マイアミ沖で嵐の海から救助されたキューバ人夫婦エステバンとマリーナ。二人はマリーナの原因不明の病気をハウスに診断してもらうために、命がけでアメリカにやって来たのだ。だが、医療記録が海に流されたため、診断は難航を極める。チームのそれぞれが違う病気を疑うが、マリーナの病状は悪化していくばかり。そんな中、ハウスはチェイスに突然クビを言い渡す一方で、ついに本音を口にしてフォアマンを引き留めようとするが･･･。

バミューダで家族でスキューバダイビングをしている最中に、200年前に沈没した奴隷船から見つけた瓶を割って手を切った少女ジュリーは高熱や嘔吐などの症状で病院へ。絶滅したはずの天然痘だと考えられ、家族４人は隔離室に入れられる。天然痘の検査は陰性と判明するが、間接液を採取中に天然痘特有の白い発疹ができており疾病予防管理センター（CDC）に連絡する。CDCにより病院は封鎖され、責任者とハウスは意見が対立。そんな中、ジュリーの父親も倒れてしまう。