粉々に砕け、もはや「球」ではなくなった地球を見て呆然とするメイとシモンズ。そしてコールソンから自分たちが未来に来ていると知らされる。一方、人間たちのフロアではクリーのリーダー、カサイアスの召し使いがナイフを振り回す男に刺されてしまう。思わず止血処置をしたシモンズの技術が看守の目に留まる。人間たちのストレスが高まっていると感じ取ったカサイアスは「リニューアル」という殺人イベントを開催し……。

カサイアスの召し使いになったシモンズは、耳に付けられた装置によって聴力を操作されていた。ある日、彼女は18歳の少女アビーの治療を命じられる。インヒューマンズになったばかりのアビーはまだ能力をうまくコントロールすることができないが、家族のためにあるセレモニーで力を披露しないといけないという。一方、コールソンとマックはメイとテスのスクラップ回収業務を手伝うふりをして、崩壊した地球を偵察し……。

ディークによってカサイアスに売り渡されたデイジーはシモンズと再会。また、人の心を読むインヒューマンズのベンと知り合い、カサイアスがインヒューマンズをオークションで売りさばいていることを知る。一方、グリルは借金を返さないガンナーという男を痛めつけるようマックから命じられる。ガンナーが35階の技術フロアからの荷物を待っていると知ったコールソンは、その階で何が行なわれているのかを探り始め……。

カサイアス主催のインヒューマンズ・オークションのため、予定外のテリジェネシスが行なわれることになり、18歳未満の少年少女が集められる。中にはテスがかわいがっている孤児のフリントもいた。インヒューマンズの将来をふびんに思ったエレナは彼をかくまうが、フリントはカサイアスの所へ行けばいい暮らしができると信じていた。また、フィッツは仲間たちを救うために「大金持ちと略奪者」としてオークションに乗り込み……。

デイジー、フィッツ、シモンズはカサイアスのもとから逃げ出すが、フィッツの用意していた逃亡用の宇宙船が爆破されてしまう。カサイアスの兄フォールナクによって、クェイクの捜索が開始される。そんな中、フリントは自分が逃げているせいで罪もない人々が殺されていることに悩んでいた。皆を助けるために力を使うようマックに諭されるものの、隙を見てシールドから離れ、テスを殺したクリー兵士に復讐しようとするが……。

2018年、世界の終末が近づき、未来に連れ去られたはずのシールドはライトハウスに向かっていたが、到着前に重力嵐に襲われる。そして2091年。フィッツとシモンズはタイムマシンらしき装置を発見。ディークの父の友人ヴォスが持つモノリスのカケラをはめると何かが起きるらしい。カケラをもっと集めれば元の時代に帰れるかもしれないと色めき立つコールソンたち。しかし、ディークはヴォスに不信感を抱き……。

フィッツとシモンズは未来のゼファー・ワンが電気を必要とせず、グラヴィトニウムによって動く仕組みになっていると知った。グラヴィトニウムが現実にあるということは地球の崩壊も現実だと悲観するフィッツに対し、シモンズは過去へ戻れるという事実に希望を託す。一方、ライトハウスに残ったマックたちはカサイアスのヴレルネクシアン攻めを乗り切るが、彼らの前に死んだはずのテスがカサイアスからの伝言を持って現われ……。

イノックひとりをゼファー・ワンに残し、コールソンたちはひそかにライトハウスに戻る。テスと同じように生き返らされたインヒューマンズが捕らえられていると知り、エレナが救出に向かうと、そこにいたのはもうひとりの自分だった。一方、すべてを失ったカサイアスはオディアムを飲み干し狂犬と化し、マックと死闘を繰り広げる。ゼファー・ワンで時空の扉の準備をしていたイノックは、クリー兵に襲われそうになるが……。