Goku y Bulma se acercan a la Bola de Dragón que busca el General Blue. Esta se encuentra en el fondo del océano, por lo que deciden ir a una isla cercana. El joven deja a Bulma en la isla y va a bucear en busca de la Bola de Dragón, pero no logra llegar al fondo y vuelve. Mientras tanto la joven comienza a explorar la isla y se encuentra con dos soldados del ejército Red Ribbon que la atacan pensando que es Son Goku. Bulma intenta huir en busca de Goku y cuando lo encuentra el joven vence fácilmente a los soldados. Sabiendo que no pueden llegar nadando al fondo del océano y no tienen un submarino, deciden ir en busca de Kame Sen'nin para pedirle ayuda.

Goku y Bulma llegan a Kame House en busca del anciano maestro Kame Sen'nin, quien decide prestarles un submarino capaz de volar a cambio del Micro Band para encoger de tamaño, pero deben esperar a que Lunch y Krilin vuelvan de hacer compras con el vehículo. Mientras tanto, el ejército ve en el radar la ubicación de la isla del anciano y supone que esa es la base de los aliados de Goku por lo que ordenan a Blue investigar la isla. Mientras que uno de los soldados de Blue va a inspeccionar la zona, Goku, Bulma y Krilin parten en busca de la Bola de Dragón y, si tienen suerte, encontrar Tesoro del Pirata del que les habla el Maestro.

Goku y sus compañeros llegan al punto que indica el radar y se sumergen en el mar, pero son vistos por el General Blue, quien al recibir la orden del Cuartel General de atacar la Kame House envía al Capitán Doc con la mitad de la brigada, mientras que Blue decide ir detrás del joven con la otra mitad. Krilin conduce el submarino hasta el fondo del océano y Goku sale del mismo a investigar, pero no encuentran la Bola de Dragón. Descubren entonces la entrada a una gruta donde podría estar oculta la Bola, momento justo en que son atacados por el submarino del ejército Red Ribbon.

Goku y compañía prosiguen su camino a través de la gruta submarina escapando por los pelos del General Blue. La otra parte de la brigada azul ataca la Kame House, pero son vencidos fácilmente por el anciano maestro y Lunch. Goku, Bulma y Krilin acaban llegando a una parte con aire dentro de la gruta, se adentran dentro de la cueva y Goku encuentra un interruptor que enciende un alumbrado eléctrico indicando que alguien ya había estado ahí antes. Más tarde encuentran un esqueleto de un pirata, que les hace llegar a la conclusión de que se encuentran dentro de una base pirata y donde puede estar escondido su tesoro.

Adentrándose en la cueva Goku y sus compañeros, al igual que los oficiales del ejército del General Blue, se encuentran varias trampas, entre ellas un pasillo lleno de botones que hacen disparar lanzas de lado a lado, una fosa con lava y una fosa con anguilas eléctricas. Los soldados del General Blue caen en la trampa de las lanzas acabando con todos ellos. Los Héroes y Blue llegan a salvo por diferentes caminos a un gran puerto subterráneo de los piratas. Sin embargo, éste resulta no estar abandonado y Bulma y los demás son atacados por un Robot-Pirata que hace guardia entre las sombras.

Goku y Krilín se enfrentan al robot guardián, pero tienen muchas dificultades para acabar con él: Ni el cañón de un barco ni arrollarlo con un camión parecen poder derrotarle, así que todos comienzan a huir. No es hasta que Goku, desde lo alto de un edificio, cuando le destruye la cabeza de un fuerte puñetazo en caída libre. Mientras el muchacho se enfrenta al robot, Bulma y Krilin se adelantan seguidos de cerca por el General Blue. El General cambia una señal que le dejan sus amigos a Goku y ésta envía al joven en la dirección equivocada. Bulma y Krilín llegan a un túnel lleno de agua y continúan su camino buceando, seguidos con perseverancia por Blue.

Goku continua por otro camino por el engaño de Blue hasta llegar a una pared, donde cae en una trampa que lo envía con un pulpo gigante que intenta comérselo, pero termina cocinado por un Kame Hame Ha. Por su lado Bulma y Krilin atraviesan un túnel acuático para escapar y llegan al lugar del tesoro pero son atacados por un sistema de seguridad, Krilin logra desactivarlo y encuentran una llave dentro de un cofre y logran usarla para encontrar el tesoro; pero en ese momento aparece Blue, quien los estaba siguiendo. Krilin empieza a pelear con el y Goku los escucha, pero no logra llegar antes de que Krilin sea vencido debido a los poderes del general, y apenas logra salvarle de su muerte.

Blue y Goku se enfrentan, el general está siendo vencido hasta que utiliza su habilidad especial y paraliza al joven. Cuando el techo comienza a desplomarse Blue amenaza a Goku con un arma y hace que Bulma le diga la ubicación de la Bola de Dragón, pero justo cuando iba a deshacerse de Goku es asustado por una rata, y Goku se libera de la parálisis y vence al general. Goku y sus amigos tratan de escapar de la cueva que se está derrumbando, no sin antes encontrar la Bola de Dragón; y aunque el pasillo por donde entraron está cerrado encuentran un mini-submarino pirata.

Goku llega justo a tiempo donde sus compañeros aguardan en el mini-submarino, pero después de una breve travesía, el vehículo se queda sin combustible. Goku utiliza entonces un Kame Hame Ha para impulsarlos hasta la superficie del océano. Usando la nube Kinton, todos llegan una isla cercana, pero tras ellos resurge Blue que ha logrado escapar sano y salvo. La isla a la que llegan es la base de Blue y ahí se llevan una nave del ejército hasta la isla del maestro Kame Sen'nin. Lunch, en su forma violenta, huye robando un diamante que Bulma había logrado recuperar de los Piratas. Justo después, Blue logra llegar a Kame House y se dispone a robarles las Bolas de Dragón.

Blue logra paralizar y atrapar a Goku y sus amigos y huye con las tres Bolas de Dragón, dejándoles una bomba que estallará en 5 minutos. Lunch, en su forma inofensiva, vuelve justo a tiempo para salvarlos de la bomba. Goku liberado sale de inmediato persiguiendo al General Blue en la nube Kinton. Tratando de huir de Goku, el avión del General Blue llega a Villa Pingüino y se estrella contra una montaña. El joven por su lado, aterriza en la aldea y conoce a Arale.

Goku se marcha en la nube voladora a buscar al general, pero es seguido por las tres niñas, con quienes entabla amistad. Blue escapa antes de que Goku llegue al lugar donde cayó el avión y se encuentra con varios de los peculiares habitantes de Villa Pingüino, buscando a Senbei Norimaki para conseguir un avión. Después de un largo rato buscando, a Goku se le ocurre usar el Radar para encontrar al general, pero esta de nuevo estropeado. Arale lo lleva con el Dr. Norimaki para repararlo.

Turbo arregla el Dragon Radar sin que su padre Senbei se de cuenta. Ya con el radar, Goku se da cuenta de hay una Bola de Dragón cerca y comienza a seguir al General Blue sin saberlo. Cuando lo encuentran, Blue toma a Arale como rehén pero su plan falla. Aun así, arrebata el Dragon Radar a Goku gracias a su poder paralizador e intenta asesinarlo hasta que es salvado por Arale, quien envía a Blue volando realmente lejos. Goku recupera las tres Bolas de Dragón pero Blue tenía el radar cuando salió despedido. Turbo crea una copia exacta del Dragon Radar para Goku, quien continua su viaje en busca de la cuarta bola.