1388년. 요동정벌을 나섰던 이성계는 회군을 결정하고, 이에 분개한 우왕은 이성계의 가족들을 모두 잡아들일 것을 명한다. 무장들의 추적을 가까스로 따돌린 이방원은 가족들을 구하기 위해 포천으로 향하는데...

격렬한 전투 끝에 궁궐이 함락되지만, 역도가 될 수 없었던 이성계는 궁궐을 점령하지 않고 밖에서 군사들을 대기시킨다. 그러나 패배를 인정하지 못한 우왕은 은밀히 기습을 준비하는데...

이성계의 저택 안에 자객이 잠입했다는 소식을 들은 이방원은 황급히 아버지의 집으로 향한다. 다행히도 무사한 이성계를 발견하고 다가가려는 순간, 칼을 꺼내든 자객들이 이성계와 이방원에게 달려드는데...

아버지 이성계가 공양왕에게 망신당한 것을 참을 수 없었던 이방원은 공양왕을 찾아가 날카로운 경고를 전한다. 겁을 먹은 공양왕은 우왕과 창왕을 참하라는 명령을 내리고, 당황한 이성계는 명을 거둬달라 간곡히 청하는데...

모든 것을 포기하고 동북면으로 돌아가는 이성계를 설득하는 데 실패한 이방원은 좌절감에 빠진다. 한편, 이성계와 함께 동북면으로 향하던 조영무는 이대로 귀향한다면 환영받지 못할 것이니 개성으로 돌아가 왕이 되어달라 이성계에게 청하고, 그는 깊은 고민에 빠지는데...

앞다투어 청주옥으로 향하던 정도전과 정몽주는 청주성으로 들어가는 길이 모두 끊길 정도의 폭우로 인해 발이 묶인다. 비가 계속 내려 청주성이 물에 잠긴다면 옥에 갇힌 정몽주 일파 모두가 목숨을 잃게 되는 상황. 정도전과 정몽주는 하염없이 내리는 비를 바라보며 운명의 심판을 기다리는데...

사냥 도중 낙마하는 사고를 당한 이성계. 정몽주는 이 틈을 타 이성계 일파를 모두 유배시킨다. 사면초가의 위기 앞에서 별다른 해결책을 찾지 못한 채 발만 동동 구르는 이성계의 가족들. 이 때, 강 씨는 한 씨의 시묘살이를 하던 이방원을 불러들이는데...

정몽주를 제거하기로 결심한 이방원은 무장들을 이끌고 정몽주를 찾아 나선다. 한편, 공양왕을 설득하는데 실패한 정몽주는 마지막 담판을 짓기 위해 제 발로 이성계의 집으로 향하는데...

정도전과 대신들의 간곡한 청을 받아들이고 마침내 왕좌에 오르는 이성계. 그 소식에 이방원과 형제들은 기쁜 마음으로 궁궐로 향하지만, 형제들을 들이지 말라는 명을 받은 내관과 숙위병들이 그들의 앞을 가로막는데...

이복동생 이방석이 세자가 되었다는 소식을 듣게 된 이방원은 형제들을 찾아가 함께 항변이라도 해볼 것을 청한다. 그러나 형제들은 어쩔 수 없는 일이라며 함께할 것을 거절하고, 이에 이방원은 홀로 이성계의 저택으로 향하는데

사냥 도중 낙마하는 사고를 당한 이성계. 정몽주는 이 틈을 타 이성계 일파를 모두 유배시킨다. 사면초가의 위기 앞에서 별다른 해결책을 찾지 못한 채 발만 동동 구르는 이성계의 가족들. 이 때, 강씨는 한씨의 시묘살이를 하던 이방원을 불러들이는데

이성계의 어명을 받들고 명나라로 향하는 이방원. 조선의 앞날과 자신의 운명이 걸린 황제와의 만남을 앞두고 결의를 다진다. 한편, 이방원이 떠난 뒤에도 여전히 긴장을 늦추지 않던 강씨는 갑작스레 건강에 이상을 느끼고, 어의로부터 충격적인 소식을 듣게 되는데

계속해서 줄어드는 입지에 거사를 도모해야 할 시기가 다가옴을 느끼는 이방원. 그러나 많은 사람들이 희생되는 일임을 알기에 쉽게 결단을 내리지 못한다. 그때, 이방원을 불러들인 이성계는 언젠가는 이방원이 세자를 해칠 거라며 분노하고, 마침내 그를 향해 칼을 뽑아드는데...

본격적으로 거사를 준비하기 시작한 이방원은 인적 드문 숲속에서 군사들을 훈련시킨다. 한편, 신덕왕후의 명복을 빌기 위해 절로 향하던 이성계는 숲길을 지나다 훈련 중인 이방원과 군사들을 발견하고, 분노한 얼굴로 이방원에게 다가가는데...

사병을 혁파해 모은 군사들로 요동정벌을 나서겠다 선포하는 이성계. 조준을 비롯한 신하들이 간곡히 만류하지만 이성계는 뜻을 굽히지 않는다. 한편, 답답한 시간을 보내던 이방원에게 신덕왕후의 능을 보수한다는 핑계로 수십 명의 군사를 대동한 이숙번이 나타나고, 이방원은 회심의 미소를 지으며 거사를 향한 불꽃을 되살리기 시작하는데...

궁궐을 점령하는 데 성공한 이방원과 그의 세력들은 반대파들에 대한 숙청을 시작하고, 한양에는 거센 피바람이 몰아친다. 한편, 거사에 일조하겠다고 나선 이방간은 이방원의 의사와는 상관없이 독단적인 행동을 거듭하고, 결국 인내심을 잃은 이방원은 형 이방간에게 섬뜩한 경고를 전하는데...

결국 이방원 세력들의 바람대로 이방과를 세자로 세우는 이성계. 하루아침에 모든 것을 잃은 이성계는 언젠가는 모든 고통이 너에게 돌아갈 것이라며 이방원에게 날 선 경고를 전한다. 그리고는 세자가 된 이방과에게 이방원에게 벌을 내려 자신의 원한을 씻어달라며 간절하게 부탁하는데...

이방과에게 왕위를 물려주기로 결정하는 이성계. 그렇게 이방과가 조선의 두 번째 왕으로 즉위하면서 이방원과 이방과의 권력을 향한 쟁탈전이 더욱 치열해진다. 한편, 용상에 대한 욕망을 키워가던 이방간은 이방원에 대한 공격을 본격적으로 준비하기 시작하고, 또 한차례의 핏빛 전투가 예고되는데...

이방간의 공격을 제압한 뒤 곧바로 궁궐로 향한 이방원은 자신을 가로막는 이들을 모두 제거하고 용상에 앉고 말겠다며 이방과에게 칼을 꺼내 든다. 이에 이방과는 용상이 결국 가문을 갈가리 찢어 놓고 말았다며 통탄하는데...

Bang Won's plan to abolish private armies meets strong opposition from his court officials. He soon realizes that he cannot proceed with his plans without the support of the Min clan. However, Bang Won and Lady Min's discord continues to worsen as they struggle to see eye-to-eye on Lady Min's position in the future.

Bang Won finally ascends to the throne and becomes the third king of Joseon. However, his wife, Lady Min is not even allowed to set foot in the palace. Lady Min becomes upset at how she is being treated and decides to enter the palace without Bang Won's permission. Bang Won's anger at her disobedience continues to grow.

The King tries to weaken the power of the Min Clan by taking away all of Queen Wongyeong's court ladies and also by bringing in Min Je for questioning. Meanwhile, Seong Gye and those who follow him do not stay still. They gather armies from Dongbukmyeon and Seobukmyeon to revolt against Bang Won. Despite being king, Bang Won still has many challenges to face.

The Former King Taejo aggressively gathers his army with Jo Sa Eui as the commander. Although Bang Won couldn't believe it at first, he quickly realizes the danger and assembles his army. Bang Won and Bang Gwa swore to never spill the blood of their family again. However, they both know that their father will not stop until he gets Bang Won's head. Now, the grand war that will decide the true king of Joseon begins.

Once again Bang Won achieves victory against his father. Bang Won spares his father's life under the judgment that Jo Sa Eui is the only cause of the rebellion. No matter how many times he defeats his father, Bang Won is never at peace. Meanwhile, rumors start in the Captial that a child of the King is born and is left somewhere to die. Furious with this news, Bang Won sets off to find his mysterious child.

Bang Won decides that the Min Clan is not to be trusted. He comes up with a plan that will educate the Crown Prince as the future king and check the loyalty of the Min Clan at the same time. However, although he manages to achieve one thing, he did not expect the other to end up so differently than he expected.

The Crown Prince becomes rebellious against Bang Won as he gets forced to study. Although Bang Won is furious about the Prince not obeying him, he also realizes how Seong Gye must have felt. Meanwhile, the power of the Min Clan steadily weakens. As Mu Ku and Mu Jil are in danger of facing the death penalty, the Queen tries her best to prevent it from happening. The growth of a new generation brings an unsure future to the Palace.

The Queen's heart shatters into pieces as the Crown Prince betrays her. With his consent, Mu Ku and Mu Jil are indeed to die. Disputes occur regarding the Min brothers' innocence, but Bang Won punishes everyone who defies him. Meanwhile, Lee Je now seems to be ready to become King. However, Grand Prince Chungnyeong disagrees with it.

The Crown Prince is quickly losing his father's trust. Although he has already let Bang Won down several times, he only brings even more disappointment. Prince Chungnyeong sees this as an opportunity. For the purpose of serving the people well and making the country prosper, he grows his ambition to become King. Meanwhile, the power of the Min Clan drops further down as the Queen gets betrayed by the person she has shown mercy to.

The King allows the Crown Prince to return to the Palace. But what awaits him is only Chungnyeong making attempts to take his place. In this competition between the two brothers, the Queen is deeply worried that either one of her sons might get hurt. Meanwhile, one of Bang Won's loyal subjects becomes exiled for ruthless behavior.

Bang Won discrowns Lee Je and installs Lee Do as the new Crown Prince. As Lee Je leaves the palace, Queen Wongyeong also decides to leave because she cannot bear to be with Bang Won anymore. Shortly after, Bang Won abdicates the throne to Lee Do. Although Bang Won believes Lee Do will become a good king, he still wishes to control Lee Do in some ways whereas Lee Do fights against his father's control.

Lee Do shows aggression toward Bang Won to be free from his control. Despite his effort, Bang Won's power is still too great, and eventually fails to save his father-in-law, Shim On. However, Lee Do grows to become a successful king as time passes. With this in mind, Bang Won and Lady Min rest deeply in peace.