerin Isabelle Wright, die von seinem Kleidungsstil hellauf begeistert ist und ihn als Praktikanten einstellt. Mit einem Makeover-Video von Rachel überzeugt er seine Chefin vollends von seinen Qualitäten und hilft Isabelle dabei, ihre Kreativität wiederzufinden, die sie schon seit langem verloren glaubte. Von ihrem neuen Style beflügelt lässt Rachel sich auf ein Date mit Brody ein. Gerade als die beiden sich küssen wollen, steht plötzlich ein unerwarteter Gast vor der Tür: Finn …

Es scheint, als müsste der Glee Club diese Woche ausfallen, denn Will ist krank. Doch die Nationals rücken immer näher, sodass Blaine und Sam sich eine Wochenaufgabe überlegen: Sie bitten die Mitglieder, Lieder zu singen, die ihnen peinlich sind. Während Kitty bei dieser Aufgabe aufblüht und endlich Anschluss im Team findet, bekommt Jake für seine Wahl des falschen Interpreten den Zorn der Mädchen ab. Und auch die Freundschaft zwischen Blaine und Sam wird auf eine harte Probe gestellt, denn Blaine steht nun öffentlich zu den Gefühlen für seinen besten Freund, der allerdings heterosexuell und vergeben ist. In New York hat Brody sich nach der Prügelei mit Finn von Rachel getrennt – allerdings ohne ihr den wahren Grund dafür zu nennen. Santana erzählt Rachel, dass ihr Ex-Freund sein Geld als Gigolo verdient hat und dass Finn ihr zuliebe nach New York kam, um Brody in seine Schranken zu weisen. Rachel ist erschüttert: Erneut liegt Rachels Zukunft in Scherben vor ihr – ist Finn womöglich doch der Richtige?