Son Goku et Bulma se dirige vers le camp du Commandant Blue, un autre commandant de l'armée du Red Ribon. Ils sont à la recherche d'une Dragon Ball se trouvant au fond de la mer. Tandis que Son Goku plonge dans la mer par ses propres moyens, Bulma se fait attaquer par deux soldats du Red Ribon. Son Goku, revenant à temps, les met hors d'état de nuire. Ils décident d'aller voir Kamé Sennin, habitant pas trop loin d'ici, afin qu'il leur prête son sous-marin.

Son Goku et Bulma trouvent rapidement la maison de Kamé Sennin et lui demandent de leur prêter un sous-marin. Celui-ci accepte en échange du bracelet de Bulma permettant de rétrécir. Ils doivent cependant attendre le retour de Krilin et Lunch qui sont partis faire des courses avec le sous-marin qui sert aussi d'avion. Pendant ce temps l'armée du Red Ribon demande au Commandant Blue de faire un repérage sur l'île de Kamé Sennin pensant qu'il s’agit du QG de Son Goku et ses complices. Au retour de Krilin et Lunch, Kamé Sennin explique la présence d'un trésor dans l'océan et autorise Krilin à aller avec Son Goku et Bulma à sa recherche. A peine partis, Bulma réalise qu'elle a laissé les 2 Dragon Balls sur l'île de Kamé Sennin mais les 3 amis ne s'en inquiètent pas. Ils ne remarquent pas la présence d'un hélicoptère appartenant à l'armée du Red Ribon et se dirigeant vers la Kamé House.

Alors que Son Goku, Bulma et Krilin recherchent la Dragon Ball cachée au fond de l'océan, le Général Blue passe à l'attaque. Il ordonne à son armée de détruire l'île de Kamé Sennin et de lui voler les deux Dragon Balls en sa possession. Son Goku, Bulma et Krilin finissent par trouver une grotte ou se trouve la Dragon Ball, mais le Général Blue arrive à ce moment-là et les poursuit dans la grotte à bord d'un énorme sous-marin équipé de torpilles.

En essayant d'échapper à l'armée du Red Ribbon, Son Goku, Bulma et Krilin découvrent une sortie à l'air libre à l'intérieur de la grotte et s'enfuient à pied. Pendant ce temps, sur l’île de Kamé Sennin, l'offensive prévue par le Général Blue ne se passe pas comme prévu. En effet, le maître des arts martiaux Kamé Sennin ne se laisse pas faire et massacre ses hommes. Dans la grotte, les trois amis se rendent comptent qu'ils sont pile à l'endroit où se trouve le trésor dont Kamé Sennin leur avait parlé. Ils ne se rendent pas comptent qu'un homme du Général Blue les écoute.

Pendant que Son Goku, Bulma et Krilin avancent dans la grotte, le Général Red et le Colonel Black sont mis au courant de la situation au QG de l'armée du Red Ribbon, alors qu'on est en train de peindre un portrait du général. On découvre d'ailleurs qu'il est de toute petite taille ce qui semble être un complexe chez lui. Dans la grotte, les trois héros arrivent à un premier piège que Son Goku et Krilin déjouent facilement grâce à leur entrainement chez Kamé Sennin. Bulma s'en sort grâce au Nyoï Bo tandis que le Commandant Blue découvre une porte dérobée lui permettant d'éviter le piège alors que son équipe est tombée en plein dedans. Pendant que Blue affronte une anguille envoyant du courant, les trois héros, après avoir évité de justesse de tomber dans de la lave, découvre le port des pirates où les attendent un robot qu'ils vont devoir affronter sous les yeux de Blue caché plus loin.

Le combat contre le robot pirate démarre sous les yeux de Blue qui commence à comprendre que Son Goku et Krilin ne sont pas des enfants ordinaires et qu'ils maîtrisent les arts martiaux. Pendant que Son Goku occupe le robot, Krilin et Bulma utilisent un canon pour tenter d'éliminer leur adversaire sans succès, cela entraînant même des dégâts dans la structure de la grotte.

Pendant que Son Goku affronte un poulpe, Krilin, Bulma et Blue arrivent dans la pièce contenant le trésor des pirates. La grotte, quant à elle, semble sur le point de s'effondrer. Après un court affrontement contre une statue défendant l'accès au trésor, Krilin et Bulma découvrent une clé à l'intérieur d'un coffre qui leur permet d'actionner un mécanisme remplissant les coffres de pièces d'or et bijoux en tout genre. C'est à ce moment que le Commandant Blue fait irruption et qu'un combat entre Krilin et lui débute. Blue semble supérieur mais Krilin finit néanmoins par réussir à le toucher, ce qui énerve considérablement Blue qui utilise alors ses pouvoirs psychiques qui paralysent Krilin. Alors que Blue s’apprête à achever Krilin, Son Goku, qui a éliminé le poulpe d'un Kamé Hamé Ha, surgit et prend le relais de son partenaire d'entrainement tandis que la grotte semble de plus en plus proche de son effondrement.

Le duel entre Son Goku et le Commandant Blue a enfin lieu. Mais très vite, l'élève de Kamé Sennin prend le dessus. Krilin constate que Son Goku a progressé depuis le Tenkaichi Budokai. Dominé, Blue utilise alors ses pouvoirs psychiques et prend l'avantage. Alors qu'il s’apprête à exécuter Son Goku, une souris surgit et fait perdre à Blue son contrôle sur Son Goku et ce dernier en profite pour reprendre définitivement l'avantage. Alors que la grotte s'effondre, Bulma et Krilin tentent de la quitter pendant que Son Goku part chercher la Dragon Ball. Après l'avoir trouvé, il récupère également la souris pour lui rendre la monnaie de sa pièce. Bulma et Krilin ont eux trouvé un sous-marin pirate pour s'enfuir de la grotte.

Alors que Bulma et Krilin se sont sur le point de partir, Son Goku surgit et les rejoint dans le sous-marin pirate. Ils sont rapidement bloqués par des morceaux de pierre qui tombent mais grâce à un Kamé Hamé Ha de Son Goku, ils réussissent à s'en sortir et retournent sur la terre ferme. Bulma a réussi à récupérer une grosse pierre précieuse qu'elle veut offrir à Kamé Sennin en dédommagement d'avoir perdu le sous-marin. Ils retournent sur l'île du maître de Son Goku et Krilin mais malheureusement Lunch éternue, vole la pierre et s'enfuit. De son côté, Blue s'en est également sorti. Il décide de se rendre sur l'île de Kamé Sennin pour récupérer la Dragon Ball et éliminer définitivement Son Goku et ses amis.

Afin de récupérer les Dragon Balls, Blue ensorcelle des cordes qui ligotent Son Goku et ses amis. Une fois en sa possession, il leur offre un cadeau qui va exploser dans cinq minutes. Alors que les minutes s'égrènent, Lunch redevenue gentil revient. Elle délivre Son Goku qui envoie la bombe exploser dans les cieux et se lance sans plus attendre à la poursuite de Blue. Il finit par le rattraper puis tous deux finissent par atterrir au village Pingouin dont les habitants sont des personnages issus de Dr Slump, l'un des premiers mangas de Akira Toriyama. Alors que la poursuite bat son plein, Blue réussit à semer Son Goku mais s'échoue dans une montagne. Son Goku, tombé de son nuage, se retrouve sur la terre ferme et fait la connaissance d'Aralé et de deux petits anges.

Après de rapides présentations avec Aralé et ses deux compagnons, Son Goku repart à la recherche de Blue et des Dragon Balls. Blue décide de fuir et de rentrer au quartier général du Red Ribon, se rendant compte que Son Goku est trop fort. Son Goku retrouve l'avion et comprend que Blue a dû fuir, lorsque Aralé surgit et propose son aide à Son Goku. Elle monte alors sur le nuage. Blue obtient lui des informations auprès d'un villageois pour savoir qui possède un avion au village Pingouin. Il s'y rend avec une voiture qu'il a volé mais celle-ci tombe en panne. Il est secouru par un enfant puis la police l’interpelle. Il les impressionne en détruisant son véhicule et récupère le leur. Peu après, l'un des agents indique à Son Goku vers où s'est rendu Blue. Il se lance alors à sa poursuite mais ne parvient pas à le rattraper. En effet, Blue s'est caché derrière un tas d'herbe. Alors que ce dernier s’apprête à reprendre la route, Aralé qui souhaitait rattraper Son Goku fonce sans faire exprès dans son véhicule et l'envoie à quelques kilomètres. Aralé retrouve alors Son Goku qui souhaite utiliser le Dragon Radar pour retrouver Blue. Malheureusement, il est encore en panne. Aralé lui suggère d'aller voir le professeur de village Pingouin qui pourra le réparer. C'est également lui qui possède l'avion que Blue convoite.

Alors que le professeur a des difficultés à réparer le Dragon Radar, son fils qui semble avoir des pouvoirs le répare en utilisant un sort. Son Goku allume alors le radar qui indique la présence de Dragon Balls tout proche de lui et de ses nouveaux amis. C'est en fait Blue qui cherche dans un premier temps à se cacher. Rapidement retrouvé, il prend Aralé en otage pour forcer Son Goku à capituler. Pourtant, le professeur et sa famille ne semble pas très inquiet lorsqu'ils voient Aralé menacée par Blue. Il paralyse alors Son Goku à l'aide de ses pouvoirs psychiques et récupère le Dragon Radar puis s'apprête à réquisitionner l'avion du professeur mais avant cela il doit finir sa mission : se débarrasser de Son Goku. Alors qu'il est sur le point de réaliser sa mission, Aralé, autorisée par le professeur à « jouer au catch avec le monsieur », l'expédie d'un coup de pied et de deux coups de boules à des centaines de mètres. Son Goku récupère alors les Dragon Balls que Blue avait déposé dans l'avion mais pas le Dragon Radar que Blue avait sur lui lors de son affrontement avec Aralé. Le fils du professeur lui en fabrique alors un en quelques secondes et Son Goku repart à la recherche des Dragon Balls en montant sur son nuage magique.