En 2011, après avoir été porté disparu pendant huit ans en Irak, Nicholas Brody, un soldat américain, est délivré presque par hasard par un commandos de Marines. Le gouvernement veut en faire un héros national lors de son retour au pays. Mais Carrie Mathison, une agent de la CIA, qui a eu accès quelques mois auparavant à des informations sensibles, pense que cet homme a changé de camp et qu'il est en réalité chargé d'infiltrer le sol américain pour le compte d'Al-Qaïda. Elle décide, avec le soutien de Saul Berenson, son mentor à la CIA, de le surveiller. Pour mener à bien sa mission, elle fait installer des caméras et des micros au domicile des Brody...

Si Nicholas Brody est de retour chez lui, il a cependant bien du mal à oublier ce qu'il a enduré au cours de sa captivité. Il fait des cauchemars au cours desquels il parle en arabe et agrippe le bras de Jessica au point de lui laisser des bleus. Harcelé par la presse, Brody se réfugie dans sa chambre qu'il ne quitte pas de la journée. Le lendemain, il agresse un journaliste qui s'est introduit dans son jardin. Alors qu'elle continue à le surveiller, Carrie est contactée par Lynne Reed, une informatrice qui détient des renseignements de la plus haute importance. En effet, elle a filmé une rencontre entre Abu Nazir et un prince saoudien...

Lynne Reed, maîtresse du prince saoudien Farid, prend tous les risques pour accéder aux informations que convoite Carrie. Elle exprime néanmoins des doutes quant aux liens que son amant entretiendrait avec des terroristes. De son côté, toute la famille Brody se prépare pour une interview tournée dans leur salon. Le moins que l'on puisse dire est que Dana ne se montre pas très enthousiaste et qu'elle ne s'en cache pas. Son père a une discussion avec elle, puis l'adolescente révèle à sa mère qu'elle est au courant de la liaison que celle-ci entretenait avec Mike...

Brody est devenu une figure populaire dans le quartier, mais ses rapports avec son entourage sont de plus en plus complexes. Il laisse sous-entendre à sa femme Jessica et à son meilleur ami qu'il est au courant de leur relation. Par ailleurs, le mandat qui autorisait la surveillance du domicile des Brody arrive déjà à expiration. Carrie souhaite vivement que Saul le prolonge. Cependant, son mentor lui conseille de se consacrer plutôt à la piste financière, qui lui paraît prometteuse. A la recherche d'hommes à la solde d'Abu Nazir, l'équipe a beaucoup de travail en perspective. En effet, une cinquantaine de personnes fait partie des suspects...

Afsal Hamid, le seul survivant des ravisseurs de Brody, a été capturé et extradé. Estes souhaiterait que le sergent apporte son aide à Carrie et Saul pour l'interrogatoire de son ancien geôlier. Carrie craint que Brody n'en apprenne de trop sur la stratégie de la CIA mais n'ose pas révéler ses soupçons à son supérieur. Elle décide néanmoins de le surveiller de près. De son côté, Saul a à peine eu le temps d'accueillir sa femme Mira, de retour après un séjour dans sa famille en Inde, qu'il doit déjà la délaisser...

Carrie a l'intention de faire passer un test de polygraphe à Brody. Elle est persuadée qu'il s'agit de l'unique moyen qui lui permettra de le confondre. Pendant ce temps, la traque de Raqim Faisel et de sa complice Aileen s'intensifie. Les investigations menées s'avèrent payantes et les premières pistes convaincantes se dessinent. Parallèlement, la relation entre le sergent Brody et Carrie devient de plus en plus tendres. Carrie est elle-même décontenancée de l'empathie dont le jeune homme sait parfois faire preuve. Tous deux se rapprochent insensiblement. L'enquête ne risque-t-elle pas d'en pâtir ? Brody est-il sincère ou la manipule-t-il ?...

Carrie et Brody passent le week-end ensemble dans un chalet isolé et deviennent amants. Mais les suspicions de Carrie sont toujours présentes. De son côté, Saul intercepte Aileen au Mexique et tente de lui soutirer des informations sur sa mission...

Contrairement à ce que tous pensaient, Thomas Walker est en vie et de retour à Washington. La CIA découvre qu'il téléphone régulièrement chez lui juste pour écouter la voix de sa femme et de son fils sur le répondeur. Carrie et Saul comptent utiliser cette faille pour parvenir à localiser le tireur d'élite. Helen Walker accepte de leur venir en aide. Par ailleurs, Elizabeth Gaines invite les Brody à une soirée prestigieuse. Elle nourrit pour le sergent de grands projets politiques. Quant à Mira, elle se prépare à partir pour l'Inde, au grand dam de Saul...

Après la mort des deux innocents abattus accidentellement par le FBI au sein d'une mosquée, Carrie tente d'apaiser les tensions. Elle est persuadée que l'imam sait quelque chose à propos de Tom Walker, mais il refuse de parler tant que le FBI n'a pas reconnu son erreur. Après avoir décidé de rompre tout contact avec Abu Nazir, le sergent Brody est agressé par deux hommes qui l'enlèvent. Au cours de sa captivité, il se rappelle sa précédente détention en Irak...

Carrie et Saul ont enquêté sur le diplomate saoudien Mansour Al Sahrani, soupçonné d'être en relation avec Tom Walker. Ils parviennent à l'interroger et menacent de révéler ses secrets s'il refuse de collaborer avec eux. Par ailleurs, le vice-président Walden rend visite à Brody chez lui pour lui proposer une place au Congrès, laissée vacante par un élu pris dans un scandale. Le Marine est flatté mais suspend sa réponse à l'accord de sa femme. Lorsque Brody en parle à Jessica, celle-ci n'est vraiment pas enthousiaste et s'oppose à cette idée. Elle craint que leur famille fasse à nouveau les frais de la fureur médiatique...

Saul se rend à l'hôpital pour récupérer Carrie, qui a eu besoin d'une semaine de repos pour se remettre de ses blessures. Sur place, il est surpris de découvrir sa collègue très agitée, tenant des propos confus. Amy, la soeur de Carrie, explique que cette dernière souffre de bipolarité. Saul accepte de rester auprès de Carrie pour veiller sur elle. Avant d'entamer sa campagne pour l'élection au Congrès, Brody souhaite emmener sa famille à Gettysburg, lieu emblématique de la guerre de Sécession. Dana accepte à contrecoeur de suivre les siens pour ce week-end. Mais elle ne peut s'empêcher de trouver le comportement de son père étrange...

Depuis son renvoi, Carrie est en pleine dépression et ne quitte pas sa chambre. Elle ne parvient pas à comprendre pourquoi Brody l'a trahie. Pendant ce temps, Saul continue d'enquêter, contre l'avis d'Estes, sur l'hypothèse de sa protégée et découvre des éléments qu'on a visiblement voulu faire disparaître. Tandis que Tom Walker s'introduit dans un quartier très surveillé, Brody est surpris par sa fille Dana en pleine prière. Il lui explique qu'il s'est converti au cours de sa détention et lui demande de garder le secret...

Des mois après les événements qui ont conduit Carrie à subir un traitement par électrochocs, elle retrouve un peu de sérénité dans la chaleureuse maison de sa sœur.

Contre l'avis de sa famille, Carrie s'embarque dans une opération qui pourrait débarrasser le monde d'Abu Nazir une bonne fois pour toutes.

À peine rentrée de ses aventures à Beyrouth, Carrie se prépare fébrilement à ce qu'elle espère être un retour triomphal à la CIA.

Estes se laisse convaincre par Saul et autorise une opération secrète pour exploiter les infos de Beyrouth, à la tête de laquelle il place un homme de confiance.

Brody est de nouveau captif, cette fois-ci sur le sol américain. Quant à Carrie, elle est reléguée au second plan à cause d'une décision irréfléchie.

Dana se rend à l'hôpital et est choquée de ce qu'elle y voit. Brody accepte de travailler avec Carrie et Quinn pour prévenir une attaque sur l'Amérique.

Se remettant à peine de l'embuscade, Carrie et l'équipe font tout pour reprendre le contrôle des opérations. Brody et sa famille sont invités à un gala de charité.

Il ment pour Carrie. Il ment pour Roya. Et il ment toujours à Jessica. Brody est à deux doigts de craquer tandis qu'il s'efforce de tenir des promesses contradictoires.

La situation se corse pour Brody qui est contraint de passer un appel qu'il voulait à tout prix éviter. Carrie se prépare à un rendez-vous de première importance.

Les relations de Brody et de Walden se tendent et pourraient peser sur l'avenir. Carrie fait la désagréable découverte qu'on ne l'informe pas de tout.

Carrie continue à traquer Nazir, mais elle sent bien que quelque chose ne va pas à l'agence. Un interrogatoire révèle ce que Roya a vraiment dans le ventre.

Au cours du dernier épisode de la saison 2, Carrie doit prendre une décision cruciale, tandis que Brody rencontre Faber pour évoquer l'avenir de sa famille.

Près de trois mois après l'attentat de Langley, le terroriste présumé Nick Brody est toujours en fuite. Carrie doit témoigner pour les besoins de l'enquête.

Saul est en chasse contre les auteurs de l'attaque de Langley. Il recrute un expert improbable pour suivre la piste de l'argent.

Brody est dans une situation désespérée. Il trouve du réconfort en se réfugiant dans la prière et renoue ainsi avec l'Islam.

Carrie se rend compte que même si elle est affaiblie, la CIA a toujours une certaine influence. Jessica appelle à l'aide pour retrouver Dana.

Un homme mystérieux entre sur le territoire des États-Unis au niveau de la frontière canadienne. Carrie met sa mission en danger pour venir en aide à Jessica Brody.

Carrie inverse les rôles pour le responsable de l'attaque de Langley. Mais le fait de recruter l'un des hommes les plus puissants d'Iran peut s'avérer risqué.

Saul s'apprête à faire le pari le plus risqué de sa carrière. Quant à Carrie et Quinn, ils s'efforcent de faire classer une affaire menée par la police locale.

Après de nouvelles révélations, Carrie et Quinn traquent un suspect clé dans l'affaire de Langley. Pendant ce temps, la famille Brody apprend une nouvelle étonnante.

Carrie et Brody sont réunis, mais dans des circonstances qu'ils n'auraient jamais imaginées. Pendant ce temps, Saul avance dans son plan grâce à une source improbable.

L'opération d'infiltration de Brody commence, mais son état fragile menace le bon déroulement des événements. Quinn fait une découverte troublante à propos de Carrie.

Carrie arrive à Téhéran pour les besoins de la mission, mais le comportement de Brody change soudain lorsqu'une personne ressurgit de son passé.

Carrie et Brody sont dans une situation délicate. Alors que Saul met en place un plan d'évacuation d'urgence, Brody cherche à se racheter.

Lockhart vient négocier, Haqqani se sert de Saul comme bouclier et l'enquête de Carrie se complique, surtout lorsque quelqu'un remplace ses pilules.