Después de matar a Alicia Corwin, Root mantiene cautivo a Finch, mientras Reese sigue su pista a través de un contable que tiene problemas con la Hermandad Aria, al final salva a un perro al que llama Bear.

Reese se dirige a texas junto con Carter para salvar a Finch, a través de una pista que conecta a Root con su pasado.

La hija de un diplomático brasileño es el objetivo a casar de un estafador que se hace pasar por su novio.

Reese es puesto a prueba en la cárcel para evitar que Donelly descubra su tapadera, aunque logra salir de prisión, es emboscado por Kara Stanton, a quien creia muerta en Ordos.

Una limpiadora de origen albanés en un hotel sufre la persecución de unos asesinos del gobierno serbio por ser testigo de la muerte de su familia a manos de un militar corrupto.

La máquina señala a una disidente agente del ISA llamada Samanta Shaw que increíblemente trabajaba para personas que saben de la existencia de la misma.

Después de reactivarse la máquina, Reese sigue la pista de Finch hasta una instalación gubernamental en el estado de Washington donde una confrontación acaba con el consejero especial muerto y con Root traumatizada y encerrada por Finch en un manicomio.

Shaw, Carter & Zoe Morgan se infiltran en una fiesta nocturna para averiguar de la vida de Ian Murphy, un padre soltero en apariencia un sociopata encantador, que en realidad tiene problemas con su suegro,a la vez, Root escapa del manicomnio no sin antes dispararle a Hersh.

Recuerdos de la adolescencia de Finch proporcionan conocimientos sobre la creación de la máquina. Además, el equipo recibe el número de un hombre ya moribundo, y Reese deja al equipo POI como consecuencia de la guerra con la organización criminal HR.

Root es disparada y capturada por Control. Además, se revela que Arthur ha hecho una copia de Samaritan antes de que fuera destruida. Harold le revela a Arthur que La Máquina existe y lo convence de que destruya a Samaritan.

Reese aborda un avión para escaparse de su vida anterior pero la máquina le cambia el itinerario, haciéndole tomar un vuelo que lo llevará a salvar una vida.

En una serie de FlashBacks a 2010, la narrativa revela la historia de fondo de Collier, el rostro de Vigilancia.

El equipo toma acciones drásticas en un intento por impedir que Samaritano se active y les convierta en sus primeros objetivos. Mientras tanto, el enfrentamiento que ha durado meses contra el grupo terrorista Vigilancia llega a una impactante conclusión.